Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSH7

Kcnf1, Potassium voltage-gated channel subfamily F member 1, mousemouse

Predictions only

Length 493 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnf1Q7TSH7 Fscn2-201ENSMUST00000026445 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Kcnf1Q7TSH7 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Kcnf1Q7TSH7 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Kcnf1Q7TSH7 Tle3-204ENSMUST00000159386 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Kcnf1Q7TSH7 Ctsl-201ENSMUST00000021933 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Kcnf1Q7TSH7 Ranbp17-202ENSMUST00000102815 5001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Kcnf1Q7TSH7 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Kcnf1Q7TSH7 Zbtb7b-202ENSMUST00000107432 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Kcnf1Q7TSH7 Armcx1-206ENSMUST00000113201 2228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Kcnf1Q7TSH7 Slc29a1-204ENSMUST00000163492 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Kcnf1Q7TSH7 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Kcnf1Q7TSH7 Ralgps2-211ENSMUST00000190648 2498 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Kcnf1Q7TSH7 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Kcnf1Q7TSH7 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Kcnf1Q7TSH7 Gm5466-201ENSMUST00000119395 1890 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Kcnf1Q7TSH7 Dus2-201ENSMUST00000034375 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Kcnf1Q7TSH7 Acin1-208ENSMUST00000126166 2369 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Kcnf1Q7TSH7 Acin1-202ENSMUST00000022794 2365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Kcnf1Q7TSH7 Smc5-202ENSMUST00000223934 3448 ntAPPRIS P2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Kcnf1Q7TSH7 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Kcnf1Q7TSH7 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Kcnf1Q7TSH7 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Kcnf1Q7TSH7 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Kcnf1Q7TSH7 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Kcnf1Q7TSH7 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Kcnf1Q7TSH7 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Kcnf1Q7TSH7 Ighv1-51-201ENSMUST00000192903 354 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Kcnf1Q7TSH7 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Kcnf1Q7TSH7 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Kcnf1Q7TSH7 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Kcnf1Q7TSH7 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Kcnf1Q7TSH7 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Kcnf1Q7TSH7 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Kcnf1Q7TSH7 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Kcnf1Q7TSH7 Mrm3-201ENSMUST00000040577 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Kcnf1Q7TSH7 Sgk3-202ENSMUST00000166384 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Kcnf1Q7TSH7 Ank2-203ENSMUST00000182008 2474 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Kcnf1Q7TSH7 Gm3052-202ENSMUST00000188254 2224 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Kcnf1Q7TSH7 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Kcnf1Q7TSH7 Gucy2e-202ENSMUST00000108664 4415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Kcnf1Q7TSH7 Prg4-207ENSMUST00000162367 1480 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Kcnf1Q7TSH7 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Kcnf1Q7TSH7 Podn-202ENSMUST00000106708 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Kcnf1Q7TSH7 Rbm11-203ENSMUST00000114253 2699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Kcnf1Q7TSH7 Tmem25-201ENSMUST00000002100 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Kcnf1Q7TSH7 Adamts7-208ENSMUST00000167122 5338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Kcnf1Q7TSH7 Ajuba-201ENSMUST00000054487 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Kcnf1Q7TSH7 Canx-205ENSMUST00000179865 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Kcnf1Q7TSH7 Pde9a-203ENSMUST00000127929 1891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Kcnf1Q7TSH7 Bcl2l1-202ENSMUST00000109820 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Kcnf1Q7TSH7 Ccng2-202ENSMUST00000121127 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Kcnf1Q7TSH7 Nxph1-201ENSMUST00000060369 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Kcnf1Q7TSH7 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Kcnf1Q7TSH7 Sorcs1-206ENSMUST00000209783 3489 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Kcnf1Q7TSH7 Gm44758-201ENSMUST00000206096 2068 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Kcnf1Q7TSH7 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Kcnf1Q7TSH7 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Kcnf1Q7TSH7 Gm15684-201ENSMUST00000160605 1814 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Kcnf1Q7TSH7 Reep3-201ENSMUST00000020023 5430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Kcnf1Q7TSH7 Cpped1-202ENSMUST00000096272 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Kcnf1Q7TSH7 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Kcnf1Q7TSH7 Alkbh4-201ENSMUST00000041100 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Kcnf1Q7TSH7 Ptger4-202ENSMUST00000120563 3312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Kcnf1Q7TSH7 Hspa4-201ENSMUST00000020630 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Kcnf1Q7TSH7 Mafk-202ENSMUST00000110836 3097 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Kcnf1Q7TSH7 Cdk7-201ENSMUST00000091299 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Kcnf1Q7TSH7 Evi5l-203ENSMUST00000176149 3938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Kcnf1Q7TSH7 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Kcnf1Q7TSH7 Suclg1-201ENSMUST00000064740 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Kcnf1Q7TSH7 Hells-201ENSMUST00000025965 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Kcnf1Q7TSH7 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Kcnf1Q7TSH7 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Kcnf1Q7TSH7 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Kcnf1Q7TSH7 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Kcnf1Q7TSH7 Clps-201ENSMUST00000025062 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Kcnf1Q7TSH7 Aspdh-201ENSMUST00000035929 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Kcnf1Q7TSH7 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Kcnf1Q7TSH7 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Kcnf1Q7TSH7 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Kcnf1Q7TSH7 Dgkg-201ENSMUST00000023578 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Kcnf1Q7TSH7 Ptgir-201ENSMUST00000086101 2725 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Kcnf1Q7TSH7 Wdr18-201ENSMUST00000045247 3911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Kcnf1Q7TSH7 Pex2-204ENSMUST00000165309 2038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Kcnf1Q7TSH7 Cep89-201ENSMUST00000079414 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Kcnf1Q7TSH7 Wdr54-205ENSMUST00000153148 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Kcnf1Q7TSH7 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Kcnf1Q7TSH7 BC055324-201ENSMUST00000045876 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Kcnf1Q7TSH7 Dgcr2-203ENSMUST00000117082 2987 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Kcnf1Q7TSH7 Ptprr-204ENSMUST00000128399 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Kcnf1Q7TSH7 Sirt4-201ENSMUST00000112066 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Kcnf1Q7TSH7 Gorasp1-201ENSMUST00000035099 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Kcnf1Q7TSH7 Snap23-203ENSMUST00000116437 2730 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Kcnf1Q7TSH7 Zkscan3-207ENSMUST00000223831 2101 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Kcnf1Q7TSH7 Rgs6-222ENSMUST00000202210 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Kcnf1Q7TSH7 Kalrn-210ENSMUST00000114964 2693 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Kcnf1Q7TSH7 Mmp28-202ENSMUST00000103209 3438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Kcnf1Q7TSH7 Tcf4-230ENSMUST00000201205 2270 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Kcnf1Q7TSH7 Trim9-209ENSMUST00000222316 3049 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Kcnf1Q7TSH7 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Kcnf1Q7TSH7 Orc2-201ENSMUST00000027198 3561 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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