Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPL0

Sec31a, Protein transport protein Sec31A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,230 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sec31aQ3UPL0 Rab10os-202ENSMUST00000177896 2872 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sec31aQ3UPL0 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sec31aQ3UPL0 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sec31aQ3UPL0 Diaph3-202ENSMUST00000168889 4582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sec31aQ3UPL0 Diaph3-201ENSMUST00000022599 4582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sec31aQ3UPL0 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sec31aQ3UPL0 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Sec31aQ3UPL0 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sec31aQ3UPL0 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sec31aQ3UPL0 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Sec31aQ3UPL0 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sec31aQ3UPL0 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sec31aQ3UPL0 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sec31aQ3UPL0 Eno2-216ENSMUST00000204896 1640 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sec31aQ3UPL0 Ylpm1-201ENSMUST00000021670 7003 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sec31aQ3UPL0 Zyx-201ENSMUST00000070635 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sec31aQ3UPL0 Wnt9a-201ENSMUST00000000128 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sec31aQ3UPL0 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sec31aQ3UPL0 Def8-203ENSMUST00000093049 1909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sec31aQ3UPL0 Sh3bp2-207ENSMUST00000179943 2935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sec31aQ3UPL0 Llgl2-201ENSMUST00000103032 3551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sec31aQ3UPL0 Snx10-201ENSMUST00000049152 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sec31aQ3UPL0 Sema4a-213ENSMUST00000165898 3125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sec31aQ3UPL0 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sec31aQ3UPL0 Pdcd6ip-201ENSMUST00000035086 5951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sec31aQ3UPL0 Lrrc7-205ENSMUST00000200137 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sec31aQ3UPL0 Tle6-201ENSMUST00000072020 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sec31aQ3UPL0 Aacs-201ENSMUST00000031445 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sec31aQ3UPL0 B230369F24Rik-201ENSMUST00000141846 2560 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sec31aQ3UPL0 Neurl3-201ENSMUST00000056946 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sec31aQ3UPL0 Scarf1-201ENSMUST00000042808 2887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sec31aQ3UPL0 Adam33-202ENSMUST00000110232 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sec31aQ3UPL0 Dnmt1-207ENSMUST00000216540 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sec31aQ3UPL0 Tnpo2-201ENSMUST00000093360 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sec31aQ3UPL0 Hk1-202ENSMUST00000099691 4278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sec31aQ3UPL0 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sec31aQ3UPL0 Pltp-203ENSMUST00000109317 1575 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sec31aQ3UPL0 Eme1-201ENSMUST00000039949 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sec31aQ3UPL0 Fasn-201ENSMUST00000055655 10050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sec31aQ3UPL0 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sec31aQ3UPL0 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sec31aQ3UPL0 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Sec31aQ3UPL0 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sec31aQ3UPL0 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Sec31aQ3UPL0 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Sec31aQ3UPL0 Gm45706-201ENSMUST00000213063 2136 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Sec31aQ3UPL0 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sec31aQ3UPL0 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sec31aQ3UPL0 Neu2-204ENSMUST00000165109 1824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sec31aQ3UPL0 Adamts3-204ENSMUST00000198151 1833 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sec31aQ3UPL0 Dlgap3-203ENSMUST00000106094 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sec31aQ3UPL0 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sec31aQ3UPL0 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sec31aQ3UPL0 Pcdh10-201ENSMUST00000166126 7081 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sec31aQ3UPL0 Armcx1-203ENSMUST00000113197 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sec31aQ3UPL0 Gm29455-201ENSMUST00000186504 2659 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sec31aQ3UPL0 Vmn1r65-201ENSMUST00000086338 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sec31aQ3UPL0 Mtch2-211ENSMUST00000150232 2377 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Sec31aQ3UPL0 Il20ra-201ENSMUST00000020185 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Sec31aQ3UPL0 Gm44401-201ENSMUST00000204462 2375 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Sec31aQ3UPL0 Kif5c-201ENSMUST00000028102 6856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Sec31aQ3UPL0 Amotl2-201ENSMUST00000035121 4328 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Sec31aQ3UPL0 Secisbp2-201ENSMUST00000040117 3328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Sec31aQ3UPL0 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Sec31aQ3UPL0 Dnmt3b-208ENSMUST00000109772 4015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Sec31aQ3UPL0 Fosb-207ENSMUST00000208505 3523 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Sec31aQ3UPL0 Ubr7-201ENSMUST00000046404 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Sec31aQ3UPL0 Ccne2-201ENSMUST00000029866 3006 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Sec31aQ3UPL0 C1qtnf1-202ENSMUST00000106286 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Sec31aQ3UPL0 C1qtnf1-201ENSMUST00000017590 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Sec31aQ3UPL0 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Sec31aQ3UPL0 Zer1-202ENSMUST00000113677 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Sec31aQ3UPL0 Nup93-201ENSMUST00000079961 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Sec31aQ3UPL0 Ccdc8-201ENSMUST00000094805 4809 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Sec31aQ3UPL0 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Sec31aQ3UPL0 Gatad2a-206ENSMUST00000212478 3622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Sec31aQ3UPL0 Acbd5-213ENSMUST00000227809 1986 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Sec31aQ3UPL0 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Sec31aQ3UPL0 Rab1a-202ENSMUST00000109601 1200 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Sec31aQ3UPL0 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Sec31aQ3UPL0 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Sec31aQ3UPL0 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Sec31aQ3UPL0 Gm26830-201ENSMUST00000180389 993 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Sec31aQ3UPL0 Gm4804-201ENSMUST00000182234 999 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Sec31aQ3UPL0 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Sec31aQ3UPL0 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Sec31aQ3UPL0 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Sec31aQ3UPL0 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Sec31aQ3UPL0 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Sec31aQ3UPL0 1700120B22Rik-201ENSMUST00000054837 464 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Sec31aQ3UPL0 Slitrk3-201ENSMUST00000059407 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Sec31aQ3UPL0 Snx14-207ENSMUST00000174806 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Sec31aQ3UPL0 Rtl6-201ENSMUST00000069476 4426 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Sec31aQ3UPL0 Gne-209ENSMUST00000173234 2149 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Sec31aQ3UPL0 Foxb1-201ENSMUST00000071281 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Sec31aQ3UPL0 Dpp6-204ENSMUST00000122171 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Sec31aQ3UPL0 Gm39377-201ENSMUST00000214587 2533 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Sec31aQ3UPL0 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Sec31aQ3UPL0 Prkce-201ENSMUST00000097274 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Sec31aQ3UPL0 Gm5989-201ENSMUST00000096092 2077 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.4 ms