Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHX8

Nkx6-3, Homeobox protein Nkx-6.3, mousemouse

Predictions only

Length 262 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nkx6-3Q3UHX8 Mrps22-201ENSMUST00000035034 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Nkx6-3Q3UHX8 Fkbp2-201ENSMUST00000070878 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Nkx6-3Q3UHX8 Gm12462-201ENSMUST00000140826 3056 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Nkx6-3Q3UHX8 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Nkx6-3Q3UHX8 Uckl1-201ENSMUST00000057816 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Nkx6-3Q3UHX8 Gm12500-202ENSMUST00000186471 2428 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Nkx6-3Q3UHX8 Adamts8-201ENSMUST00000068135 3631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Nkx6-3Q3UHX8 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Nkx6-3Q3UHX8 N6amt1-203ENSMUST00000118310 1700 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Nkx6-3Q3UHX8 Mob3c-201ENSMUST00000030477 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Nkx6-3Q3UHX8 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Nkx6-3Q3UHX8 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Nkx6-3Q3UHX8 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Nkx6-3Q3UHX8 Cggbp1-201ENSMUST00000067744 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Nkx6-3Q3UHX8 Epb41l2-201ENSMUST00000053748 4385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Nkx6-3Q3UHX8 B3gat1-204ENSMUST00000160899 3801 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Nkx6-3Q3UHX8 Cep170b-201ENSMUST00000092279 3817 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Nkx6-3Q3UHX8 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Nkx6-3Q3UHX8 Aire-216ENSMUST00000156417 1627 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Nkx6-3Q3UHX8 Tle3-215ENSMUST00000162583 4299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Nkx6-3Q3UHX8 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Nkx6-3Q3UHX8 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Nkx6-3Q3UHX8 Noxa1-202ENSMUST00000114373 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Nkx6-3Q3UHX8 Fam160a2-204ENSMUST00000122327 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Nkx6-3Q3UHX8 Bscl2-210ENSMUST00000171649 1962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Nkx6-3Q3UHX8 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Nkx6-3Q3UHX8 Gpr4-201ENSMUST00000060225 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Nkx6-3Q3UHX8 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Nkx6-3Q3UHX8 Dclk2-206ENSMUST00000193632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Nkx6-3Q3UHX8 Ptpn6-201ENSMUST00000004377 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Nkx6-3Q3UHX8 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Nkx6-3Q3UHX8 Kif3a-208ENSMUST00000173744 2257 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Nkx6-3Q3UHX8 Stau2-215ENSMUST00000162435 2735 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Nkx6-3Q3UHX8 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Nkx6-3Q3UHX8 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Nkx6-3Q3UHX8 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Nkx6-3Q3UHX8 Arpc3-203ENSMUST00000111713 708 ntTSL 3 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Nkx6-3Q3UHX8 Gm11803-201ENSMUST00000119966 444 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Nkx6-3Q3UHX8 Gm15966-201ENSMUST00000136853 480 ntTSL 3 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Nkx6-3Q3UHX8 Vhl-ps1-201ENSMUST00000174813 597 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Nkx6-3Q3UHX8 Cryaa-201ENSMUST00000019192 1176 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Nkx6-3Q3UHX8 Gnb4-208ENSMUST00000193050 423 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Nkx6-3Q3UHX8 Gm43433-201ENSMUST00000196573 481 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Nkx6-3Q3UHX8 Gm867-202ENSMUST00000219979 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Nkx6-3Q3UHX8 4930518P08Rik-201ENSMUST00000221281 1187 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Nkx6-3Q3UHX8 Gp9-201ENSMUST00000032133 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Nkx6-3Q3UHX8 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Nkx6-3Q3UHX8 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Nkx6-3Q3UHX8 Fbxo10-201ENSMUST00000052236 4635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Nkx6-3Q3UHX8 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Nkx6-3Q3UHX8 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Nkx6-3Q3UHX8 AC154725.1-201ENSMUST00000224826 1961 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
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Nkx6-3Q3UHX8 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Nkx6-3Q3UHX8 Tfe3-211ENSMUST00000137467 3390 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Nkx6-3Q3UHX8 Rpl21-201ENSMUST00000035983 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Nkx6-3Q3UHX8 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Nkx6-3Q3UHX8 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Nkx6-3Q3UHX8 AC096628.2-201ENSMUST00000225443 1413 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Nkx6-3Q3UHX8 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Nkx6-3Q3UHX8 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
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Nkx6-3Q3UHX8 Selenbp2-201ENSMUST00000090848 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
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Nkx6-3Q3UHX8 Cpsf4l-203ENSMUST00000106617 1123 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Nkx6-3Q3UHX8 Ggt6-203ENSMUST00000108499 874 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Nkx6-3Q3UHX8 Selenoh-203ENSMUST00000117299 747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Nkx6-3Q3UHX8 Car15-201ENSMUST00000118960 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Nkx6-3Q3UHX8 Tex22-203ENSMUST00000146107 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Nkx6-3Q3UHX8 Oprm1-229ENSMUST00000152674 1179 ntTSL 3 BASIC12.71□□□□□ -0.37
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Nkx6-3Q3UHX8 Gm9113-201ENSMUST00000192510 1018 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Nkx6-3Q3UHX8 Gm9131-201ENSMUST00000193557 1089 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Nkx6-3Q3UHX8 Gm9121-201ENSMUST00000193749 1071 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Nkx6-3Q3UHX8 Gm43714-201ENSMUST00000198351 1204 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Nkx6-3Q3UHX8 Gm7561-201ENSMUST00000211203 886 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Nkx6-3Q3UHX8 Polr2h-201ENSMUST00000021405 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Nkx6-3Q3UHX8 Ccl24-201ENSMUST00000004936 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Nkx6-3Q3UHX8 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Nkx6-3Q3UHX8 Rnf10-203ENSMUST00000112097 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Nkx6-3Q3UHX8 4731419I09Rik-201ENSMUST00000180791 2820 ntTSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Nkx6-3Q3UHX8 Rnaseh2a-210ENSMUST00000147812 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.38
Nkx6-3Q3UHX8 Cd81-201ENSMUST00000037941 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Nkx6-3Q3UHX8 Mbp-207ENSMUST00000114674 2108 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Nkx6-3Q3UHX8 Hoxd3-202ENSMUST00000111982 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Nkx6-3Q3UHX8 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Nkx6-3Q3UHX8 Esrrb-202ENSMUST00000110203 2363 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Nkx6-3Q3UHX8 Gm13848-201ENSMUST00000130777 2047 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Nkx6-3Q3UHX8 Rbm47-206ENSMUST00000200775 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
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