Protein–RNA interactions for Protein: Q5DTT8

Pnma5, Paraneoplastic antigen-like protein 5, mousemouse

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Length 618 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pnma5Q5DTT8 Isg20-202ENSMUST00000118867 697 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Pnma5Q5DTT8 A530058N18Rik-202ENSMUST00000134129 411 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Pnma5Q5DTT8 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pnma5Q5DTT8 Gm15851-201ENSMUST00000160564 662 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Pnma5Q5DTT8 Zfp414-204ENSMUST00000166627 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pnma5Q5DTT8 Spag7-201ENSMUST00000018431 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pnma5Q5DTT8 Gm38223-201ENSMUST00000194484 695 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Pnma5Q5DTT8 Gm45668-201ENSMUST00000211271 493 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Pnma5Q5DTT8 Zfp414-201ENSMUST00000073570 1197 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pnma5Q5DTT8 Uhrf1bp1l-201ENSMUST00000020112 6448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pnma5Q5DTT8 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Pnma5Q5DTT8 Adsl-206ENSMUST00000168756 1439 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Pnma5Q5DTT8 Gak-201ENSMUST00000046603 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pnma5Q5DTT8 Klhl18-203ENSMUST00000198164 4538 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pnma5Q5DTT8 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pnma5Q5DTT8 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Pnma5Q5DTT8 Cxadr-202ENSMUST00000114229 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pnma5Q5DTT8 Hnrnpc-211ENSMUST00000228748 1691 ntAPPRIS P5 BASIC15.06■□□□□ 0
Pnma5Q5DTT8 Fscn2-201ENSMUST00000026445 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pnma5Q5DTT8 Glipr2-202ENSMUST00000107855 1816 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Pnma5Q5DTT8 Herpud1-205ENSMUST00000161576 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Pnma5Q5DTT8 Gemin5-205ENSMUST00000172035 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Pnma5Q5DTT8 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Pnma5Q5DTT8 Gm14963-201ENSMUST00000146751 2558 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Pnma5Q5DTT8 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Pnma5Q5DTT8 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Pnma5Q5DTT8 Arhgap20-201ENSMUST00000065496 7161 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Pnma5Q5DTT8 Ptpn11-202ENSMUST00000100770 5599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pnma5Q5DTT8 Rdh10-201ENSMUST00000027053 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pnma5Q5DTT8 Unc119b-201ENSMUST00000060798 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pnma5Q5DTT8 Tomm5-204ENSMUST00000107810 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pnma5Q5DTT8 Ndufa13-201ENSMUST00000110167 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pnma5Q5DTT8 Gm15678-201ENSMUST00000117573 960 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Pnma5Q5DTT8 Gm15821-201ENSMUST00000121995 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pnma5Q5DTT8 Gm16000-201ENSMUST00000146657 447 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Pnma5Q5DTT8 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pnma5Q5DTT8 Mir6392-201ENSMUST00000184924 108 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Pnma5Q5DTT8 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pnma5Q5DTT8 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
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Pnma5Q5DTT8 Tmem116-201ENSMUST00000031405 1288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pnma5Q5DTT8 Hilpda-201ENSMUST00000054445 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pnma5Q5DTT8 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Pnma5Q5DTT8 Fam19a2-201ENSMUST00000050756 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
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Pnma5Q5DTT8 Nol4-208ENSMUST00000164893 2175 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
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Pnma5Q5DTT8 Arfgap1-205ENSMUST00000108862 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
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Pnma5Q5DTT8 Tcirg1-211ENSMUST00000145791 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pnma5Q5DTT8 Ddx27-201ENSMUST00000018143 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pnma5Q5DTT8 Myef2-207ENSMUST00000147105 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pnma5Q5DTT8 1700065D16Rik-205ENSMUST00000190890 2903 ntBASIC15.05■□□□□ -0
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Pnma5Q5DTT8 Coq4-201ENSMUST00000028137 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pnma5Q5DTT8 Gm28386-201ENSMUST00000189147 1849 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Pnma5Q5DTT8 Cd81-201ENSMUST00000037941 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pnma5Q5DTT8 Fam71f1-204ENSMUST00000166462 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pnma5Q5DTT8 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
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Pnma5Q5DTT8 Rcsd1-201ENSMUST00000040357 2622 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pnma5Q5DTT8 4930470G03Rik-201ENSMUST00000122926 2447 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pnma5Q5DTT8 Lypd6-201ENSMUST00000053208 3620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pnma5Q5DTT8 Slc22a2-201ENSMUST00000046959 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pnma5Q5DTT8 Gm7899-201ENSMUST00000192935 1897 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Pnma5Q5DTT8 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Pnma5Q5DTT8 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pnma5Q5DTT8 Radil-204ENSMUST00000110785 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
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Pnma5Q5DTT8 Ccser2-202ENSMUST00000090024 7509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pnma5Q5DTT8 Mks1-201ENSMUST00000038196 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pnma5Q5DTT8 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Pnma5Q5DTT8 Pla2g5-204ENSMUST00000102513 2289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Pnma5Q5DTT8 Hnrnpf-203ENSMUST00000167182 2271 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
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Pnma5Q5DTT8 0610010K14Rik-205ENSMUST00000108575 643 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Pnma5Q5DTT8 Gm15371-201ENSMUST00000117057 784 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Pnma5Q5DTT8 Gm16342-201ENSMUST00000124025 1025 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Pnma5Q5DTT8 Gm16973-201ENSMUST00000180682 1299 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pnma5Q5DTT8 Gm20753-201ENSMUST00000190105 545 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pnma5Q5DTT8 Gm19324-201ENSMUST00000213229 1169 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Pnma5Q5DTT8 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Pnma5Q5DTT8 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pnma5Q5DTT8 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.2 ms