Protein–RNA interactions for Protein: Q8CAT8

Fbxo48, F-box only protein 48, mousemouse

Predictions only

Length 161 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fbxo48Q8CAT8 Trpt1-201ENSMUST00000088223 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Fbxo48Q8CAT8 As3mt-201ENSMUST00000003655 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Fbxo48Q8CAT8 Fbxw17-201ENSMUST00000046974 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Fbxo48Q8CAT8 Kcp-201ENSMUST00000078112 4775 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Fbxo48Q8CAT8 Opa1-201ENSMUST00000038867 3230 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Fbxo48Q8CAT8 Nrd1-202ENSMUST00000102736 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Fbxo48Q8CAT8 Dnmt3b-206ENSMUST00000103151 3956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Fbxo48Q8CAT8 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Fbxo48Q8CAT8 Gm14452-201ENSMUST00000118680 1632 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Fbxo48Q8CAT8 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Fbxo48Q8CAT8 Sqle-201ENSMUST00000022977 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Fbxo48Q8CAT8 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Fbxo48Q8CAT8 Sema3b-205ENSMUST00000102532 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Fbxo48Q8CAT8 Trim32-202ENSMUST00000107366 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Fbxo48Q8CAT8 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Fbxo48Q8CAT8 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Fbxo48Q8CAT8 Ddi2-202ENSMUST00000177592 3539 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Fbxo48Q8CAT8 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Fbxo48Q8CAT8 Arhgap20-201ENSMUST00000065496 7161 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Fbxo48Q8CAT8 Gm10371-201ENSMUST00000127429 1411 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Fbxo48Q8CAT8 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Fbxo48Q8CAT8 Canx-201ENSMUST00000020637 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Fbxo48Q8CAT8 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Fbxo48Q8CAT8 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Fbxo48Q8CAT8 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Fbxo48Q8CAT8 B230319C09Rik-201ENSMUST00000063376 1689 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Fbxo48Q8CAT8 B3galnt2-201ENSMUST00000099747 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Fbxo48Q8CAT8 Arfgap1-205ENSMUST00000108862 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Fbxo48Q8CAT8 Hus1b-201ENSMUST00000102943 1187 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Fbxo48Q8CAT8 Tspan17-208ENSMUST00000163915 459 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Fbxo48Q8CAT8 Gnb2-215ENSMUST00000170293 993 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Fbxo48Q8CAT8 Tdrp-206ENSMUST00000210414 323 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Fbxo48Q8CAT8 Gm29154-230ENSMUST00000215044 1165 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Fbxo48Q8CAT8 Net1-207ENSMUST00000223258 597 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Fbxo48Q8CAT8 Duoxa1-201ENSMUST00000028653 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Fbxo48Q8CAT8 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Fbxo48Q8CAT8 Tmem256-201ENSMUST00000094065 492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Fbxo48Q8CAT8 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Fbxo48Q8CAT8 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Fbxo48Q8CAT8 Wdr13-205ENSMUST00000130832 4374 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Fbxo48Q8CAT8 2310022A10Rik-204ENSMUST00000187032 1871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Fbxo48Q8CAT8 Syt8-204ENSMUST00000118276 1503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Fbxo48Q8CAT8 Decr2-201ENSMUST00000040907 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Fbxo48Q8CAT8 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Fbxo48Q8CAT8 Zscan30-202ENSMUST00000224144 1458 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Fbxo48Q8CAT8 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Fbxo48Q8CAT8 Hoxd3-202ENSMUST00000111982 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Fbxo48Q8CAT8 Mettl11b-201ENSMUST00000159679 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Fbxo48Q8CAT8 Stau2-215ENSMUST00000162435 2735 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Fbxo48Q8CAT8 Ptpn11-202ENSMUST00000100770 5599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Fbxo48Q8CAT8 Arid4b-202ENSMUST00000110533 3020 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Fbxo48Q8CAT8 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Fbxo48Q8CAT8 Gm35721-201ENSMUST00000220294 2014 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Fbxo48Q8CAT8 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Fbxo48Q8CAT8 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Fbxo48Q8CAT8 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Fbxo48Q8CAT8 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Fbxo48Q8CAT8 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Fbxo48Q8CAT8 Fbxo10-201ENSMUST00000052236 4635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Fbxo48Q8CAT8 Dpysl5-202ENSMUST00000101442 1309 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Fbxo48Q8CAT8 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Fbxo48Q8CAT8 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Fbxo48Q8CAT8 Gtf2i-206ENSMUST00000172715 4114 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Fbxo48Q8CAT8 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Fbxo48Q8CAT8 Nipsnap3b-202ENSMUST00000107665 848 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Fbxo48Q8CAT8 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Fbxo48Q8CAT8 Nudt17-202ENSMUST00000171249 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Fbxo48Q8CAT8 Mir3547-201ENSMUST00000175461 88 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
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Fbxo48Q8CAT8 Gm28511-201ENSMUST00000191594 450 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Fbxo48Q8CAT8 Gm5279-201ENSMUST00000199575 745 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Fbxo48Q8CAT8 AC131777.1-201ENSMUST00000214749 387 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Fbxo48Q8CAT8 2310002L09Rik-201ENSMUST00000030101 958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Fbxo48Q8CAT8 Pla2g2e-201ENSMUST00000030531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Fbxo48Q8CAT8 Gps2-201ENSMUST00000057884 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Fbxo48Q8CAT8 Mdk-203ENSMUST00000090602 714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Fbxo48Q8CAT8 Nfatc1-202ENSMUST00000078049 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Fbxo48Q8CAT8 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Fbxo48Q8CAT8 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Fbxo48Q8CAT8 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Fbxo48Q8CAT8 Nek8-201ENSMUST00000017549 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Fbxo48Q8CAT8 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Fbxo48Q8CAT8 Micu1-202ENSMUST00000092508 2294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Fbxo48Q8CAT8 Twf1-201ENSMUST00000023087 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Fbxo48Q8CAT8 Abtb2-201ENSMUST00000076212 4558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Fbxo48Q8CAT8 Mks1-201ENSMUST00000038196 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Fbxo48Q8CAT8 Mrpl44-201ENSMUST00000027464 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Fbxo48Q8CAT8 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Fbxo48Q8CAT8 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Fbxo48Q8CAT8 Sgce-203ENSMUST00000101677 1656 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Fbxo48Q8CAT8 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Fbxo48Q8CAT8 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Fbxo48Q8CAT8 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Fbxo48Q8CAT8 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Fbxo48Q8CAT8 Msantd3-201ENSMUST00000061135 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Fbxo48Q8CAT8 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Fbxo48Q8CAT8 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Fbxo48Q8CAT8 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Fbxo48Q8CAT8 Pnpo-202ENSMUST00000107629 681 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.8 ms