Protein–RNA interactions for Protein: Q810U3

Nfasc, Neurofascin, mousemouse

Predictions only

Length 1,240 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NfascQ810U3 Lctl-201ENSMUST00000034969 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
NfascQ810U3 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
NfascQ810U3 Bscl2-210ENSMUST00000171649 1962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
NfascQ810U3 Cd33-201ENSMUST00000004728 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
NfascQ810U3 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
NfascQ810U3 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
NfascQ810U3 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
NfascQ810U3 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
NfascQ810U3 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
NfascQ810U3 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
NfascQ810U3 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
NfascQ810U3 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
NfascQ810U3 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
NfascQ810U3 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
NfascQ810U3 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
NfascQ810U3 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
NfascQ810U3 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
NfascQ810U3 Car5a-201ENSMUST00000057653 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
NfascQ810U3 Kctd11-201ENSMUST00000050555 3146 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
NfascQ810U3 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
NfascQ810U3 Sh3bp2-207ENSMUST00000179943 2935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
NfascQ810U3 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
NfascQ810U3 Fbln1-201ENSMUST00000057410 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
NfascQ810U3 Cdyl-202ENSMUST00000163595 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
NfascQ810U3 Zbtb39-201ENSMUST00000054287 5960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
NfascQ810U3 Gm10561-201ENSMUST00000181563 1943 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
NfascQ810U3 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
NfascQ810U3 Gas7-201ENSMUST00000041611 2968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
NfascQ810U3 Ptn-202ENSMUST00000201321 2558 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
NfascQ810U3 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
NfascQ810U3 Lrrc10-201ENSMUST00000073834 1428 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
NfascQ810U3 Zfand4-202ENSMUST00000112900 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
NfascQ810U3 Mpzl2-201ENSMUST00000034600 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
NfascQ810U3 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
NfascQ810U3 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
NfascQ810U3 Ucp3-201ENSMUST00000032958 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
NfascQ810U3 Zfp207-206ENSMUST00000165565 2311 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
NfascQ810U3 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
NfascQ810U3 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
NfascQ810U3 Actn4-201ENSMUST00000068045 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
NfascQ810U3 Prg4-207ENSMUST00000162367 1480 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
NfascQ810U3 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
NfascQ810U3 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
NfascQ810U3 Gm12585-201ENSMUST00000117307 290 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
NfascQ810U3 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
NfascQ810U3 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
NfascQ810U3 Fbxw4-209ENSMUST00000162433 789 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
NfascQ810U3 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
NfascQ810U3 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
NfascQ810U3 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
NfascQ810U3 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
NfascQ810U3 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
NfascQ810U3 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
NfascQ810U3 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
NfascQ810U3 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
NfascQ810U3 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
NfascQ810U3 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
NfascQ810U3 2310007B03Rik-201ENSMUST00000043718 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
NfascQ810U3 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
NfascQ810U3 Nlrp6-204ENSMUST00000184560 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
NfascQ810U3 Wnt7a-201ENSMUST00000032180 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
NfascQ810U3 Dnmt3b-205ENSMUST00000103150 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
NfascQ810U3 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
NfascQ810U3 Tmem131l-202ENSMUST00000191758 5555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
NfascQ810U3 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
NfascQ810U3 Mb21d1-201ENSMUST00000034898 3231 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
NfascQ810U3 Sema4a-213ENSMUST00000165898 3125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
NfascQ810U3 Arrdc4-201ENSMUST00000048068 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
NfascQ810U3 Necab1-202ENSMUST00000108273 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
NfascQ810U3 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
NfascQ810U3 Rbmx-203ENSMUST00000114730 2019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
NfascQ810U3 Gm5385-201ENSMUST00000118988 1559 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
NfascQ810U3 Rab39-201ENSMUST00000068449 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
NfascQ810U3 Bud13-201ENSMUST00000074957 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
NfascQ810U3 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
NfascQ810U3 Klc2-204ENSMUST00000116563 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
NfascQ810U3 Cnot3-201ENSMUST00000038913 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
NfascQ810U3 Espn-213ENSMUST00000105659 3595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
NfascQ810U3 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
NfascQ810U3 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
NfascQ810U3 Gm15240-201ENSMUST00000118156 720 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
NfascQ810U3 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
NfascQ810U3 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
NfascQ810U3 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
NfascQ810U3 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
NfascQ810U3 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
NfascQ810U3 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
NfascQ810U3 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
NfascQ810U3 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
NfascQ810U3 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
NfascQ810U3 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
NfascQ810U3 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
NfascQ810U3 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
NfascQ810U3 C1qtnf1-202ENSMUST00000106286 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
NfascQ810U3 C1qtnf1-201ENSMUST00000017590 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
NfascQ810U3 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
NfascQ810U3 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
NfascQ810U3 Plin3-201ENSMUST00000019726 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
NfascQ810U3 Prkce-201ENSMUST00000097274 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
NfascQ810U3 Fam13b-201ENSMUST00000040506 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.1 ms