Protein–RNA interactions for Protein: Q8BVP1

Triml1, Probable E3 ubiquitin-protein ligase TRIML1, mousemouse

Predictions only

Length 470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Triml1Q8BVP1 Gm15429-201ENSMUST00000151268 798 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Triml1Q8BVP1 Gm20753-201ENSMUST00000190105 545 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Triml1Q8BVP1 Gm42550-201ENSMUST00000201553 960 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Triml1Q8BVP1 AC073947.2-201ENSMUST00000215888 1130 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Triml1Q8BVP1 Ngf-201ENSMUST00000035952 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Triml1Q8BVP1 Swi5-201ENSMUST00000050410 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Triml1Q8BVP1 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Triml1Q8BVP1 Klf12-201ENSMUST00000097079 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Triml1Q8BVP1 Slc6a7-201ENSMUST00000025520 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Triml1Q8BVP1 Gab3-201ENSMUST00000037374 2153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Triml1Q8BVP1 Gpr19-208ENSMUST00000165392 1643 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Triml1Q8BVP1 Gpr19-202ENSMUST00000066107 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Triml1Q8BVP1 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Triml1Q8BVP1 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Triml1Q8BVP1 Galnt4-201ENSMUST00000161240 5089 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Triml1Q8BVP1 Prkx-202ENSMUST00000114044 2639 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Triml1Q8BVP1 Ephx2-201ENSMUST00000070515 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Triml1Q8BVP1 Igsf9b-202ENSMUST00000133213 4239 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Triml1Q8BVP1 Gm26525-201ENSMUST00000180666 3616 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Triml1Q8BVP1 Gm26867-201ENSMUST00000180963 3615 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Triml1Q8BVP1 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Triml1Q8BVP1 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Triml1Q8BVP1 Haus8-202ENSMUST00000110071 1452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Triml1Q8BVP1 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Triml1Q8BVP1 Tfap2a-202ENSMUST00000110193 2863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Triml1Q8BVP1 AC139350.1-201ENSMUST00000227064 1594 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Triml1Q8BVP1 Adcyap1r1-202ENSMUST00000070756 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Triml1Q8BVP1 Ptbp2-201ENSMUST00000029780 3364 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Triml1Q8BVP1 Opa3-201ENSMUST00000063976 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Triml1Q8BVP1 Herpud1-205ENSMUST00000161576 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Triml1Q8BVP1 Dsp-202ENSMUST00000127906 7761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Triml1Q8BVP1 1700037H04Rik-202ENSMUST00000103188 1241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Triml1Q8BVP1 Tagln2-201ENSMUST00000111228 716 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Triml1Q8BVP1 Gm27701-201ENSMUST00000184498 110 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Triml1Q8BVP1 Gm28911-201ENSMUST00000188837 117 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Triml1Q8BVP1 Gm38223-201ENSMUST00000194484 695 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Triml1Q8BVP1 Gm34086-201ENSMUST00000196486 743 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Triml1Q8BVP1 Med8-203ENSMUST00000084319 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Triml1Q8BVP1 Gm10322-201ENSMUST00000095646 336 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Triml1Q8BVP1 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Triml1Q8BVP1 Steap2-203ENSMUST00000115425 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Triml1Q8BVP1 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Triml1Q8BVP1 Dnm1-214ENSMUST00000201433 3146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Triml1Q8BVP1 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Triml1Q8BVP1 Gemin5-205ENSMUST00000172035 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Triml1Q8BVP1 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Triml1Q8BVP1 Gm43650-201ENSMUST00000197337 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Triml1Q8BVP1 Gm30214-201ENSMUST00000199271 1383 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Triml1Q8BVP1 Ube2g1-201ENSMUST00000021148 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Triml1Q8BVP1 Lnx1-205ENSMUST00000117525 2259 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Triml1Q8BVP1 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Triml1Q8BVP1 Kansl2-ps-201ENSMUST00000181818 1461 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Triml1Q8BVP1 Zc3h13-201ENSMUST00000022577 6151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Triml1Q8BVP1 Mink1-203ENSMUST00000079244 4829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Triml1Q8BVP1 Gm14752-201ENSMUST00000120719 2075 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
Triml1Q8BVP1 Cacna2d2-208ENSMUST00000170737 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Triml1Q8BVP1 Gm15816-201ENSMUST00000141930 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Triml1Q8BVP1 Neil1-203ENSMUST00000190245 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Triml1Q8BVP1 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Triml1Q8BVP1 Krt35-201ENSMUST00000103127 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Triml1Q8BVP1 Alkbh4-201ENSMUST00000041100 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Triml1Q8BVP1 Eogt-202ENSMUST00000113387 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Triml1Q8BVP1 Vps29-204ENSMUST00000118830 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Triml1Q8BVP1 Gm15755-201ENSMUST00000133698 659 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Triml1Q8BVP1 Gm6460-202ENSMUST00000163787 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Triml1Q8BVP1 Gm8879-201ENSMUST00000170260 1125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Triml1Q8BVP1 4933402N22Rik-202ENSMUST00000170301 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Triml1Q8BVP1 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Triml1Q8BVP1 4933405L10Rik-202ENSMUST00000211852 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Triml1Q8BVP1 AC140375.2-201ENSMUST00000225283 584 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Triml1Q8BVP1 Ifitm3-201ENSMUST00000026565 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Triml1Q8BVP1 Emc4-201ENSMUST00000028551 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Triml1Q8BVP1 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Triml1Q8BVP1 Cby3-201ENSMUST00000052596 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Triml1Q8BVP1 Gm8973-201ENSMUST00000079818 315 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Triml1Q8BVP1 H1fnt-201ENSMUST00000060855 1326 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Triml1Q8BVP1 Evx1os-201ENSMUST00000125305 2916 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Triml1Q8BVP1 Kdm2b-204ENSMUST00000118027 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Triml1Q8BVP1 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Triml1Q8BVP1 Xlr-202ENSMUST00000067782 1860 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Triml1Q8BVP1 Smim14-205ENSMUST00000139122 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Triml1Q8BVP1 Arr3-201ENSMUST00000113769 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Triml1Q8BVP1 Gm36065-202ENSMUST00000219654 1424 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Triml1Q8BVP1 Cldn9-201ENSMUST00000085989 1435 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Triml1Q8BVP1 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Triml1Q8BVP1 4930453N24Rik-201ENSMUST00000076991 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Triml1Q8BVP1 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Triml1Q8BVP1 Smg5-201ENSMUST00000001451 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Triml1Q8BVP1 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Triml1Q8BVP1 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Triml1Q8BVP1 Pbrm1-203ENSMUST00000052239 5065 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Triml1Q8BVP1 Atp2a3-204ENSMUST00000108486 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Triml1Q8BVP1 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Triml1Q8BVP1 Klhl32-204ENSMUST00000108218 7143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Triml1Q8BVP1 Tjap1-203ENSMUST00000180283 2368 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Triml1Q8BVP1 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Triml1Q8BVP1 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Triml1Q8BVP1 Bmp3-202ENSMUST00000197143 2739 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Triml1Q8BVP1 Ccser2-202ENSMUST00000090024 7509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Triml1Q8BVP1 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.2 ms