Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0C5

Usp48, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 48, mousemouse

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Length 1,052 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp48Q3V0C5 Fam71f1-204ENSMUST00000166462 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Usp48Q3V0C5 Zbtb5-201ENSMUST00000055028 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Usp48Q3V0C5 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Usp48Q3V0C5 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Usp48Q3V0C5 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Usp48Q3V0C5 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
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Usp48Q3V0C5 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
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Usp48Q3V0C5 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Usp48Q3V0C5 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Usp48Q3V0C5 Gnai1-201ENSMUST00000074694 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
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Usp48Q3V0C5 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
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Usp48Q3V0C5 Fam19a2-201ENSMUST00000050756 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Usp48Q3V0C5 Add3-202ENSMUST00000050096 4488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
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Usp48Q3V0C5 Cryge-201ENSMUST00000087359 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
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Usp48Q3V0C5 Kctd18-202ENSMUST00000114410 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
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Usp48Q3V0C5 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
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Usp48Q3V0C5 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Usp48Q3V0C5 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Usp48Q3V0C5 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
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Usp48Q3V0C5 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Usp48Q3V0C5 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Usp48Q3V0C5 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Usp48Q3V0C5 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Usp48Q3V0C5 Itk-202ENSMUST00000101306 1185 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
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Usp48Q3V0C5 Gm17823-201ENSMUST00000217830 1006 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.9 ms