Protein–RNA interactions for Protein: Q8BMF5

Grik4, Glutamate receptor ionotropic, kainate 4, mousemouse

Predictions only

Length 956 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grik4Q8BMF5 Hpcal4-202ENSMUST00000106246 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Grik4Q8BMF5 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Grik4Q8BMF5 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Grik4Q8BMF5 Keap1-202ENSMUST00000164812 3614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Grik4Q8BMF5 Rps8-201ENSMUST00000102696 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Grik4Q8BMF5 Pkig-203ENSMUST00000109400 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Grik4Q8BMF5 Rasgrp2-207ENSMUST00000113475 573 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Grik4Q8BMF5 Selenoh-203ENSMUST00000117299 747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Grik4Q8BMF5 Gm12347-201ENSMUST00000127883 470 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Grik4Q8BMF5 Gas5-210ENSMUST00000159706 557 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Grik4Q8BMF5 Gm12057-202ENSMUST00000189990 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Grik4Q8BMF5 Dnal4-202ENSMUST00000069877 1011 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Grik4Q8BMF5 Snora73a-201ENSMUST00000082453 205 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Grik4Q8BMF5 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Grik4Q8BMF5 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Grik4Q8BMF5 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Grik4Q8BMF5 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Grik4Q8BMF5 Nol4-208ENSMUST00000164893 2175 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Grik4Q8BMF5 Herpud1-205ENSMUST00000161576 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Grik4Q8BMF5 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Grik4Q8BMF5 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Grik4Q8BMF5 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Grik4Q8BMF5 4933431E20Rik-209ENSMUST00000146337 1636 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Grik4Q8BMF5 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Grik4Q8BMF5 G3bp2-203ENSMUST00000167918 4232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Grik4Q8BMF5 Ap2m1-201ENSMUST00000007216 2937 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Grik4Q8BMF5 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Grik4Q8BMF5 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Grik4Q8BMF5 Glod4-201ENSMUST00000017430 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Grik4Q8BMF5 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Grik4Q8BMF5 Skp1a-201ENSMUST00000037324 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Grik4Q8BMF5 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Grik4Q8BMF5 Gm20488-201ENSMUST00000201641 2996 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Grik4Q8BMF5 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Grik4Q8BMF5 Gm16244-201ENSMUST00000159313 2327 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Grik4Q8BMF5 Krt32-201ENSMUST00000107419 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Grik4Q8BMF5 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Grik4Q8BMF5 Entpd2-201ENSMUST00000028328 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Grik4Q8BMF5 Slc29a1-203ENSMUST00000097317 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Grik4Q8BMF5 Gm8706-201ENSMUST00000197372 1491 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Grik4Q8BMF5 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Grik4Q8BMF5 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Grik4Q8BMF5 Dnase1l1-203ENSMUST00000114189 755 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Grik4Q8BMF5 Gm8801-201ENSMUST00000173255 1064 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Grik4Q8BMF5 Hmgcll1-207ENSMUST00000183979 1136 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Grik4Q8BMF5 1700120C14Rik-202ENSMUST00000187967 391 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Grik4Q8BMF5 Msra-205ENSMUST00000210428 1180 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Grik4Q8BMF5 Gm17823-201ENSMUST00000217830 1006 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Grik4Q8BMF5 Olfr1346-201ENSMUST00000056144 1051 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Grik4Q8BMF5 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Grik4Q8BMF5 Gpsm1-204ENSMUST00000114134 2043 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Grik4Q8BMF5 Dlk1-204ENSMUST00000109843 1300 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Grik4Q8BMF5 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Grik4Q8BMF5 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Grik4Q8BMF5 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Grik4Q8BMF5 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Grik4Q8BMF5 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Grik4Q8BMF5 Tmed5-202ENSMUST00000061203 2194 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Grik4Q8BMF5 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Grik4Q8BMF5 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Grik4Q8BMF5 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Grik4Q8BMF5 Cux2-210ENSMUST00000168288 4697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Grik4Q8BMF5 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Grik4Q8BMF5 Mpi-201ENSMUST00000034856 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Grik4Q8BMF5 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Grik4Q8BMF5 Kifc5c-ps-201ENSMUST00000179040 1530 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Grik4Q8BMF5 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Grik4Q8BMF5 Prrxl1-202ENSMUST00000186452 2371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Grik4Q8BMF5 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Grik4Q8BMF5 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Grik4Q8BMF5 Apoo-204ENSMUST00000113898 784 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Grik4Q8BMF5 Gm8805-201ENSMUST00000117848 313 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Grik4Q8BMF5 Emd-204ENSMUST00000119197 768 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Grik4Q8BMF5 Smim5-201ENSMUST00000131566 700 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Grik4Q8BMF5 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Grik4Q8BMF5 Svip-203ENSMUST00000209193 487 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Grik4Q8BMF5 AC133598.1-201ENSMUST00000224327 660 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Grik4Q8BMF5 Mrto4-201ENSMUST00000030513 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Grik4Q8BMF5 Fgf2-201ENSMUST00000038885 462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Grik4Q8BMF5 Hck-204ENSMUST00000191431 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Grik4Q8BMF5 Scrn3-202ENSMUST00000112050 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Grik4Q8BMF5 Ces1h-201ENSMUST00000145041 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Grik4Q8BMF5 Tmem19-203ENSMUST00000217884 2799 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Grik4Q8BMF5 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Grik4Q8BMF5 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Grik4Q8BMF5 Serpinb2-201ENSMUST00000009356 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Grik4Q8BMF5 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Grik4Q8BMF5 Gm35721-201ENSMUST00000220294 2014 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Grik4Q8BMF5 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Grik4Q8BMF5 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Grik4Q8BMF5 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Grik4Q8BMF5 Nek6-203ENSMUST00000112902 3147 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Grik4Q8BMF5 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Grik4Q8BMF5 Arhgef1-203ENSMUST00000117419 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Grik4Q8BMF5 4732471J01Rik-203ENSMUST00000206300 1887 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Grik4Q8BMF5 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Grik4Q8BMF5 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Grik4Q8BMF5 Arfgap1-203ENSMUST00000108860 2326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Grik4Q8BMF5 Smpd2-201ENSMUST00000019965 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Grik4Q8BMF5 Lrguk-202ENSMUST00000101564 967 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
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