Protein–RNA interactions for Protein: Q8K0E8

Fgb, Fibrinogen beta chain, mousemouse

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Length 481 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FgbQ8K0E8 Serpinb2-201ENSMUST00000009356 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
FgbQ8K0E8 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
FgbQ8K0E8 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
FgbQ8K0E8 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
FgbQ8K0E8 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
FgbQ8K0E8 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
FgbQ8K0E8 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
FgbQ8K0E8 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
FgbQ8K0E8 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
FgbQ8K0E8 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
FgbQ8K0E8 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
FgbQ8K0E8 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
FgbQ8K0E8 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
FgbQ8K0E8 Psmd11-201ENSMUST00000017572 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
FgbQ8K0E8 Mutyh-201ENSMUST00000102699 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
FgbQ8K0E8 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
FgbQ8K0E8 Rab3a-203ENSMUST00000110092 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
FgbQ8K0E8 Olfr763-201ENSMUST00000077460 2523 ntAPPRIS P1 BASIC13.89□□□□□ -0.19
FgbQ8K0E8 Pacrg-201ENSMUST00000041463 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
FgbQ8K0E8 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
FgbQ8K0E8 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC13.89□□□□□ -0.19
FgbQ8K0E8 Trav4d-3-201ENSMUST00000103592 331 ntAPPRIS P1 BASIC13.89□□□□□ -0.19
FgbQ8K0E8 Trav4d-4-201ENSMUST00000103600 354 ntAPPRIS P1 BASIC13.89□□□□□ -0.19
FgbQ8K0E8 Trav4n-3-201ENSMUST00000103618 331 ntAPPRIS P1 BASIC13.89□□□□□ -0.19
FgbQ8K0E8 Trav4n-4-201ENSMUST00000103627 354 ntAPPRIS P1 BASIC13.89□□□□□ -0.19
FgbQ8K0E8 Trav4-3-201ENSMUST00000103655 411 ntAPPRIS P1 BASIC13.89□□□□□ -0.19
FgbQ8K0E8 Trav4-4-dv10-201ENSMUST00000103663 361 ntAPPRIS P1 BASIC13.89□□□□□ -0.19
FgbQ8K0E8 Gm24255-201ENSMUST00000104481 128 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
FgbQ8K0E8 Upk3bl-202ENSMUST00000111137 1119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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FgbQ8K0E8 Gm24548-201ENSMUST00000158650 108 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
FgbQ8K0E8 Gm6621-201ENSMUST00000193251 772 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
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FgbQ8K0E8 Tmem205-203ENSMUST00000213698 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
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FgbQ8K0E8 Dph3-201ENSMUST00000022461 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
FgbQ8K0E8 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
FgbQ8K0E8 1700007G11Rik-201ENSMUST00000080333 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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FgbQ8K0E8 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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FgbQ8K0E8 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
FgbQ8K0E8 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
FgbQ8K0E8 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
FgbQ8K0E8 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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FgbQ8K0E8 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
FgbQ8K0E8 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
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FgbQ8K0E8 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
FgbQ8K0E8 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
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FgbQ8K0E8 Gm14149-201ENSMUST00000123048 1853 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
FgbQ8K0E8 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
FgbQ8K0E8 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC13.88□□□□□ -0.19
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FgbQ8K0E8 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
FgbQ8K0E8 Gpsm1-204ENSMUST00000114134 2043 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
FgbQ8K0E8 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
FgbQ8K0E8 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
FgbQ8K0E8 Prkcd-203ENSMUST00000112203 1927 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
FgbQ8K0E8 Tmed5-202ENSMUST00000061203 2194 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
FgbQ8K0E8 Hoxd10-201ENSMUST00000061745 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
FgbQ8K0E8 Tekt2-201ENSMUST00000030658 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
FgbQ8K0E8 Gm13055-201ENSMUST00000127875 1961 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
FgbQ8K0E8 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
FgbQ8K0E8 Wrap53-201ENSMUST00000048139 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
FgbQ8K0E8 Mrm3-201ENSMUST00000040577 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
FgbQ8K0E8 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
FgbQ8K0E8 Inca1-203ENSMUST00000108542 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
FgbQ8K0E8 4933406I18Rik-201ENSMUST00000124673 905 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
FgbQ8K0E8 Hnf4aos-203ENSMUST00000141329 839 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
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