Protein–RNA interactions for Protein: Q68FH0

Pkp4, Plakophilin-4, mousemouse

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Length 1,190 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp4Q68FH0 Bscl2-206ENSMUST00000160556 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Pkp4Q68FH0 Gm9946-202ENSMUST00000162741 1580 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Pkp4Q68FH0 Gm34376-201ENSMUST00000218529 2107 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Pkp4Q68FH0 Paox-201ENSMUST00000026537 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Pkp4Q68FH0 Gucy2e-201ENSMUST00000021259 8331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Pkp4Q68FH0 Psmd11-201ENSMUST00000017572 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Pkp4Q68FH0 Hnrnpf-203ENSMUST00000167182 2271 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Pkp4Q68FH0 Gm13016-201ENSMUST00000126252 1720 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Pkp4Q68FH0 Nek6-203ENSMUST00000112902 3147 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Pkp4Q68FH0 Xlr-202ENSMUST00000067782 1860 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Pkp4Q68FH0 Sema3d-201ENSMUST00000030868 6307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Pkp4Q68FH0 D230025D16Rik-201ENSMUST00000034361 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Pkp4Q68FH0 Mdm2-201ENSMUST00000020408 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Pkp4Q68FH0 Gm996-204ENSMUST00000191602 4812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Pkp4Q68FH0 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Pkp4Q68FH0 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Pkp4Q68FH0 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Pkp4Q68FH0 Gm20479-201ENSMUST00000126587 556 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Pkp4Q68FH0 Ube4bos1-202ENSMUST00000151896 1286 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Pkp4Q68FH0 Gm9522-201ENSMUST00000182394 926 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Pkp4Q68FH0 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Pkp4Q68FH0 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Pkp4Q68FH0 Gm18041-201ENSMUST00000218210 618 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Pkp4Q68FH0 Gm30906-201ENSMUST00000219578 535 ntTSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Pkp4Q68FH0 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Pkp4Q68FH0 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Pkp4Q68FH0 1700018B08Rik-201ENSMUST00000034265 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Pkp4Q68FH0 Gm3695-201ENSMUST00000087222 1009 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Pkp4Q68FH0 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Pkp4Q68FH0 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Pkp4Q68FH0 Syngap1-201ENSMUST00000081285 4315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Pkp4Q68FH0 Gm13883-201ENSMUST00000150450 1404 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Pkp4Q68FH0 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Pkp4Q68FH0 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Pkp4Q68FH0 Spg7-202ENSMUST00000125975 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Pkp4Q68FH0 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Pkp4Q68FH0 Mdga1-201ENSMUST00000073556 7566 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Pkp4Q68FH0 9330162012Rik-201ENSMUST00000154919 3836 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Pkp4Q68FH0 Gm29455-201ENSMUST00000186504 2659 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Pkp4Q68FH0 Zfp236-201ENSMUST00000171071 9626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Pkp4Q68FH0 Cpxm2-201ENSMUST00000033149 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Pkp4Q68FH0 Decr2-201ENSMUST00000040907 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Pkp4Q68FH0 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Pkp4Q68FH0 Prrc2b-201ENSMUST00000036691 8612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Pkp4Q68FH0 Spsb1-201ENSMUST00000038562 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Pkp4Q68FH0 Gcfc2-201ENSMUST00000043195 4192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Pkp4Q68FH0 Catsper3-202ENSMUST00000109898 1311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Pkp4Q68FH0 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Pkp4Q68FH0 Rpusd2-201ENSMUST00000028796 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Pkp4Q68FH0 Arhgef17-201ENSMUST00000107032 10190 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Pkp4Q68FH0 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Pkp4Q68FH0 Gm13730-201ENSMUST00000121036 1462 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Pkp4Q68FH0 Gm16534-201ENSMUST00000149300 1492 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Pkp4Q68FH0 Arid4b-202ENSMUST00000110533 3020 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Pkp4Q68FH0 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Pkp4Q68FH0 Eno2-216ENSMUST00000204896 1640 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Pkp4Q68FH0 Luc7l3-202ENSMUST00000107820 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Pkp4Q68FH0 Hnrnpf-210ENSMUST00000180341 1922 ntAPPRIS P1 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Pkp4Q68FH0 Gm37844-201ENSMUST00000192473 4097 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Pkp4Q68FH0 Wwox-201ENSMUST00000004756 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Pkp4Q68FH0 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Pkp4Q68FH0 Slc6a21-206ENSMUST00000210861 2838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Pkp4Q68FH0 Polr2c-202ENSMUST00000211939 3881 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Pkp4Q68FH0 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Pkp4Q68FH0 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Pkp4Q68FH0 Clec16a-205ENSMUST00000115827 2949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Pkp4Q68FH0 Cpped1-203ENSMUST00000121750 2614 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Pkp4Q68FH0 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Pkp4Q68FH0 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Pkp4Q68FH0 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Pkp4Q68FH0 9330198N18Rik-201ENSMUST00000146702 1247 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Pkp4Q68FH0 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Pkp4Q68FH0 Gm4782-201ENSMUST00000168705 2046 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Pkp4Q68FH0 Ddi2-202ENSMUST00000177592 3539 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Pkp4Q68FH0 Gm37795-201ENSMUST00000194216 2459 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Pkp4Q68FH0 Olfr279-202ENSMUST00000205772 5330 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Pkp4Q68FH0 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Pkp4Q68FH0 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Pkp4Q68FH0 Olfr222-201ENSMUST00000071943 1115 ntAPPRIS P1 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Pkp4Q68FH0 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Pkp4Q68FH0 Jph2-201ENSMUST00000017961 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Pkp4Q68FH0 Ctbs-202ENSMUST00000061937 2892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Pkp4Q68FH0 Metap2-206ENSMUST00000180840 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Pkp4Q68FH0 Slc22a2-201ENSMUST00000046959 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Pkp4Q68FH0 AC161252.3-201ENSMUST00000225465 1549 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Pkp4Q68FH0 Zc3h7b-201ENSMUST00000109554 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Pkp4Q68FH0 Plk4-203ENSMUST00000203295 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Pkp4Q68FH0 5330406M23Rik-201ENSMUST00000195672 2094 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Pkp4Q68FH0 Gm9924-202ENSMUST00000192760 2311 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Pkp4Q68FH0 Dbndd1-203ENSMUST00000177240 1463 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Pkp4Q68FH0 Magi1-206ENSMUST00000203688 4969 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Pkp4Q68FH0 Grin1-202ENSMUST00000114307 4127 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Pkp4Q68FH0 Unc5d-204ENSMUST00000210785 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Pkp4Q68FH0 Arhgef2-208ENSMUST00000175911 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Pkp4Q68FH0 1600020E01Rik-206ENSMUST00000204663 2007 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Pkp4Q68FH0 Olfr61-202ENSMUST00000210241 1348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Pkp4Q68FH0 Fam131b-202ENSMUST00000095974 3992 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Pkp4Q68FH0 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Pkp4Q68FH0 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Pkp4Q68FH0 Nphp4-201ENSMUST00000056567 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
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