Protein–RNA interactions for Protein: Q6DFW0

Guanine nucleotide exchange C9orf72 homolog, mousemouse

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Length 481 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q6DFW0 Ndc80-201ENSMUST00000024851 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Q6DFW0 Wwox-201ENSMUST00000004756 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Q6DFW0 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Q6DFW0 Mtmr2-201ENSMUST00000034396 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Q6DFW0 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Q6DFW0 Bpi-203ENSMUST00000109500 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Q6DFW0 Efhc1-201ENSMUST00000038447 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Q6DFW0 Hp1bp3-201ENSMUST00000030541 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Q6DFW0 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Q6DFW0 Dsp-202ENSMUST00000127906 7761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Q6DFW0 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Q6DFW0 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Q6DFW0 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Q6DFW0 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Q6DFW0 Cmc4-203ENSMUST00000149863 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Q6DFW0 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Q6DFW0 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Q6DFW0 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Q6DFW0 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Q6DFW0 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Q6DFW0 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Q6DFW0 Gm44719-201ENSMUST00000206404 149 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Q6DFW0 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Q6DFW0 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Q6DFW0 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Q6DFW0 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Q6DFW0 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Q6DFW0 Mb21d1-201ENSMUST00000034898 3231 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Q6DFW0 Gabpb1-205ENSMUST00000110424 2613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Q6DFW0 Cnppd1-201ENSMUST00000041213 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Q6DFW0 Galnt6-202ENSMUST00000159715 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Q6DFW0 Tbc1d1-201ENSMUST00000043893 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Q6DFW0 Zfp977-201ENSMUST00000173283 1425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.18
Q6DFW0 Matr3-206ENSMUST00000187389 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
Q6DFW0 Sv2c-203ENSMUST00000182289 2197 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Q6DFW0 Pcbp3-203ENSMUST00000105411 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Q6DFW0 Oxa1l-201ENSMUST00000000985 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Q6DFW0 Il34-204ENSMUST00000150680 1796 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Q6DFW0 Hectd2-208ENSMUST00000169036 3842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Q6DFW0 Pdxk-ps-201ENSMUST00000159650 2342 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Q6DFW0 Hipk4-202ENSMUST00000108353 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Q6DFW0 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Q6DFW0 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Q6DFW0 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Q6DFW0 Mutyh-201ENSMUST00000102699 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Q6DFW0 Scarf1-201ENSMUST00000042808 2887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Q6DFW0 Phka1-203ENSMUST00000113611 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Q6DFW0 Phka1-205ENSMUST00000120270 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Q6DFW0 Trpm4-209ENSMUST00000211743 3673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Q6DFW0 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Q6DFW0 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Q6DFW0 Ciz1-203ENSMUST00000113332 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Q6DFW0 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Q6DFW0 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Q6DFW0 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Q6DFW0 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Q6DFW0 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Q6DFW0 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Q6DFW0 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Q6DFW0 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Q6DFW0 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Q6DFW0 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Q6DFW0 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Q6DFW0 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Q6DFW0 Sfpq-201ENSMUST00000030623 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Q6DFW0 Shroom1-201ENSMUST00000018531 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Q6DFW0 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Q6DFW0 Gpnmb-203ENSMUST00000204260 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Q6DFW0 Gm5422-202ENSMUST00000216161 2928 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Q6DFW0 Ampd2-202ENSMUST00000102637 3586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Q6DFW0 Gm36995-201ENSMUST00000126170 5727 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Q6DFW0 Akna-201ENSMUST00000035724 5387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Q6DFW0 Dnmt3b-208ENSMUST00000109772 4015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Q6DFW0 Pdlim5-208ENSMUST00000196220 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Q6DFW0 Twistnb-201ENSMUST00000020877 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Q6DFW0 Chfr-202ENSMUST00000112519 3159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Q6DFW0 Net1-201ENSMUST00000091853 2680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Q6DFW0 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Q6DFW0 Psmd8-207ENSMUST00000209034 1983 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Q6DFW0 Pik3cd-201ENSMUST00000038859 4905 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Q6DFW0 Caskin2-201ENSMUST00000041684 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Q6DFW0 Atrip-201ENSMUST00000045011 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Q6DFW0 Bcat1-202ENSMUST00000048252 1642 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Q6DFW0 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Q6DFW0 Kctd20-202ENSMUST00000117672 2219 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Q6DFW0 Trpc7-206ENSMUST00000173513 2241 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Q6DFW0 Tsku-204ENSMUST00000165901 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Q6DFW0 Psmd11-201ENSMUST00000017572 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Q6DFW0 Unc5d-204ENSMUST00000210785 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Q6DFW0 Map4k2-201ENSMUST00000025897 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Q6DFW0 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Q6DFW0 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Q6DFW0 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Q6DFW0 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Q6DFW0 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Q6DFW0 Ighv1-25-201ENSMUST00000195638 345 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Q6DFW0 4930502C17Rik-201ENSMUST00000200282 948 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Q6DFW0 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Q6DFW0 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Q6DFW0 Ptpn6-201ENSMUST00000004377 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
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