Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSN7

Sft2d1, Vesicle transport protein SFT2A, mousemouse

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sft2d1Q5SSN7 Ylpm1-202ENSMUST00000101202 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Sft2d1Q5SSN7 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
Sft2d1Q5SSN7 Lnx1-205ENSMUST00000117525 2259 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Sft2d1Q5SSN7 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Sft2d1Q5SSN7 Sorcs1-201ENSMUST00000072685 4396 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Sft2d1Q5SSN7 Tnfaip8-207ENSMUST00000148159 1921 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Sft2d1Q5SSN7 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Sft2d1Q5SSN7 Thtpa-201ENSMUST00000050575 2830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Sft2d1Q5SSN7 Acbd5-213ENSMUST00000227809 1986 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Sft2d1Q5SSN7 E2f7-209ENSMUST00000174857 2865 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Sft2d1Q5SSN7 Wnt9a-202ENSMUST00000108783 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Sft2d1Q5SSN7 Pphln1-202ENSMUST00000068457 3816 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Sft2d1Q5SSN7 Hnrnpk-202ENSMUST00000116403 2970 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Sft2d1Q5SSN7 Slc22a5-201ENSMUST00000019044 3062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Sft2d1Q5SSN7 Pigc-201ENSMUST00000028021 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Sft2d1Q5SSN7 Gm38569-201ENSMUST00000205476 2228 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Sft2d1Q5SSN7 Armc6-201ENSMUST00000019679 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Sft2d1Q5SSN7 Lrrc30-201ENSMUST00000097290 1759 ntAPPRIS P1 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Sft2d1Q5SSN7 Pik3cd-206ENSMUST00000122059 4832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Sft2d1Q5SSN7 Gosr2-202ENSMUST00000107013 1044 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Sft2d1Q5SSN7 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Sft2d1Q5SSN7 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Sft2d1Q5SSN7 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Sft2d1Q5SSN7 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Sft2d1Q5SSN7 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Sft2d1Q5SSN7 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Sft2d1Q5SSN7 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Sft2d1Q5SSN7 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Sft2d1Q5SSN7 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Sft2d1Q5SSN7 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Sft2d1Q5SSN7 Kcnh6-202ENSMUST00000106903 2816 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Sft2d1Q5SSN7 Mettl27-201ENSMUST00000047196 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Sft2d1Q5SSN7 Vmn1r45-202ENSMUST00000226167 2893 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Sft2d1Q5SSN7 Rasl12-201ENSMUST00000085453 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Sft2d1Q5SSN7 Alpk3-201ENSMUST00000107348 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Sft2d1Q5SSN7 Chpf2-202ENSMUST00000121863 3715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Sft2d1Q5SSN7 4930563D23Rik-201ENSMUST00000062638 2646 ntAPPRIS P1 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Sft2d1Q5SSN7 Map3k11-201ENSMUST00000004156 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Sft2d1Q5SSN7 AC154404.1-201ENSMUST00000223601 2077 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Sft2d1Q5SSN7 Mfsd14b-201ENSMUST00000054730 3251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Sft2d1Q5SSN7 Adam19-201ENSMUST00000011400 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Sft2d1Q5SSN7 Col14a1-201ENSMUST00000023053 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Sft2d1Q5SSN7 Rcbtb2-202ENSMUST00000110952 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Sft2d1Q5SSN7 Epha5-202ENSMUST00000113398 4830 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Sft2d1Q5SSN7 Jmjd8-205ENSMUST00000133595 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Sft2d1Q5SSN7 Hltf-201ENSMUST00000002502 4955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Sft2d1Q5SSN7 Gm26677-201ENSMUST00000180553 1672 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Sft2d1Q5SSN7 Arhgef39-201ENSMUST00000054538 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Sft2d1Q5SSN7 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Sft2d1Q5SSN7 Mff-201ENSMUST00000073025 1706 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Sft2d1Q5SSN7 Polr2c-202ENSMUST00000211939 3881 ntTSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Sft2d1Q5SSN7 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Sft2d1Q5SSN7 Cd33-202ENSMUST00000039861 1791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Sft2d1Q5SSN7 Mamdc4-202ENSMUST00000114223 3998 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Sft2d1Q5SSN7 Mmp21-201ENSMUST00000033278 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Sft2d1Q5SSN7 Nrd1-201ENSMUST00000065977 4311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Sft2d1Q5SSN7 Nek1-209ENSMUST00000211672 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Sft2d1Q5SSN7 Tnk1-201ENSMUST00000001626 2778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Sft2d1Q5SSN7 Gm4782-201ENSMUST00000168705 2046 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Sft2d1Q5SSN7 Myh2-203ENSMUST00000170159 6083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Sft2d1Q5SSN7 Rnf17-202ENSMUST00000223627 2077 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Sft2d1Q5SSN7 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Sft2d1Q5SSN7 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Sft2d1Q5SSN7 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Sft2d1Q5SSN7 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Sft2d1Q5SSN7 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Sft2d1Q5SSN7 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Sft2d1Q5SSN7 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Sft2d1Q5SSN7 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Sft2d1Q5SSN7 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Sft2d1Q5SSN7 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Sft2d1Q5SSN7 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Sft2d1Q5SSN7 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Sft2d1Q5SSN7 Heatr3-202ENSMUST00000121949 3086 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Sft2d1Q5SSN7 Wnt3-201ENSMUST00000000127 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Sft2d1Q5SSN7 Cdc37l1-208ENSMUST00000225310 4079 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Sft2d1Q5SSN7 Slc24a4-201ENSMUST00000079020 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Sft2d1Q5SSN7 Ap3m2-201ENSMUST00000163739 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Sft2d1Q5SSN7 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Sft2d1Q5SSN7 Sqle-202ENSMUST00000100640 2636 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Sft2d1Q5SSN7 Gsn-201ENSMUST00000028239 2653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Sft2d1Q5SSN7 Zfp354c-201ENSMUST00000000632 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Sft2d1Q5SSN7 Cog1-201ENSMUST00000018805 3935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Sft2d1Q5SSN7 Rbm39-203ENSMUST00000109587 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Sft2d1Q5SSN7 9130011E15Rik-201ENSMUST00000045396 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Sft2d1Q5SSN7 Shroom1-202ENSMUST00000093114 2886 ntTSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Sft2d1Q5SSN7 Fchsd1-201ENSMUST00000043437 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Sft2d1Q5SSN7 Rbm14-201ENSMUST00000006625 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Sft2d1Q5SSN7 Slc7a4-202ENSMUST00000090165 1907 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Sft2d1Q5SSN7 Gm11476-201ENSMUST00000127006 2019 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Sft2d1Q5SSN7 BB123696-201ENSMUST00000222580 2056 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Sft2d1Q5SSN7 Myo15b-208ENSMUST00000222123 5154 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Sft2d1Q5SSN7 Gm38385-201ENSMUST00000194454 2351 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Sft2d1Q5SSN7 Vash2-201ENSMUST00000047409 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Sft2d1Q5SSN7 Dennd2d-201ENSMUST00000029508 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Sft2d1Q5SSN7 Ighg1-202ENSMUST00000194304 2482 ntAPPRIS P5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Sft2d1Q5SSN7 Cacna1c-201ENSMUST00000075591 7584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Sft2d1Q5SSN7 Sphk2-203ENSMUST00000210060 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Sft2d1Q5SSN7 Gm4755-201ENSMUST00000181803 2647 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Sft2d1Q5SSN7 Mrvi1-201ENSMUST00000005751 6198 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.4 ms