Protein–RNA interactions for Protein: Q61345

Foxd1, Forkhead box protein D1, mousemouse

Predictions only

Length 456 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxd1Q61345 Egfl7-211ENSMUST00000152988 723 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Foxd1Q61345 Gm7008-202ENSMUST00000170019 402 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Foxd1Q61345 Pagr1b-201ENSMUST00000172958 693 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Foxd1Q61345 Gm27023-201ENSMUST00000182372 285 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Foxd1Q61345 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Foxd1Q61345 Nras-208ENSMUST00000200069 831 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Foxd1Q61345 Gm18905-201ENSMUST00000205454 928 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Foxd1Q61345 Gm45186-201ENSMUST00000206874 478 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Foxd1Q61345 Ldha-213ENSMUST00000210631 685 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Foxd1Q61345 Gm18473-201ENSMUST00000220543 868 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Foxd1Q61345 Krtap19-9b-201ENSMUST00000077715 461 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Foxd1Q61345 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Foxd1Q61345 Tmem19-203ENSMUST00000217884 2799 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Foxd1Q61345 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Foxd1Q61345 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Foxd1Q61345 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Foxd1Q61345 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Foxd1Q61345 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Foxd1Q61345 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Foxd1Q61345 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Foxd1Q61345 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Foxd1Q61345 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Foxd1Q61345 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Foxd1Q61345 Prkg1-202ENSMUST00000073581 2841 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Foxd1Q61345 Mob3c-201ENSMUST00000030477 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Foxd1Q61345 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Foxd1Q61345 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Foxd1Q61345 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Foxd1Q61345 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Foxd1Q61345 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Foxd1Q61345 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Foxd1Q61345 Pax7-202ENSMUST00000174681 1725 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Foxd1Q61345 Fbxw7-201ENSMUST00000029727 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Foxd1Q61345 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Foxd1Q61345 Gm15440-201ENSMUST00000110042 1231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Foxd1Q61345 Rfc4-202ENSMUST00000115337 416 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Foxd1Q61345 Gm12715-201ENSMUST00000121430 1128 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Foxd1Q61345 Sumo3-206ENSMUST00000141228 772 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Foxd1Q61345 Dgcr6-203ENSMUST00000143343 1280 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Foxd1Q61345 Gm4271-201ENSMUST00000174444 973 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Foxd1Q61345 Gm5051-201ENSMUST00000204085 485 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Foxd1Q61345 Rfxank-203ENSMUST00000212320 1121 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Foxd1Q61345 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Foxd1Q61345 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Foxd1Q61345 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Foxd1Q61345 BC039966-201ENSMUST00000141582 1371 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Foxd1Q61345 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Foxd1Q61345 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Foxd1Q61345 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Foxd1Q61345 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Foxd1Q61345 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Foxd1Q61345 Chchd10-203ENSMUST00000219839 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Foxd1Q61345 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Foxd1Q61345 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Foxd1Q61345 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Foxd1Q61345 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Foxd1Q61345 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Foxd1Q61345 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Foxd1Q61345 Gm29358-201ENSMUST00000186510 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Foxd1Q61345 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Foxd1Q61345 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Foxd1Q61345 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Foxd1Q61345 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Foxd1Q61345 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Foxd1Q61345 Gm26565-201ENSMUST00000181642 1968 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Foxd1Q61345 Spats2l-203ENSMUST00000164302 2088 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Foxd1Q61345 Gm10961-201ENSMUST00000106703 144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Foxd1Q61345 Gm9083-201ENSMUST00000120423 819 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Foxd1Q61345 Rpsa-ps12-201ENSMUST00000120596 892 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Foxd1Q61345 Mir6958-201ENSMUST00000184207 73 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Foxd1Q61345 Gm45118-201ENSMUST00000208928 825 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Foxd1Q61345 1700112L15Rik-201ENSMUST00000212067 510 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Foxd1Q61345 Tescl-201ENSMUST00000069562 855 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Foxd1Q61345 Prss2-201ENSMUST00000070380 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Foxd1Q61345 Krtap6-5-201ENSMUST00000074637 600 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Foxd1Q61345 Gm10268-201ENSMUST00000085340 555 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Foxd1Q61345 Egfl7-201ENSMUST00000100290 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Foxd1Q61345 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Foxd1Q61345 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Foxd1Q61345 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Foxd1Q61345 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Foxd1Q61345 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Foxd1Q61345 Gm10787-201ENSMUST00000099552 1548 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Foxd1Q61345 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Foxd1Q61345 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Foxd1Q61345 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Foxd1Q61345 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Foxd1Q61345 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Foxd1Q61345 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Foxd1Q61345 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Foxd1Q61345 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Foxd1Q61345 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Foxd1Q61345 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Foxd1Q61345 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Foxd1Q61345 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Foxd1Q61345 Ntrk2-209ENSMUST00000225950 2640 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Foxd1Q61345 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Foxd1Q61345 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Foxd1Q61345 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Foxd1Q61345 Clic3-202ENSMUST00000114265 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.1 ms