Protein–RNA interactions for Protein: Q3V129

Ulk4, Serine/threonine-protein kinase ULK4, mousemouse

Predictions only

Length 1,303 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ulk4Q3V129 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ulk4Q3V129 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ulk4Q3V129 E430024P14Rik-203ENSMUST00000160545 2833 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ulk4Q3V129 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ulk4Q3V129 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ulk4Q3V129 Gm11400-201ENSMUST00000120853 1214 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Ulk4Q3V129 Sbk3-201ENSMUST00000133272 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ulk4Q3V129 Gm22331-201ENSMUST00000158066 136 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Ulk4Q3V129 Ssr4-208ENSMUST00000166518 800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ulk4Q3V129 Aif1-206ENSMUST00000173324 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ulk4Q3V129 Gm26721-201ENSMUST00000181723 992 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ulk4Q3V129 1700080E11Rik-202ENSMUST00000190661 682 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ulk4Q3V129 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ulk4Q3V129 Gm9299-201ENSMUST00000206392 1140 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Ulk4Q3V129 Tmem54-202ENSMUST00000030577 988 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ulk4Q3V129 Gm5129-201ENSMUST00000065372 300 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ulk4Q3V129 Gab3-201ENSMUST00000037374 2153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ulk4Q3V129 Trim26-202ENSMUST00000123715 1406 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ulk4Q3V129 Cpt2-201ENSMUST00000030345 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ulk4Q3V129 Rtp3-201ENSMUST00000084922 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ulk4Q3V129 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ulk4Q3V129 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ulk4Q3V129 Gpc2-201ENSMUST00000014089 2514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ulk4Q3V129 Gm15544-201ENSMUST00000118776 1531 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Ulk4Q3V129 Celf4-207ENSMUST00000225477 2626 ntAPPRIS P3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ulk4Q3V129 Nup98-206ENSMUST00000211235 3748 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ulk4Q3V129 Men1-202ENSMUST00000078137 2738 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ulk4Q3V129 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ulk4Q3V129 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ulk4Q3V129 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ulk4Q3V129 Lrp8os2-204ENSMUST00000188737 3078 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ulk4Q3V129 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ulk4Q3V129 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ulk4Q3V129 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ulk4Q3V129 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ulk4Q3V129 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ulk4Q3V129 Cntf-201ENSMUST00000112933 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ulk4Q3V129 Gm16229-201ENSMUST00000133270 1232 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ulk4Q3V129 Gm15420-201ENSMUST00000133274 382 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ulk4Q3V129 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ulk4Q3V129 Shisa5-203ENSMUST00000154184 1038 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ulk4Q3V129 Gm27731-201ENSMUST00000185192 107 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Ulk4Q3V129 AC173210.1-201ENSMUST00000222341 1131 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Ulk4Q3V129 Tmem256-201ENSMUST00000094065 492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ulk4Q3V129 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ulk4Q3V129 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ulk4Q3V129 Gas8-201ENSMUST00000093043 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ulk4Q3V129 Krt35-201ENSMUST00000103127 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ulk4Q3V129 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ulk4Q3V129 Il17rd-203ENSMUST00000225146 3366 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
Ulk4Q3V129 Kcnk13-204ENSMUST00000177549 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ulk4Q3V129 Nek8-201ENSMUST00000017549 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ulk4Q3V129 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ulk4Q3V129 Ilvbl-203ENSMUST00000218215 2331 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ulk4Q3V129 Psmd8-207ENSMUST00000209034 1983 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ulk4Q3V129 Glipr2-202ENSMUST00000107855 1816 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ulk4Q3V129 Mfap4-202ENSMUST00000064783 1722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ulk4Q3V129 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ulk4Q3V129 AC131068.2-201ENSMUST00000226175 1453 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Ulk4Q3V129 Gm7553-201ENSMUST00000185805 1426 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Ulk4Q3V129 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ulk4Q3V129 Gm12742-201ENSMUST00000117326 410 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Ulk4Q3V129 Tbx3os1-203ENSMUST00000140101 490 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ulk4Q3V129 Gm15444-201ENSMUST00000148335 388 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ulk4Q3V129 Mtmr2-209ENSMUST00000156801 617 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ulk4Q3V129 1600014C23Rik-201ENSMUST00000178179 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ulk4Q3V129 Trmt112-ps1-201ENSMUST00000202320 375 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Ulk4Q3V129 Gabarapl1-204ENSMUST00000204956 539 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ulk4Q3V129 CT573086.1-201ENSMUST00000227202 1074 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Ulk4Q3V129 AC122459.1-201ENSMUST00000228373 885 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Ulk4Q3V129 Atp6v0c-201ENSMUST00000024932 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ulk4Q3V129 Lrp8os1-201ENSMUST00000030352 672 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ulk4Q3V129 Tmem107-201ENSMUST00000075980 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ulk4Q3V129 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ulk4Q3V129 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ulk4Q3V129 Trim32-202ENSMUST00000107366 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ulk4Q3V129 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ulk4Q3V129 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ulk4Q3V129 Wbp11-201ENSMUST00000116514 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ulk4Q3V129 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ulk4Q3V129 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ulk4Q3V129 Lrrc56-202ENSMUST00000070458 2502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ulk4Q3V129 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ulk4Q3V129 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ulk4Q3V129 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ulk4Q3V129 Axdnd1-204ENSMUST00000178036 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ulk4Q3V129 Erg-203ENSMUST00000113848 2139 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ulk4Q3V129 Ppcdc-209ENSMUST00000214624 1814 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ulk4Q3V129 Mrgprh-201ENSMUST00000075296 1809 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ulk4Q3V129 Spata5-209ENSMUST00000198968 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ulk4Q3V129 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ulk4Q3V129 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ulk4Q3V129 Lrp2bp-202ENSMUST00000110380 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ulk4Q3V129 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ulk4Q3V129 Ero1lb-202ENSMUST00000220811 3341 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ulk4Q3V129 P4ha1-202ENSMUST00000092512 2387 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ulk4Q3V129 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ulk4Q3V129 Ninj1-202ENSMUST00000120733 1321 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ulk4Q3V129 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ulk4Q3V129 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.8 ms