Protein–RNA interactions for Protein: Q3UN04

Usp30, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 30, mousemouse

Predictions only

Length 517 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp30Q3UN04 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Usp30Q3UN04 Hsd3b4-202ENSMUST00000196861 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Usp30Q3UN04 Cnbp-209ENSMUST00000204890 1614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Usp30Q3UN04 Gm10681-201ENSMUST00000058728 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Usp30Q3UN04 Osbpl9-202ENSMUST00000084366 3134 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Usp30Q3UN04 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Usp30Q3UN04 Aff2-201ENSMUST00000033532 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Usp30Q3UN04 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Usp30Q3UN04 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Usp30Q3UN04 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Usp30Q3UN04 Gdf10-201ENSMUST00000168727 5210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Usp30Q3UN04 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Usp30Q3UN04 H2-Q6-202ENSMUST00000174699 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Usp30Q3UN04 Cntf-201ENSMUST00000112933 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Usp30Q3UN04 Fuom-203ENSMUST00000121115 872 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Usp30Q3UN04 Myl3-203ENSMUST00000136695 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Usp30Q3UN04 Rdh18-ps-201ENSMUST00000137395 944 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Usp30Q3UN04 Rdh18-ps-202ENSMUST00000143917 953 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Usp30Q3UN04 Gm38319-201ENSMUST00000194537 1266 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Usp30Q3UN04 Gm37922-201ENSMUST00000195596 455 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Usp30Q3UN04 Gm37497-201ENSMUST00000195830 798 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Usp30Q3UN04 Lsm7-208ENSMUST00000220225 1129 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Usp30Q3UN04 Net1-207ENSMUST00000223258 597 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Usp30Q3UN04 Nkiras2-202ENSMUST00000051947 831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Usp30Q3UN04 Gm5129-201ENSMUST00000065372 300 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Usp30Q3UN04 Olfr707-201ENSMUST00000088687 924 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Usp30Q3UN04 Olfr1532-ps1-201ENSMUST00000098140 924 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Usp30Q3UN04 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Usp30Q3UN04 Tbc1d5-205ENSMUST00000224528 4764 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Usp30Q3UN04 Pcdha6-202ENSMUST00000193777 5367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Usp30Q3UN04 St8sia3-201ENSMUST00000025477 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Usp30Q3UN04 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Usp30Q3UN04 Rnase10-201ENSMUST00000022424 1629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Usp30Q3UN04 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Usp30Q3UN04 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Usp30Q3UN04 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Usp30Q3UN04 Gm10040-201ENSMUST00000080726 1662 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Usp30Q3UN04 Cpeb4-201ENSMUST00000020543 2312 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Usp30Q3UN04 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Usp30Q3UN04 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Usp30Q3UN04 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Usp30Q3UN04 R3hdm2-212ENSMUST00000166820 4281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Usp30Q3UN04 Eno1b-201ENSMUST00000076155 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Usp30Q3UN04 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Usp30Q3UN04 Atp6ap1-201ENSMUST00000019231 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Usp30Q3UN04 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Usp30Q3UN04 Celrr-202ENSMUST00000181433 1561 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Usp30Q3UN04 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Usp30Q3UN04 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Usp30Q3UN04 Rbl2-208ENSMUST00000209518 4792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Usp30Q3UN04 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Usp30Q3UN04 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Usp30Q3UN04 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Usp30Q3UN04 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Usp30Q3UN04 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Usp30Q3UN04 1700049J03Rik-201ENSMUST00000011196 421 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Usp30Q3UN04 Mrpl2-203ENSMUST00000113430 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Usp30Q3UN04 Gm1335-201ENSMUST00000121653 386 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Usp30Q3UN04 Tbx3os1-203ENSMUST00000140101 490 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Usp30Q3UN04 Snhg20-201ENSMUST00000145438 459 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Usp30Q3UN04 Gm27206-201ENSMUST00000154038 979 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Usp30Q3UN04 Ppm1h-208ENSMUST00000162969 811 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Usp30Q3UN04 1600014C10Rik-203ENSMUST00000177983 403 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Usp30Q3UN04 Gm3893-201ENSMUST00000178882 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Usp30Q3UN04 Gm27682-201ENSMUST00000183930 110 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Usp30Q3UN04 Mir6420-201ENSMUST00000185032 102 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Usp30Q3UN04 Gm43714-201ENSMUST00000198351 1204 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Usp30Q3UN04 Kitl-204ENSMUST00000218200 564 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Usp30Q3UN04 Rrp36-201ENSMUST00000024766 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Usp30Q3UN04 Snx24-201ENSMUST00000025417 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Usp30Q3UN04 Alkbh3-201ENSMUST00000040005 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Usp30Q3UN04 Scgb3a2-201ENSMUST00000043803 842 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Usp30Q3UN04 Gemin7-201ENSMUST00000051364 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Usp30Q3UN04 Utp23-201ENSMUST00000059599 740 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Usp30Q3UN04 Gng8-201ENSMUST00000078182 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Usp30Q3UN04 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Usp30Q3UN04 Tshz2-202ENSMUST00000109159 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Usp30Q3UN04 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Usp30Q3UN04 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Usp30Q3UN04 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Usp30Q3UN04 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Usp30Q3UN04 Trpc7-206ENSMUST00000173513 2241 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Usp30Q3UN04 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Usp30Q3UN04 Dbndd1-203ENSMUST00000177240 1463 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Usp30Q3UN04 Kcng1-202ENSMUST00000109191 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Usp30Q3UN04 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Usp30Q3UN04 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Usp30Q3UN04 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Usp30Q3UN04 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Usp30Q3UN04 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Usp30Q3UN04 Awat2-201ENSMUST00000033567 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Usp30Q3UN04 Spred2-202ENSMUST00000093299 4449 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Usp30Q3UN04 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Usp30Q3UN04 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Usp30Q3UN04 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Usp30Q3UN04 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Usp30Q3UN04 Gm29455-201ENSMUST00000186504 2659 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Usp30Q3UN04 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Usp30Q3UN04 Spata3-202ENSMUST00000113344 1047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Usp30Q3UN04 Nfu1-203ENSMUST00000120240 1195 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.8 ms