Protein–RNA interactions for Protein: Q5SWD9

Tsr1, Pre-rRNA-processing protein TSR1 homolog, mousemouse

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Length 803 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tsr1Q5SWD9 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
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Tsr1Q5SWD9 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tsr1Q5SWD9 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tsr1Q5SWD9 Spef1-202ENSMUST00000110218 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tsr1Q5SWD9 Cyfip1-201ENSMUST00000032629 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tsr1Q5SWD9 Gm26551-201ENSMUST00000181262 2432 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tsr1Q5SWD9 Parp2-201ENSMUST00000036126 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tsr1Q5SWD9 Phactr3-202ENSMUST00000103066 2680 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tsr1Q5SWD9 Mest-202ENSMUST00000124665 2665 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tsr1Q5SWD9 Gm43435-201ENSMUST00000199996 1438 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Tsr1Q5SWD9 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tsr1Q5SWD9 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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Tsr1Q5SWD9 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tsr1Q5SWD9 Plagl1-202ENSMUST00000121646 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.07
Tsr1Q5SWD9 Shroom1-201ENSMUST00000018531 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tsr1Q5SWD9 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tsr1Q5SWD9 Scg3-202ENSMUST00000213324 2152 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tsr1Q5SWD9 Mdga2-201ENSMUST00000037181 9833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tsr1Q5SWD9 Oas1e-201ENSMUST00000100785 1801 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tsr1Q5SWD9 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tsr1Q5SWD9 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tsr1Q5SWD9 Cpeb4-201ENSMUST00000020543 2312 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tsr1Q5SWD9 Scyl3-201ENSMUST00000027876 4368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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Tsr1Q5SWD9 Gm7745-202ENSMUST00000222914 567 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tsr1Q5SWD9 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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Tsr1Q5SWD9 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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Tsr1Q5SWD9 Tbr1-201ENSMUST00000048934 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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Tsr1Q5SWD9 Dgcr14-201ENSMUST00000003621 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tsr1Q5SWD9 Mpv17-201ENSMUST00000154241 1724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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Tsr1Q5SWD9 Tspan32-206ENSMUST00000105925 1376 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tsr1Q5SWD9 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tsr1Q5SWD9 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tsr1Q5SWD9 Chrdl1-203ENSMUST00000112878 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tsr1Q5SWD9 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tsr1Q5SWD9 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Tsr1Q5SWD9 Hadhb-202ENSMUST00000114783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tsr1Q5SWD9 Gm649-201ENSMUST00000117284 1054 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Tsr1Q5SWD9 Gm5385-201ENSMUST00000118988 1559 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Tsr1Q5SWD9 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tsr1Q5SWD9 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tsr1Q5SWD9 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tsr1Q5SWD9 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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