Protein–RNA interactions for Protein: Q3U2C5

Rnf149, E3 ubiquitin-protein ligase RNF149, mousemouse

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Length 394 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf149Q3U2C5 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC12.15□□□□□ -0.46
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Rnf149Q3U2C5 Aco1-201ENSMUST00000102973 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Rnf149Q3U2C5 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Rnf149Q3U2C5 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
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Rnf149Q3U2C5 Slc22a2-201ENSMUST00000046959 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
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Rnf149Q3U2C5 Kif1c-202ENSMUST00000094499 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Rnf149Q3U2C5 Ints13-201ENSMUST00000032427 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
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Rnf149Q3U2C5 Hvcn1-201ENSMUST00000072602 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Rnf149Q3U2C5 Ampd2-202ENSMUST00000102637 3586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
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Rnf149Q3U2C5 Ifnar2-201ENSMUST00000023693 3047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Rnf149Q3U2C5 Dpp8-201ENSMUST00000034960 4808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
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Rnf149Q3U2C5 Kbtbd6-201ENSMUST00000100359 2982 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
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Rnf149Q3U2C5 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
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Rnf149Q3U2C5 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Rnf149Q3U2C5 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
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Rnf149Q3U2C5 Cluh-201ENSMUST00000092915 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
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Rnf149Q3U2C5 Bcat1-202ENSMUST00000048252 1642 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Rnf149Q3U2C5 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Rnf149Q3U2C5 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
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Rnf149Q3U2C5 Gm16251-201ENSMUST00000162649 338 ntTSL 3 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Rnf149Q3U2C5 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Rnf149Q3U2C5 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Rnf149Q3U2C5 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Rnf149Q3U2C5 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC12.13□□□□□ -0.47
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Rnf149Q3U2C5 G2e3-201ENSMUST00000054308 6803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Rnf149Q3U2C5 Arhgap33-207ENSMUST00000208538 4372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Rnf149Q3U2C5 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Rnf149Q3U2C5 Rbmx2-201ENSMUST00000033433 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
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