Protein–RNA interactions for Protein: Q3U6U5

Gtpbp6, Putative GTP-binding protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 514 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtpbp6Q3U6U5 Ldlrad2-201ENSMUST00000178923 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gtpbp6Q3U6U5 Mhrt-201ENSMUST00000181782 828 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gtpbp6Q3U6U5 Gm37753-201ENSMUST00000192178 439 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gtpbp6Q3U6U5 4930533L02Rik-201ENSMUST00000194425 1160 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Gtpbp6Q3U6U5 Gm43539-201ENSMUST00000196190 363 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gtpbp6Q3U6U5 Gm43240-201ENSMUST00000198543 630 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gtpbp6Q3U6U5 Gm44632-201ENSMUST00000207245 474 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gtpbp6Q3U6U5 AL589696.1-201ENSMUST00000225711 330 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Gtpbp6Q3U6U5 Ppp1r14d-201ENSMUST00000076084 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gtpbp6Q3U6U5 Olfr171-201ENSMUST00000079891 945 ntAPPRIS P2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gtpbp6Q3U6U5 Olfr1106-201ENSMUST00000099867 939 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gtpbp6Q3U6U5 Gpr12-203ENSMUST00000197431 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gtpbp6Q3U6U5 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gtpbp6Q3U6U5 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gtpbp6Q3U6U5 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gtpbp6Q3U6U5 Ntrk2-209ENSMUST00000225950 2640 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Gtpbp6Q3U6U5 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gtpbp6Q3U6U5 Gm11978-202ENSMUST00000127510 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gtpbp6Q3U6U5 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gtpbp6Q3U6U5 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Gtpbp6Q3U6U5 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gtpbp6Q3U6U5 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gtpbp6Q3U6U5 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gtpbp6Q3U6U5 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gtpbp6Q3U6U5 Asb11-202ENSMUST00000036858 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gtpbp6Q3U6U5 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gtpbp6Q3U6U5 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gtpbp6Q3U6U5 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gtpbp6Q3U6U5 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gtpbp6Q3U6U5 Mettl17-206ENSMUST00000164902 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gtpbp6Q3U6U5 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gtpbp6Q3U6U5 Gm13612-201ENSMUST00000119276 390 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Gtpbp6Q3U6U5 Gm12997-201ENSMUST00000120207 640 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Gtpbp6Q3U6U5 Dcdc2b-203ENSMUST00000179209 864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gtpbp6Q3U6U5 C330013E15Rik-201ENSMUST00000181034 878 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gtpbp6Q3U6U5 Gm33056-201ENSMUST00000213234 1120 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gtpbp6Q3U6U5 Erg28-201ENSMUST00000021676 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gtpbp6Q3U6U5 Timm9-203ENSMUST00000220482 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gtpbp6Q3U6U5 AC133598.1-201ENSMUST00000224327 660 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Gtpbp6Q3U6U5 Vmn1r39-202ENSMUST00000226783 918 ntAPPRIS P2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gtpbp6Q3U6U5 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Gtpbp6Q3U6U5 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gtpbp6Q3U6U5 Psma7-201ENSMUST00000029082 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gtpbp6Q3U6U5 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gtpbp6Q3U6U5 Olfr1453-201ENSMUST00000087773 924 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gtpbp6Q3U6U5 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gtpbp6Q3U6U5 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gtpbp6Q3U6U5 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gtpbp6Q3U6U5 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gtpbp6Q3U6U5 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gtpbp6Q3U6U5 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gtpbp6Q3U6U5 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gtpbp6Q3U6U5 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gtpbp6Q3U6U5 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gtpbp6Q3U6U5 Ctdspl2-203ENSMUST00000110574 1616 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gtpbp6Q3U6U5 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gtpbp6Q3U6U5 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Gtpbp6Q3U6U5 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gtpbp6Q3U6U5 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gtpbp6Q3U6U5 Mageb10-ps-201ENSMUST00000119697 1407 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Gtpbp6Q3U6U5 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gtpbp6Q3U6U5 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gtpbp6Q3U6U5 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gtpbp6Q3U6U5 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gtpbp6Q3U6U5 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gtpbp6Q3U6U5 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gtpbp6Q3U6U5 AC113441.2-201ENSMUST00000221538 1468 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Gtpbp6Q3U6U5 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gtpbp6Q3U6U5 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gtpbp6Q3U6U5 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gtpbp6Q3U6U5 4933409G03Rik-201ENSMUST00000102713 1263 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gtpbp6Q3U6U5 Gm12840-201ENSMUST00000156081 627 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gtpbp6Q3U6U5 1700003H04Rik-203ENSMUST00000178485 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gtpbp6Q3U6U5 Serpinb10-202ENSMUST00000182198 1265 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gtpbp6Q3U6U5 Gm28750-201ENSMUST00000186327 658 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gtpbp6Q3U6U5 Gm21139-201ENSMUST00000186594 877 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Gtpbp6Q3U6U5 1700045I11Rik-201ENSMUST00000194752 493 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Gtpbp6Q3U6U5 Gm44332-201ENSMUST00000203712 433 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Gtpbp6Q3U6U5 Lyrm2-201ENSMUST00000062802 465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gtpbp6Q3U6U5 Cracr2a-201ENSMUST00000071563 1094 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gtpbp6Q3U6U5 Cbx3-202ENSMUST00000094623 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gtpbp6Q3U6U5 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gtpbp6Q3U6U5 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gtpbp6Q3U6U5 Casp7-201ENSMUST00000026062 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gtpbp6Q3U6U5 Gm9333-201ENSMUST00000205452 1323 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Gtpbp6Q3U6U5 Olfr202-203ENSMUST00000217485 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gtpbp6Q3U6U5 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gtpbp6Q3U6U5 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gtpbp6Q3U6U5 Klk6-203ENSMUST00000107968 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gtpbp6Q3U6U5 Slc29a1-203ENSMUST00000097317 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gtpbp6Q3U6U5 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gtpbp6Q3U6U5 AC121805.2-201ENSMUST00000218808 2538 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Gtpbp6Q3U6U5 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gtpbp6Q3U6U5 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gtpbp6Q3U6U5 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gtpbp6Q3U6U5 Tspan32-205ENSMUST00000105924 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gtpbp6Q3U6U5 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gtpbp6Q3U6U5 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gtpbp6Q3U6U5 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gtpbp6Q3U6U5 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.6 ms