Protein–RNA interactions for Protein: Q8CCH2

Nhlrc3, NHL repeat-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 347 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nhlrc3Q8CCH2 Kcnc1-203ENSMUST00000160433 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Nhlrc3Q8CCH2 Tjp3-205ENSMUST00000219479 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Nhlrc3Q8CCH2 Pde8b-207ENSMUST00000162153 2474 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Nhlrc3Q8CCH2 Iffo2-202ENSMUST00000123827 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Nhlrc3Q8CCH2 Rnf224-201ENSMUST00000091318 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Nhlrc3Q8CCH2 Vrtn-202ENSMUST00000166772 3098 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Nhlrc3Q8CCH2 S100pbp-205ENSMUST00000117350 2241 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Nhlrc3Q8CCH2 Wwox-201ENSMUST00000004756 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Nhlrc3Q8CCH2 Cnih4-204ENSMUST00000134115 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Nhlrc3Q8CCH2 Eif4enif1-213ENSMUST00000179770 3676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Nhlrc3Q8CCH2 AC139350.1-201ENSMUST00000227064 1594 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Nhlrc3Q8CCH2 Kcnn2-201ENSMUST00000066890 3682 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Nhlrc3Q8CCH2 Lrrc8e-201ENSMUST00000053035 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Nhlrc3Q8CCH2 Plcb2-202ENSMUST00000102524 5145 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Nhlrc3Q8CCH2 Il34-204ENSMUST00000150680 1796 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Nhlrc3Q8CCH2 Acin1-219ENSMUST00000148754 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Nhlrc3Q8CCH2 Frmpd4-204ENSMUST00000112149 8456 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Nhlrc3Q8CCH2 Kmt5b-205ENSMUST00000113972 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Nhlrc3Q8CCH2 Sp9-201ENSMUST00000090813 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Nhlrc3Q8CCH2 Prrc2a-206ENSMUST00000174805 6741 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Nhlrc3Q8CCH2 Slc25a22-202ENSMUST00000106006 2277 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Nhlrc3Q8CCH2 Lrriq4-201ENSMUST00000108265 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Nhlrc3Q8CCH2 Gnat2-201ENSMUST00000058669 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Nhlrc3Q8CCH2 Ell3-202ENSMUST00000116432 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Nhlrc3Q8CCH2 Pitpnm2-204ENSMUST00000159677 1690 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Nhlrc3Q8CCH2 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Nhlrc3Q8CCH2 Gm15460-201ENSMUST00000118147 391 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Nhlrc3Q8CCH2 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Nhlrc3Q8CCH2 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Nhlrc3Q8CCH2 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Nhlrc3Q8CCH2 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Nhlrc3Q8CCH2 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Nhlrc3Q8CCH2 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Nhlrc3Q8CCH2 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Nhlrc3Q8CCH2 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Nhlrc3Q8CCH2 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Nhlrc3Q8CCH2 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Nhlrc3Q8CCH2 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Nhlrc3Q8CCH2 Olfr1214-201ENSMUST00000099804 936 ntAPPRIS P1 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Nhlrc3Q8CCH2 Tfdp2-203ENSMUST00000165768 2212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Nhlrc3Q8CCH2 Gm44891-201ENSMUST00000208817 2223 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Nhlrc3Q8CCH2 Disp1-205ENSMUST00000195372 4901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Nhlrc3Q8CCH2 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Nhlrc3Q8CCH2 Usp16-202ENSMUST00000119504 2562 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Nhlrc3Q8CCH2 Pla2g3-202ENSMUST00000064265 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Nhlrc3Q8CCH2 Tbkbp1-204ENSMUST00000107615 3333 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Nhlrc3Q8CCH2 Clcn6-201ENSMUST00000030879 3306 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Nhlrc3Q8CCH2 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Nhlrc3Q8CCH2 Dpysl5-203ENSMUST00000114729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Nhlrc3Q8CCH2 Cfap69-201ENSMUST00000054865 4956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Nhlrc3Q8CCH2 9130011E15Rik-201ENSMUST00000045396 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Nhlrc3Q8CCH2 Cacna1g-207ENSMUST00000107789 8383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Nhlrc3Q8CCH2 Aip-202ENSMUST00000117831 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Nhlrc3Q8CCH2 Abcg8-203ENSMUST00000171915 2284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Nhlrc3Q8CCH2 Hhatl-202ENSMUST00000163981 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Nhlrc3Q8CCH2 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Nhlrc3Q8CCH2 Cacna1b-205ENSMUST00000114447 6987 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Nhlrc3Q8CCH2 Gm5592-202ENSMUST00000206490 2623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Nhlrc3Q8CCH2 Rap1gap2-202ENSMUST00000102521 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Nhlrc3Q8CCH2 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Nhlrc3Q8CCH2 Lrrfip1-204ENSMUST00000097650 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Nhlrc3Q8CCH2 Gm20700-201ENSMUST00000176749 2206 ntTSL 3 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Nhlrc3Q8CCH2 Tsku-205ENSMUST00000167405 2597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Nhlrc3Q8CCH2 Mrpl3-201ENSMUST00000035177 3972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Nhlrc3Q8CCH2 Zfp575-201ENSMUST00000094705 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Nhlrc3Q8CCH2 Sv2c-203ENSMUST00000182289 2197 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Nhlrc3Q8CCH2 Acsf3-203ENSMUST00000212790 2171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Nhlrc3Q8CCH2 Scg3-202ENSMUST00000213324 2152 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Nhlrc3Q8CCH2 Pde4d-201ENSMUST00000074103 2167 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Nhlrc3Q8CCH2 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Nhlrc3Q8CCH2 Pigq-201ENSMUST00000026823 3173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Nhlrc3Q8CCH2 Wnt7a-201ENSMUST00000032180 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Nhlrc3Q8CCH2 Patj-201ENSMUST00000030290 2495 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Nhlrc3Q8CCH2 Gemin5-205ENSMUST00000172035 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Nhlrc3Q8CCH2 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Nhlrc3Q8CCH2 Gm11557-201ENSMUST00000120200 1008 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Nhlrc3Q8CCH2 Gm8927-201ENSMUST00000181978 981 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Nhlrc3Q8CCH2 AC153872.1-201ENSMUST00000199539 128 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Nhlrc3Q8CCH2 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Nhlrc3Q8CCH2 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Nhlrc3Q8CCH2 Paox-201ENSMUST00000026537 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Nhlrc3Q8CCH2 Efhc1-201ENSMUST00000038447 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Nhlrc3Q8CCH2 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Nhlrc3Q8CCH2 Gm3222-201ENSMUST00000071282 990 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Nhlrc3Q8CCH2 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Nhlrc3Q8CCH2 Polr3g-201ENSMUST00000048993 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Nhlrc3Q8CCH2 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Nhlrc3Q8CCH2 2900026A02Rik-201ENSMUST00000050125 5876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Nhlrc3Q8CCH2 Spock3-203ENSMUST00000118003 2860 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Nhlrc3Q8CCH2 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Nhlrc3Q8CCH2 Adra1b-201ENSMUST00000067258 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Nhlrc3Q8CCH2 AC158633.2-201ENSMUST00000222959 6046 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.59
Nhlrc3Q8CCH2 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Nhlrc3Q8CCH2 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Nhlrc3Q8CCH2 Anapc7-202ENSMUST00000119792 3599 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Nhlrc3Q8CCH2 Srebf2-201ENSMUST00000023100 4989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Nhlrc3Q8CCH2 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Nhlrc3Q8CCH2 Ccdc125-201ENSMUST00000057325 2413 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Nhlrc3Q8CCH2 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Nhlrc3Q8CCH2 Lrfn3-201ENSMUST00000046351 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.7 ms