Protein–RNA interactions for Protein: Q8BKN5

Tubgcp5, Gamma-tubulin complex component 5, mousemouse

Predictions only

Length 1,024 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubgcp5Q8BKN5 2900026A02Rik-201ENSMUST00000050125 5876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tubgcp5Q8BKN5 Zfp575-201ENSMUST00000094705 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tubgcp5Q8BKN5 Prnd-203ENSMUST00000110171 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tubgcp5Q8BKN5 Scin-202ENSMUST00000078481 2654 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tubgcp5Q8BKN5 Mfn2-203ENSMUST00000105715 4043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tubgcp5Q8BKN5 Dbn1-201ENSMUST00000021950 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tubgcp5Q8BKN5 Ano6-201ENSMUST00000071874 4927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tubgcp5Q8BKN5 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tubgcp5Q8BKN5 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tubgcp5Q8BKN5 Apaf1-207ENSMUST00000161987 2710 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tubgcp5Q8BKN5 Necab1-201ENSMUST00000041606 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tubgcp5Q8BKN5 Ephx2-201ENSMUST00000070515 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tubgcp5Q8BKN5 Pip5k1c-201ENSMUST00000045469 4323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tubgcp5Q8BKN5 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tubgcp5Q8BKN5 Mdga2-201ENSMUST00000037181 9833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tubgcp5Q8BKN5 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tubgcp5Q8BKN5 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tubgcp5Q8BKN5 Phka1-203ENSMUST00000113611 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tubgcp5Q8BKN5 Phka1-205ENSMUST00000120270 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tubgcp5Q8BKN5 Rnf44-218ENSMUST00000177950 3941 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tubgcp5Q8BKN5 Tacc3-202ENSMUST00000079534 2899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tubgcp5Q8BKN5 Il7-205ENSMUST00000194279 4858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tubgcp5Q8BKN5 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tubgcp5Q8BKN5 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tubgcp5Q8BKN5 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tubgcp5Q8BKN5 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tubgcp5Q8BKN5 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tubgcp5Q8BKN5 Gm3809-201ENSMUST00000180973 1006 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Tubgcp5Q8BKN5 Ighv1-25-201ENSMUST00000195638 345 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Tubgcp5Q8BKN5 AC149294.4-201ENSMUST00000227870 882 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Tubgcp5Q8BKN5 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tubgcp5Q8BKN5 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tubgcp5Q8BKN5 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tubgcp5Q8BKN5 Gm26788-201ENSMUST00000181692 1750 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tubgcp5Q8BKN5 Tlk2-209ENSMUST00000145048 2776 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tubgcp5Q8BKN5 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tubgcp5Q8BKN5 Nav1-207ENSMUST00000190298 8557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tubgcp5Q8BKN5 Slc22a2-201ENSMUST00000046959 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tubgcp5Q8BKN5 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tubgcp5Q8BKN5 Ttyh1-202ENSMUST00000079415 2882 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tubgcp5Q8BKN5 Gm26551-201ENSMUST00000181262 2432 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tubgcp5Q8BKN5 Slc6a19os-201ENSMUST00000022049 1532 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tubgcp5Q8BKN5 Xpr1-203ENSMUST00000111775 4094 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tubgcp5Q8BKN5 Psmd1-201ENSMUST00000027432 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tubgcp5Q8BKN5 Polr3g-201ENSMUST00000048993 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tubgcp5Q8BKN5 Ackr2-201ENSMUST00000050327 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tubgcp5Q8BKN5 Abat-203ENSMUST00000115839 2414 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tubgcp5Q8BKN5 Ccdc134-201ENSMUST00000089174 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tubgcp5Q8BKN5 Matr3-206ENSMUST00000187389 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tubgcp5Q8BKN5 Naa15-205ENSMUST00000193266 7480 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tubgcp5Q8BKN5 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tubgcp5Q8BKN5 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Tubgcp5Q8BKN5 Gm44719-201ENSMUST00000206404 149 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Tubgcp5Q8BKN5 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tubgcp5Q8BKN5 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Tubgcp5Q8BKN5 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Tubgcp5Q8BKN5 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Tubgcp5Q8BKN5 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tubgcp5Q8BKN5 Fbxl12-203ENSMUST00000131128 4182 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tubgcp5Q8BKN5 Vmn1r65-201ENSMUST00000086338 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tubgcp5Q8BKN5 Kbtbd6-201ENSMUST00000100359 2982 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tubgcp5Q8BKN5 Ptch2-201ENSMUST00000030443 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tubgcp5Q8BKN5 Cox10-201ENSMUST00000049091 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tubgcp5Q8BKN5 S1pr3-201ENSMUST00000087978 4463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tubgcp5Q8BKN5 Pcdh7-203ENSMUST00000191837 8785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tubgcp5Q8BKN5 Ddx19b-202ENSMUST00000065784 3104 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tubgcp5Q8BKN5 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tubgcp5Q8BKN5 Colgalt2-201ENSMUST00000044311 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tubgcp5Q8BKN5 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tubgcp5Q8BKN5 Ccdc22-201ENSMUST00000033483 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tubgcp5Q8BKN5 Rbmx2-201ENSMUST00000033433 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tubgcp5Q8BKN5 Ntm-203ENSMUST00000115237 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tubgcp5Q8BKN5 Gm35721-201ENSMUST00000220294 2014 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tubgcp5Q8BKN5 Syt1-202ENSMUST00000105276 4820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tubgcp5Q8BKN5 Inhba-201ENSMUST00000042603 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tubgcp5Q8BKN5 Rcsd1-201ENSMUST00000040357 2622 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tubgcp5Q8BKN5 Cdc73-201ENSMUST00000018337 11586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tubgcp5Q8BKN5 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tubgcp5Q8BKN5 Fktn-204ENSMUST00000221657 6241 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tubgcp5Q8BKN5 Dgcr14-201ENSMUST00000003621 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tubgcp5Q8BKN5 Ndc80-201ENSMUST00000024851 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tubgcp5Q8BKN5 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tubgcp5Q8BKN5 Stox2-201ENSMUST00000079195 10467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tubgcp5Q8BKN5 4930458D05Rik-201ENSMUST00000142871 3055 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tubgcp5Q8BKN5 Lctl-201ENSMUST00000034969 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tubgcp5Q8BKN5 Sass6-206ENSMUST00000198386 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tubgcp5Q8BKN5 Ifnar2-201ENSMUST00000023693 3047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tubgcp5Q8BKN5 Gm36745-201ENSMUST00000213455 1594 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tubgcp5Q8BKN5 Msantd3-201ENSMUST00000061135 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tubgcp5Q8BKN5 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Tubgcp5Q8BKN5 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tubgcp5Q8BKN5 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Tubgcp5Q8BKN5 Gm29741-201ENSMUST00000192667 421 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Tubgcp5Q8BKN5 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tubgcp5Q8BKN5 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tubgcp5Q8BKN5 Hspb2-201ENSMUST00000042790 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tubgcp5Q8BKN5 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tubgcp5Q8BKN5 Epb41l2-201ENSMUST00000053748 4385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tubgcp5Q8BKN5 Trim26-210ENSMUST00000179968 3203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tubgcp5Q8BKN5 Pitpnm2-205ENSMUST00000161273 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.2 ms