Protein–RNA interactions for Protein: Q8JZW8

Pnma3, Paraneoplastic antigen Ma3 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 466 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pnma3Q8JZW8 Rbak-202ENSMUST00000165318 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pnma3Q8JZW8 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pnma3Q8JZW8 Ralgps2-211ENSMUST00000190648 2498 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pnma3Q8JZW8 F630040K05Rik-202ENSMUST00000180558 2633 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pnma3Q8JZW8 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pnma3Q8JZW8 Mroh5-202ENSMUST00000110021 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pnma3Q8JZW8 Gm19817-201ENSMUST00000199764 2132 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Pnma3Q8JZW8 Wscd1-201ENSMUST00000021168 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pnma3Q8JZW8 Slc4a5-201ENSMUST00000039212 5123 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pnma3Q8JZW8 Lrrc30-201ENSMUST00000097290 1759 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pnma3Q8JZW8 Bcl2l1-202ENSMUST00000109820 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pnma3Q8JZW8 Zufsp-201ENSMUST00000048222 2991 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pnma3Q8JZW8 Ajuba-201ENSMUST00000054487 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pnma3Q8JZW8 Olfr718-ps1-202ENSMUST00000213631 4737 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pnma3Q8JZW8 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pnma3Q8JZW8 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pnma3Q8JZW8 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pnma3Q8JZW8 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pnma3Q8JZW8 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pnma3Q8JZW8 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pnma3Q8JZW8 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pnma3Q8JZW8 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Pnma3Q8JZW8 Gm26854-201ENSMUST00000180418 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pnma3Q8JZW8 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pnma3Q8JZW8 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pnma3Q8JZW8 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pnma3Q8JZW8 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pnma3Q8JZW8 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pnma3Q8JZW8 Mbp-205ENSMUST00000091789 4797 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pnma3Q8JZW8 Gm44401-201ENSMUST00000204462 2375 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Pnma3Q8JZW8 Kcnc2-204ENSMUST00000219301 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pnma3Q8JZW8 Gm43051-201ENSMUST00000201096 2678 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Pnma3Q8JZW8 Gata3-201ENSMUST00000102976 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pnma3Q8JZW8 Abcg8-203ENSMUST00000171915 2284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pnma3Q8JZW8 Gm9866-202ENSMUST00000182473 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pnma3Q8JZW8 Ano6-208ENSMUST00000227791 3149 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pnma3Q8JZW8 B230369F24Rik-201ENSMUST00000141846 2560 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pnma3Q8JZW8 Fen1-203ENSMUST00000142241 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pnma3Q8JZW8 Itfg2-203ENSMUST00000142615 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pnma3Q8JZW8 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pnma3Q8JZW8 Ube2g1-201ENSMUST00000021148 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pnma3Q8JZW8 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pnma3Q8JZW8 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pnma3Q8JZW8 Arhgef39-201ENSMUST00000054538 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pnma3Q8JZW8 Ispd-205ENSMUST00000221895 4022 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pnma3Q8JZW8 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pnma3Q8JZW8 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pnma3Q8JZW8 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pnma3Q8JZW8 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pnma3Q8JZW8 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pnma3Q8JZW8 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pnma3Q8JZW8 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pnma3Q8JZW8 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Pnma3Q8JZW8 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pnma3Q8JZW8 Nupl1-206ENSMUST00000225111 2936 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Pnma3Q8JZW8 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pnma3Q8JZW8 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pnma3Q8JZW8 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pnma3Q8JZW8 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pnma3Q8JZW8 Tbc1d5-205ENSMUST00000224528 4764 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pnma3Q8JZW8 Has3-203ENSMUST00000176144 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pnma3Q8JZW8 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pnma3Q8JZW8 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pnma3Q8JZW8 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pnma3Q8JZW8 Gsdmcl2-203ENSMUST00000185431 1911 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Pnma3Q8JZW8 AC122840.1-201ENSMUST00000220915 3334 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Pnma3Q8JZW8 Zfp618-202ENSMUST00000064814 2868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pnma3Q8JZW8 Rbm10-202ENSMUST00000082089 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pnma3Q8JZW8 Pcdh8-201ENSMUST00000039568 4000 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pnma3Q8JZW8 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pnma3Q8JZW8 Mecom-206ENSMUST00000172694 4381 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pnma3Q8JZW8 Afmid-201ENSMUST00000073388 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pnma3Q8JZW8 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pnma3Q8JZW8 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pnma3Q8JZW8 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pnma3Q8JZW8 Tnip1-204ENSMUST00000108885 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pnma3Q8JZW8 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pnma3Q8JZW8 AC151895.1-201ENSMUST00000219025 1742 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Pnma3Q8JZW8 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pnma3Q8JZW8 C030005K06Rik-201ENSMUST00000129164 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pnma3Q8JZW8 Sipa1l3-207ENSMUST00000182484 2420 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pnma3Q8JZW8 Sltm-206ENSMUST00000216816 3755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pnma3Q8JZW8 Flcn-202ENSMUST00000091246 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pnma3Q8JZW8 Amotl2-201ENSMUST00000035121 4328 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pnma3Q8JZW8 Gcdh-202ENSMUST00000109745 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pnma3Q8JZW8 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pnma3Q8JZW8 Pou2f3-rs1-201ENSMUST00000120271 1046 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Pnma3Q8JZW8 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Pnma3Q8JZW8 Gm11424-201ENSMUST00000121929 829 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Pnma3Q8JZW8 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pnma3Q8JZW8 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pnma3Q8JZW8 Gm5124-201ENSMUST00000127554 1970 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pnma3Q8JZW8 Ppp1r18-203ENSMUST00000127442 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pnma3Q8JZW8 Sec14l5-201ENSMUST00000165810 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pnma3Q8JZW8 Gm45833-201ENSMUST00000211931 2730 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pnma3Q8JZW8 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pnma3Q8JZW8 Spata33-202ENSMUST00000212161 2941 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pnma3Q8JZW8 Psap-203ENSMUST00000165878 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pnma3Q8JZW8 Slc25a40-201ENSMUST00000066921 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pnma3Q8JZW8 Foxred1-202ENSMUST00000127996 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.6 ms