Protein–RNA interactions for Protein: Q4KL78

Khdc1c, KH homology domain-containing protein 1C, mousemouse

Predictions only

Length 166 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Khdc1cQ4KL78 Zkscan14-203ENSMUST00000198959 2243 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Khdc1cQ4KL78 Arhgef37-201ENSMUST00000171629 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Khdc1cQ4KL78 Sde2-201ENSMUST00000038091 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Khdc1cQ4KL78 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Khdc1cQ4KL78 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Khdc1cQ4KL78 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Khdc1cQ4KL78 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Khdc1cQ4KL78 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Khdc1cQ4KL78 Gm29741-201ENSMUST00000192667 421 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Khdc1cQ4KL78 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Khdc1cQ4KL78 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Khdc1cQ4KL78 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Khdc1cQ4KL78 AC139350.3-201ENSMUST00000226151 420 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Khdc1cQ4KL78 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Khdc1cQ4KL78 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Khdc1cQ4KL78 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Khdc1cQ4KL78 Dcc-202ENSMUST00000114943 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Khdc1cQ4KL78 Gm7899-201ENSMUST00000192935 1897 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Khdc1cQ4KL78 Rfx1-204ENSMUST00000211046 3677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Khdc1cQ4KL78 Pcnt-202ENSMUST00000217838 9341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Khdc1cQ4KL78 Gm37324-201ENSMUST00000194500 4504 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Khdc1cQ4KL78 H3f3b-202ENSMUST00000106454 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Khdc1cQ4KL78 Cpeb4-201ENSMUST00000020543 2312 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Khdc1cQ4KL78 Tnfaip8-207ENSMUST00000148159 1921 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Khdc1cQ4KL78 Rbmx2-201ENSMUST00000033433 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Khdc1cQ4KL78 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Khdc1cQ4KL78 Usp3-205ENSMUST00000127569 5607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Khdc1cQ4KL78 Slc33a1-201ENSMUST00000029402 3150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Khdc1cQ4KL78 Sp2-201ENSMUST00000062652 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Khdc1cQ4KL78 Acsf3-203ENSMUST00000212790 2171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Khdc1cQ4KL78 AC154725.1-201ENSMUST00000224826 1961 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Khdc1cQ4KL78 Cog1-201ENSMUST00000018805 3935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Khdc1cQ4KL78 Acacb-201ENSMUST00000031583 8482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Khdc1cQ4KL78 D030025P21Rik-202ENSMUST00000220643 3987 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Khdc1cQ4KL78 Clpb-201ENSMUST00000001884 4627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Khdc1cQ4KL78 Dao-203ENSMUST00000161610 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Khdc1cQ4KL78 Sh3bp2-207ENSMUST00000179943 2935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Khdc1cQ4KL78 Epb41l1-203ENSMUST00000103136 6249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Khdc1cQ4KL78 H2-Q6-202ENSMUST00000174699 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Khdc1cQ4KL78 Pcbp3-203ENSMUST00000105411 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Khdc1cQ4KL78 Gm42748-201ENSMUST00000199354 2341 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Khdc1cQ4KL78 Cdc37-201ENSMUST00000019615 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Khdc1cQ4KL78 Uimc1-202ENSMUST00000099496 1678 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Khdc1cQ4KL78 Baiap3-202ENSMUST00000182056 4645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Khdc1cQ4KL78 Eif4g3-204ENSMUST00000105830 3252 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Khdc1cQ4KL78 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Khdc1cQ4KL78 Tmem266-202ENSMUST00000085754 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Khdc1cQ4KL78 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Khdc1cQ4KL78 4933431E20Rik-201ENSMUST00000131345 5407 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Khdc1cQ4KL78 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Khdc1cQ4KL78 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Khdc1cQ4KL78 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Khdc1cQ4KL78 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Khdc1cQ4KL78 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Khdc1cQ4KL78 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC10□□□□□ -0.81
Khdc1cQ4KL78 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Khdc1cQ4KL78 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Khdc1cQ4KL78 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Khdc1cQ4KL78 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Khdc1cQ4KL78 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
Khdc1cQ4KL78 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Khdc1cQ4KL78 Tfdp2-203ENSMUST00000165768 2212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Khdc1cQ4KL78 Otud7b-202ENSMUST00000090785 8101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Khdc1cQ4KL78 Zyg11a-203ENSMUST00000223127 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Khdc1cQ4KL78 Cap2-201ENSMUST00000021802 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Khdc1cQ4KL78 Dmp1-201ENSMUST00000066708 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Khdc1cQ4KL78 Nrf1-210ENSMUST00000115211 3295 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Khdc1cQ4KL78 Rtn4rl1-201ENSMUST00000102514 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Khdc1cQ4KL78 Lgals8-203ENSMUST00000124888 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Khdc1cQ4KL78 Irf1-202ENSMUST00000108920 2137 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Khdc1cQ4KL78 Slc38a11-201ENSMUST00000112420 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Khdc1cQ4KL78 Syt2-204ENSMUST00000188842 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Khdc1cQ4KL78 Kctd11-201ENSMUST00000050555 3146 ntAPPRIS P1 BASIC10□□□□□ -0.81
Khdc1cQ4KL78 Rlbp1-201ENSMUST00000053718 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Khdc1cQ4KL78 Plcg1-202ENSMUST00000103115 4435 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Khdc1cQ4KL78 Sv2c-203ENSMUST00000182289 2197 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Khdc1cQ4KL78 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Khdc1cQ4KL78 Bpi-203ENSMUST00000109500 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Khdc1cQ4KL78 Sgk3-202ENSMUST00000166384 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Khdc1cQ4KL78 Cebpd-201ENSMUST00000096232 3746 ntAPPRIS P1 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Khdc1cQ4KL78 Ifi47-201ENSMUST00000046704 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Khdc1cQ4KL78 Klhl26-205ENSMUST00000210250 2974 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Khdc1cQ4KL78 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Khdc1cQ4KL78 Ctgf-203ENSMUST00000176228 2490 ntTSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Khdc1cQ4KL78 Tsku-204ENSMUST00000165901 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Khdc1cQ4KL78 Gm39377-201ENSMUST00000214587 2533 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Khdc1cQ4KL78 Hnrnpf-203ENSMUST00000167182 2271 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Khdc1cQ4KL78 Astl-202ENSMUST00000089673 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Khdc1cQ4KL78 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Khdc1cQ4KL78 Lmbr1-203ENSMUST00000196321 3422 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Khdc1cQ4KL78 Shroom1-201ENSMUST00000018531 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Khdc1cQ4KL78 Cox10-201ENSMUST00000049091 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Khdc1cQ4KL78 Phkg1-201ENSMUST00000026617 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Khdc1cQ4KL78 AC149222.1-201ENSMUST00000154987 5188 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Khdc1cQ4KL78 Arhgef15-203ENSMUST00000108671 4372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Khdc1cQ4KL78 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Khdc1cQ4KL78 Gm10327-201ENSMUST00000105222 1002 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Khdc1cQ4KL78 Sgsm3-208ENSMUST00000139517 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Khdc1cQ4KL78 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Khdc1cQ4KL78 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.2 ms