Protein–RNA interactions for Protein: Q8CE24

Pramef8, 4732496O08Rik protein, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pramef8Q8CE24 Fscn2-201ENSMUST00000026445 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Pramef8Q8CE24 Phka1-206ENSMUST00000122022 6115 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Pramef8Q8CE24 Phka1-202ENSMUST00000052012 6115 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Pramef8Q8CE24 Acot6-202ENSMUST00000222921 3622 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Pramef8Q8CE24 Uckl1-201ENSMUST00000057816 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Pramef8Q8CE24 Dok7-203ENSMUST00000114270 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Pramef8Q8CE24 4632404H12Rik-201ENSMUST00000038450 2791 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Pramef8Q8CE24 Fnbp4-201ENSMUST00000013759 4691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Pramef8Q8CE24 Sass6-206ENSMUST00000198386 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Pramef8Q8CE24 Lysmd4-201ENSMUST00000058771 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Pramef8Q8CE24 Acsl6-210ENSMUST00000108905 5807 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Pramef8Q8CE24 Calcr-203ENSMUST00000168592 2064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Pramef8Q8CE24 Zfp422-202ENSMUST00000079749 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Pramef8Q8CE24 Nol4-208ENSMUST00000164893 2175 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Pramef8Q8CE24 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Pramef8Q8CE24 Aoc2-202ENSMUST00000107264 2230 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Pramef8Q8CE24 Kif9-204ENSMUST00000198043 2233 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Pramef8Q8CE24 Hnrnpf-203ENSMUST00000167182 2271 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Pramef8Q8CE24 Unc5d-204ENSMUST00000210785 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Pramef8Q8CE24 Smim14-205ENSMUST00000139122 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Pramef8Q8CE24 Miat-205ENSMUST00000182953 9163 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Pramef8Q8CE24 Mks1-201ENSMUST00000038196 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Pramef8Q8CE24 St8sia3-201ENSMUST00000025477 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Pramef8Q8CE24 Fasn-201ENSMUST00000055655 10050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Pramef8Q8CE24 Sall4-201ENSMUST00000029061 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Pramef8Q8CE24 Mir874-201ENSMUST00000104769 76 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Pramef8Q8CE24 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Pramef8Q8CE24 Ldha-ps-201ENSMUST00000119390 995 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Pramef8Q8CE24 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Pramef8Q8CE24 Gm15966-201ENSMUST00000136853 480 ntTSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Pramef8Q8CE24 Gm13568-201ENSMUST00000156099 446 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Pramef8Q8CE24 Gm15851-201ENSMUST00000160564 662 ntTSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Pramef8Q8CE24 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Pramef8Q8CE24 Prss54-202ENSMUST00000180075 1152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Pramef8Q8CE24 1700022A21Rik-201ENSMUST00000182745 1051 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Pramef8Q8CE24 Gm44855-201ENSMUST00000205725 362 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Pramef8Q8CE24 Dkkl1-204ENSMUST00000210741 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Pramef8Q8CE24 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Pramef8Q8CE24 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Pramef8Q8CE24 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Pramef8Q8CE24 Myef2-207ENSMUST00000147105 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Pramef8Q8CE24 Gnb2-202ENSMUST00000111020 1470 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Pramef8Q8CE24 AI839979-202ENSMUST00000201790 1539 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Pramef8Q8CE24 Kcnk13-202ENSMUST00000160413 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Pramef8Q8CE24 Adam11-202ENSMUST00000103081 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Pramef8Q8CE24 Prdx2-203ENSMUST00000109734 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Pramef8Q8CE24 4930453N24Rik-201ENSMUST00000076991 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Pramef8Q8CE24 Actn4-201ENSMUST00000068045 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Pramef8Q8CE24 Gm8108-202ENSMUST00000170207 1961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Pramef8Q8CE24 BB123696-201ENSMUST00000222580 2056 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Pramef8Q8CE24 Slc22a2-201ENSMUST00000046959 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Pramef8Q8CE24 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Pramef8Q8CE24 4933416C03Rik-201ENSMUST00000099261 2254 ntAPPRIS P1 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Pramef8Q8CE24 Tnpo2-201ENSMUST00000093360 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Pramef8Q8CE24 Cpped1-203ENSMUST00000121750 2614 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Pramef8Q8CE24 Gsn-201ENSMUST00000028239 2653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Pramef8Q8CE24 Notch1-201ENSMUST00000028288 9488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Pramef8Q8CE24 Bptf-202ENSMUST00000106762 11847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Pramef8Q8CE24 AC158633.2-201ENSMUST00000222959 6046 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Pramef8Q8CE24 Rap1gap2-202ENSMUST00000102521 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Pramef8Q8CE24 Nbeal2-206ENSMUST00000133191 8782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Pramef8Q8CE24 Kcnq2-208ENSMUST00000103051 4200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Pramef8Q8CE24 Glipr2-202ENSMUST00000107855 1816 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Pramef8Q8CE24 Dlg4-204ENSMUST00000108589 3271 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Pramef8Q8CE24 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Pramef8Q8CE24 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Pramef8Q8CE24 Bik-201ENSMUST00000016902 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Pramef8Q8CE24 Psmd11-201ENSMUST00000017572 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Pramef8Q8CE24 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Pramef8Q8CE24 Tmem215-202ENSMUST00000179526 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Pramef8Q8CE24 Fbxl19-202ENSMUST00000186116 3641 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Pramef8Q8CE24 Fcrl1-204ENSMUST00000191666 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Pramef8Q8CE24 Scg3-202ENSMUST00000213324 2152 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Pramef8Q8CE24 Sptb-201ENSMUST00000021458 10394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Pramef8Q8CE24 Gm34376-201ENSMUST00000218529 2107 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Pramef8Q8CE24 Enox1-201ENSMUST00000022589 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Pramef8Q8CE24 AC192088.1-201ENSMUST00000227561 301 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Pramef8Q8CE24 Prkg1-202ENSMUST00000073581 2841 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Pramef8Q8CE24 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Pramef8Q8CE24 Igsf5-202ENSMUST00000081093 1554 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Pramef8Q8CE24 Aatk-201ENSMUST00000064307 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Pramef8Q8CE24 Smg5-201ENSMUST00000001451 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Pramef8Q8CE24 Vars-201ENSMUST00000087315 4137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Pramef8Q8CE24 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Pramef8Q8CE24 Shc4-203ENSMUST00000110480 3671 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Pramef8Q8CE24 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Pramef8Q8CE24 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Pramef8Q8CE24 Pde4a-203ENSMUST00000115458 2962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Pramef8Q8CE24 Wdr36-202ENSMUST00000166214 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Pramef8Q8CE24 Qsox1-202ENSMUST00000111764 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Pramef8Q8CE24 Mbp-205ENSMUST00000091789 4797 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Pramef8Q8CE24 Oprm1-215ENSMUST00000105607 2369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Pramef8Q8CE24 Uhrf1bp1l-201ENSMUST00000020112 6448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Pramef8Q8CE24 Diaph2-207ENSMUST00000167619 8439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Pramef8Q8CE24 Mrps35-201ENSMUST00000036111 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Pramef8Q8CE24 Pde9a-203ENSMUST00000127929 1891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Pramef8Q8CE24 Exoc6b-203ENSMUST00000160197 5439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Pramef8Q8CE24 Neil1-203ENSMUST00000190245 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Pramef8Q8CE24 C130050O18Rik-201ENSMUST00000052176 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Pramef8Q8CE24 Cant1-203ENSMUST00000106287 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.8 ms