Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDS0

Vstm2l, V-set and transmembrane domain-containing protein 2-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vstm2lQ6PDS0 Psmd2-201ENSMUST00000007212 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Vstm2lQ6PDS0 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Vstm2lQ6PDS0 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Vstm2lQ6PDS0 Kctd18-202ENSMUST00000114410 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Vstm2lQ6PDS0 Mutyh-201ENSMUST00000102699 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Vstm2lQ6PDS0 Spata5-209ENSMUST00000198968 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Vstm2lQ6PDS0 Lnx1-205ENSMUST00000117525 2259 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Vstm2lQ6PDS0 Ttc8-202ENSMUST00000085109 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Vstm2lQ6PDS0 Ralgapb-203ENSMUST00000109486 8383 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Vstm2lQ6PDS0 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Vstm2lQ6PDS0 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Vstm2lQ6PDS0 Opa3-201ENSMUST00000063976 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Vstm2lQ6PDS0 Sqle-201ENSMUST00000022977 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Vstm2lQ6PDS0 Gm21038-201ENSMUST00000222205 1383 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Vstm2lQ6PDS0 Tbc1d1-201ENSMUST00000043893 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Vstm2lQ6PDS0 Gm43156-201ENSMUST00000202338 2127 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Vstm2lQ6PDS0 Traf6-201ENSMUST00000004949 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Vstm2lQ6PDS0 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Vstm2lQ6PDS0 Dab2ip-206ENSMUST00000112987 6287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Vstm2lQ6PDS0 Bag6-203ENSMUST00000172571 3599 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Vstm2lQ6PDS0 Axdnd1-204ENSMUST00000178036 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Vstm2lQ6PDS0 Abat-203ENSMUST00000115839 2414 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Vstm2lQ6PDS0 Smarcb1-201ENSMUST00000000925 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Vstm2lQ6PDS0 Ero1lb-202ENSMUST00000220811 3341 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Vstm2lQ6PDS0 Orc6-202ENSMUST00000170141 1466 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Vstm2lQ6PDS0 Gm13848-201ENSMUST00000130777 2047 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Vstm2lQ6PDS0 Umad1-204ENSMUST00000159433 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Vstm2lQ6PDS0 Gm4297-201ENSMUST00000119285 2579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Vstm2lQ6PDS0 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Vstm2lQ6PDS0 0610010K14Rik-205ENSMUST00000108575 643 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Vstm2lQ6PDS0 Gm12341-201ENSMUST00000119724 503 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Vstm2lQ6PDS0 4930456L15Rik-201ENSMUST00000145577 1185 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Vstm2lQ6PDS0 1600025M17Rik-202ENSMUST00000151426 547 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Vstm2lQ6PDS0 Gm12840-201ENSMUST00000156081 627 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Vstm2lQ6PDS0 Flg-208ENSMUST00000180308 1076 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Vstm2lQ6PDS0 Mir6392-201ENSMUST00000184924 108 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Vstm2lQ6PDS0 Tspan3-203ENSMUST00000215906 842 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Vstm2lQ6PDS0 AC192088.1-201ENSMUST00000227561 301 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Vstm2lQ6PDS0 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Vstm2lQ6PDS0 Kmt5c-203ENSMUST00000108583 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Vstm2lQ6PDS0 Igha-202ENSMUST00000194738 2540 ntAPPRIS P5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Vstm2lQ6PDS0 Dnmt3b-205ENSMUST00000103150 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Vstm2lQ6PDS0 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Vstm2lQ6PDS0 Dnajc5g-201ENSMUST00000066544 1565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Vstm2lQ6PDS0 Stpg2-202ENSMUST00000106239 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Vstm2lQ6PDS0 Mpv17-201ENSMUST00000154241 1724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Vstm2lQ6PDS0 Tbkbp1-205ENSMUST00000118375 3288 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Vstm2lQ6PDS0 1700065D16Rik-205ENSMUST00000190890 2903 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Vstm2lQ6PDS0 Cox10-201ENSMUST00000049091 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Vstm2lQ6PDS0 Ugt1a5-201ENSMUST00000097659 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Vstm2lQ6PDS0 Xlr-202ENSMUST00000067782 1860 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Vstm2lQ6PDS0 Pxdn-202ENSMUST00000122328 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Vstm2lQ6PDS0 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Vstm2lQ6PDS0 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Vstm2lQ6PDS0 Rps7-ps2-201ENSMUST00000219719 1347 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Vstm2lQ6PDS0 Setd1b-206ENSMUST00000174836 7515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Vstm2lQ6PDS0 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Vstm2lQ6PDS0 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Vstm2lQ6PDS0 Hoxd3-202ENSMUST00000111982 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Vstm2lQ6PDS0 Slc25a14-201ENSMUST00000033431 1760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Vstm2lQ6PDS0 Lrrc29-201ENSMUST00000070508 1922 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Vstm2lQ6PDS0 Tpd52-206ENSMUST00000121038 849 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Vstm2lQ6PDS0 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Vstm2lQ6PDS0 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Vstm2lQ6PDS0 Fcrl1-204ENSMUST00000191666 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Vstm2lQ6PDS0 Smyd3-207ENSMUST00000194237 1047 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Vstm2lQ6PDS0 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Vstm2lQ6PDS0 Gm18624-201ENSMUST00000220966 658 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Vstm2lQ6PDS0 1700011B04Rik-206ENSMUST00000221013 824 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Vstm2lQ6PDS0 AC156560.2-201ENSMUST00000221232 264 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Vstm2lQ6PDS0 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Vstm2lQ6PDS0 Eapp-201ENSMUST00000067272 590 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Vstm2lQ6PDS0 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Vstm2lQ6PDS0 Tex13c3-201ENSMUST00000089246 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Vstm2lQ6PDS0 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Vstm2lQ6PDS0 Lrrc56-202ENSMUST00000070458 2502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Vstm2lQ6PDS0 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Vstm2lQ6PDS0 Zfpm2-201ENSMUST00000053467 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Vstm2lQ6PDS0 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Vstm2lQ6PDS0 Haus7-201ENSMUST00000033737 1380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Vstm2lQ6PDS0 Tbx4-201ENSMUST00000000096 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Vstm2lQ6PDS0 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Vstm2lQ6PDS0 Rnf40-202ENSMUST00000205694 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Vstm2lQ6PDS0 Nrp2-204ENSMUST00000102822 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Vstm2lQ6PDS0 Ptger3-201ENSMUST00000041175 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Vstm2lQ6PDS0 Dysf-201ENSMUST00000081904 6660 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Vstm2lQ6PDS0 Gpr19-204ENSMUST00000116515 2075 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Vstm2lQ6PDS0 Lpcat1-201ENSMUST00000022099 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Vstm2lQ6PDS0 Myh3-201ENSMUST00000007301 5992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Vstm2lQ6PDS0 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Vstm2lQ6PDS0 Lysmd4-201ENSMUST00000058771 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Vstm2lQ6PDS0 B430305J03Rik-201ENSMUST00000066298 3702 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Vstm2lQ6PDS0 Igsf5-202ENSMUST00000081093 1554 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Vstm2lQ6PDS0 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Vstm2lQ6PDS0 Oxr1-204ENSMUST00000110297 4596 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Vstm2lQ6PDS0 Plekha7-203ENSMUST00000181998 5149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Vstm2lQ6PDS0 AC154262.2-201ENSMUST00000224310 2293 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Vstm2lQ6PDS0 Cmip-201ENSMUST00000095172 2276 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Vstm2lQ6PDS0 Pde4a-203ENSMUST00000115458 2962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Vstm2lQ6PDS0 Gm12537-201ENSMUST00000119266 1002 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.9 ms