Protein–RNA interactions for Protein: Q3ZT31

Snx25, Sorting nexin-25, mousemouse

Predictions only

Length 840 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx25Q3ZT31 Tnni1-205ENSMUST00000148201 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Snx25Q3ZT31 Tnni1-206ENSMUST00000152075 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Snx25Q3ZT31 Tnni1-207ENSMUST00000152208 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Snx25Q3ZT31 Gm6460-202ENSMUST00000163787 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Snx25Q3ZT31 Gm8879-201ENSMUST00000170260 1125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Snx25Q3ZT31 4933402N22Rik-202ENSMUST00000170301 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Snx25Q3ZT31 Otx2os1-202ENSMUST00000183803 743 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Snx25Q3ZT31 Gm27486-201ENSMUST00000184923 80 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Snx25Q3ZT31 Gm8463-201ENSMUST00000208573 613 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Snx25Q3ZT31 Gm867-202ENSMUST00000219979 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Snx25Q3ZT31 Gm17330-201ENSMUST00000221047 165 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Snx25Q3ZT31 2310002L09Rik-201ENSMUST00000030101 958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Snx25Q3ZT31 Rhox2e-201ENSMUST00000072167 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Snx25Q3ZT31 Ppp1r14d-201ENSMUST00000076084 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Snx25Q3ZT31 Ifi27-202ENSMUST00000076702 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Snx25Q3ZT31 Camkmt-201ENSMUST00000095188 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Snx25Q3ZT31 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Snx25Q3ZT31 Atp6ap1-201ENSMUST00000019231 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Snx25Q3ZT31 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Snx25Q3ZT31 Map2k7-203ENSMUST00000110994 1600 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Snx25Q3ZT31 Ppip5k2-202ENSMUST00000112845 6239 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Snx25Q3ZT31 H2-Q6-202ENSMUST00000174699 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Snx25Q3ZT31 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Snx25Q3ZT31 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Snx25Q3ZT31 Bend7-201ENSMUST00000056914 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Snx25Q3ZT31 Gm5912-201ENSMUST00000122282 1438 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Snx25Q3ZT31 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Snx25Q3ZT31 4933415J04Rik-201ENSMUST00000195895 1301 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Snx25Q3ZT31 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Snx25Q3ZT31 Cxadr-202ENSMUST00000114229 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Snx25Q3ZT31 Coro6-205ENSMUST00000108391 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Snx25Q3ZT31 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Snx25Q3ZT31 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Snx25Q3ZT31 Rtn3-203ENSMUST00000088169 1709 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Snx25Q3ZT31 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Snx25Q3ZT31 Mapt-201ENSMUST00000100347 1362 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Snx25Q3ZT31 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Snx25Q3ZT31 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Snx25Q3ZT31 Sema3d-201ENSMUST00000030868 6307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Snx25Q3ZT31 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Snx25Q3ZT31 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Snx25Q3ZT31 Mmp21-201ENSMUST00000033278 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Snx25Q3ZT31 Gm5303-201ENSMUST00000117943 1252 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Snx25Q3ZT31 Gm11592-201ENSMUST00000133160 637 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Snx25Q3ZT31 Far2os1-201ENSMUST00000162391 555 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Snx25Q3ZT31 Gm17870-201ENSMUST00000219489 1174 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Snx25Q3ZT31 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Snx25Q3ZT31 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Snx25Q3ZT31 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Snx25Q3ZT31 Gm10371-201ENSMUST00000127429 1411 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Snx25Q3ZT31 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Snx25Q3ZT31 Kmt5c-203ENSMUST00000108583 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Snx25Q3ZT31 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Snx25Q3ZT31 Grb2-203ENSMUST00000106497 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Snx25Q3ZT31 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Snx25Q3ZT31 Gpr85-201ENSMUST00000060442 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Snx25Q3ZT31 Evi5l-203ENSMUST00000176149 3938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Snx25Q3ZT31 AL645783.1-201ENSMUST00000221416 1832 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Snx25Q3ZT31 Msantd3-201ENSMUST00000061135 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Snx25Q3ZT31 Ddx27-201ENSMUST00000018143 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Snx25Q3ZT31 Gm13730-201ENSMUST00000121036 1462 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Snx25Q3ZT31 Prkce-202ENSMUST00000097275 6254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Snx25Q3ZT31 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Snx25Q3ZT31 Txn2-203ENSMUST00000109747 1778 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Snx25Q3ZT31 Nfe2-207ENSMUST00000134554 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Snx25Q3ZT31 As3mt-201ENSMUST00000003655 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Snx25Q3ZT31 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Snx25Q3ZT31 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Snx25Q3ZT31 Stk38-202ENSMUST00000119274 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Snx25Q3ZT31 Spon1-201ENSMUST00000046687 6161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Snx25Q3ZT31 Cpeb4-201ENSMUST00000020543 2312 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Snx25Q3ZT31 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Snx25Q3ZT31 Smarcb1-201ENSMUST00000000925 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Snx25Q3ZT31 Dlk1-202ENSMUST00000109841 879 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Snx25Q3ZT31 Pax5-206ENSMUST00000134968 969 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Snx25Q3ZT31 Gm13112-201ENSMUST00000138795 1258 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Snx25Q3ZT31 Nat8f4-202ENSMUST00000159755 1129 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Snx25Q3ZT31 Gm29608-201ENSMUST00000190444 463 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Snx25Q3ZT31 Gm7067-201ENSMUST00000207698 1249 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Snx25Q3ZT31 Gm34030-202ENSMUST00000211434 1126 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Snx25Q3ZT31 AC073947.2-201ENSMUST00000215888 1130 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Snx25Q3ZT31 Mrps17-201ENSMUST00000042191 832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Snx25Q3ZT31 Hspb2-201ENSMUST00000042790 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Snx25Q3ZT31 Fkbp2-201ENSMUST00000070878 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Snx25Q3ZT31 Olfr142-201ENSMUST00000099752 918 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Snx25Q3ZT31 Sox11-201ENSMUST00000079063 8311 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Snx25Q3ZT31 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Snx25Q3ZT31 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Snx25Q3ZT31 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Snx25Q3ZT31 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Snx25Q3ZT31 Ap5z1-202ENSMUST00000196055 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Snx25Q3ZT31 Trpm4-201ENSMUST00000042194 4234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Snx25Q3ZT31 Hcrtr1-202ENSMUST00000119423 2439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Snx25Q3ZT31 Epb41l5-208ENSMUST00000191046 6870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Snx25Q3ZT31 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Snx25Q3ZT31 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Snx25Q3ZT31 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Snx25Q3ZT31 Kcnt1-204ENSMUST00000114176 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Snx25Q3ZT31 Itgb4-203ENSMUST00000106458 5779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Snx25Q3ZT31 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.6 ms