Protein–RNA interactions for Protein: Q3ULW6

Ccdc33, Coiled-coil domain-containing protein 33, mousemouse

Predictions only

Length 985 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc33Q3ULW6 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc33Q3ULW6 Gnaz-202ENSMUST00000159991 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc33Q3ULW6 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc33Q3ULW6 Dnm1-214ENSMUST00000201433 3146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc33Q3ULW6 Gm6198-201ENSMUST00000191337 2929 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc33Q3ULW6 Thoc6-204ENSMUST00000115490 1157 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc33Q3ULW6 Ssr4-208ENSMUST00000166518 800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc33Q3ULW6 Gm27501-201ENSMUST00000183599 107 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc33Q3ULW6 Gm37008-201ENSMUST00000195712 319 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc33Q3ULW6 Gm35409-201ENSMUST00000196412 1102 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc33Q3ULW6 Gm32850-202ENSMUST00000209149 732 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc33Q3ULW6 Il15-202ENSMUST00000209363 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc33Q3ULW6 Tmem205-203ENSMUST00000213698 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc33Q3ULW6 Gm19309-201ENSMUST00000218295 205 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc33Q3ULW6 Gm45930-201ENSMUST00000221330 292 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc33Q3ULW6 AC139350.3-201ENSMUST00000226151 420 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc33Q3ULW6 AC140406.1-201ENSMUST00000226481 465 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc33Q3ULW6 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc33Q3ULW6 Krtcap2-201ENSMUST00000040888 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc33Q3ULW6 Tas2r137-201ENSMUST00000064932 1073 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc33Q3ULW6 Gm3695-201ENSMUST00000087222 1009 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc33Q3ULW6 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc33Q3ULW6 Syngr2-201ENSMUST00000026649 1520 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc33Q3ULW6 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc33Q3ULW6 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc33Q3ULW6 Trim26-202ENSMUST00000123715 1406 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc33Q3ULW6 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc33Q3ULW6 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc33Q3ULW6 Wdr36-202ENSMUST00000166214 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc33Q3ULW6 4933435G04Rik-201ENSMUST00000205892 2108 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc33Q3ULW6 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc33Q3ULW6 Ahcyl2-201ENSMUST00000064872 2019 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc33Q3ULW6 Brd2-201ENSMUST00000025193 4374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc33Q3ULW6 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc33Q3ULW6 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc33Q3ULW6 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc33Q3ULW6 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc33Q3ULW6 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc33Q3ULW6 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc33Q3ULW6 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc33Q3ULW6 Hdgfl2-210ENSMUST00000225843 2238 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc33Q3ULW6 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc33Q3ULW6 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc33Q3ULW6 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc33Q3ULW6 Gm13342-201ENSMUST00000121055 207 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc33Q3ULW6 Mypopos-201ENSMUST00000124897 560 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc33Q3ULW6 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc33Q3ULW6 Aif1-206ENSMUST00000173324 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc33Q3ULW6 Gm29705-201ENSMUST00000212598 474 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc33Q3ULW6 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc33Q3ULW6 Gpc2-201ENSMUST00000014089 2514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc33Q3ULW6 Gm10339-203ENSMUST00000225409 1671 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc33Q3ULW6 Tcn2-204ENSMUST00000109990 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc33Q3ULW6 Exd2-201ENSMUST00000038185 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc33Q3ULW6 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc33Q3ULW6 Hid1-201ENSMUST00000044152 3236 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc33Q3ULW6 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc33Q3ULW6 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc33Q3ULW6 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc33Q3ULW6 Usp19-201ENSMUST00000006854 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc33Q3ULW6 Gtpbp1-201ENSMUST00000046463 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc33Q3ULW6 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc33Q3ULW6 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc33Q3ULW6 Car6-202ENSMUST00000105683 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc33Q3ULW6 Haus8-202ENSMUST00000110071 1452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc33Q3ULW6 Mettl17-206ENSMUST00000164902 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc33Q3ULW6 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc33Q3ULW6 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc33Q3ULW6 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc33Q3ULW6 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc33Q3ULW6 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc33Q3ULW6 Trim34a-202ENSMUST00000106848 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc33Q3ULW6 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc33Q3ULW6 Nup98-206ENSMUST00000211235 3748 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc33Q3ULW6 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc33Q3ULW6 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc33Q3ULW6 Irak2-202ENSMUST00000089022 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc33Q3ULW6 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc33Q3ULW6 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc33Q3ULW6 Eif3j1-201ENSMUST00000028668 5413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc33Q3ULW6 Spatc1l-202ENSMUST00000105414 1060 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc33Q3ULW6 0610037L13Rik-205ENSMUST00000119394 741 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc33Q3ULW6 Gm14730-201ENSMUST00000122378 1045 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc33Q3ULW6 Hnf4aos-203ENSMUST00000141329 839 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc33Q3ULW6 Gm11723-201ENSMUST00000155505 466 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc33Q3ULW6 Dcdc2b-203ENSMUST00000179209 864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc33Q3ULW6 Gm27331-201ENSMUST00000183705 60 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc33Q3ULW6 Gm29199-201ENSMUST00000187766 775 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc33Q3ULW6 Cryaa-201ENSMUST00000019192 1176 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc33Q3ULW6 Gm7498-201ENSMUST00000203282 1084 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc33Q3ULW6 Caly-203ENSMUST00000211044 1029 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc33Q3ULW6 Gm18473-201ENSMUST00000220543 868 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc33Q3ULW6 AC093022.1-201ENSMUST00000226949 1072 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc33Q3ULW6 Tsn-201ENSMUST00000027623 7063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc33Q3ULW6 Rusc1-201ENSMUST00000052539 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc33Q3ULW6 Adamts8-201ENSMUST00000068135 3631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc33Q3ULW6 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc33Q3ULW6 Prss36-202ENSMUST00000118755 3028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc33Q3ULW6 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc33Q3ULW6 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.5 ms