Protein–RNA interactions for Protein: Q3SYJ2

Prr27, 4930432K09Rik protein, mousemouse

Predictions only

Length 352 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prr27Q3SYJ2 Eme2-201ENSMUST00000119848 5226 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Prr27Q3SYJ2 Mob3c-201ENSMUST00000030477 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Prr27Q3SYJ2 Tfap2c-206ENSMUST00000170744 2776 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Prr27Q3SYJ2 Tjap1-202ENSMUST00000164342 2559 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Prr27Q3SYJ2 Tnk1-203ENSMUST00000108628 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Prr27Q3SYJ2 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Prr27Q3SYJ2 Il1rapl2-202ENSMUST00000113063 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Prr27Q3SYJ2 AC154725.1-201ENSMUST00000224826 1961 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Prr27Q3SYJ2 Gm20149-201ENSMUST00000214691 1667 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Prr27Q3SYJ2 Canx-201ENSMUST00000020637 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Prr27Q3SYJ2 Cep68-201ENSMUST00000050611 4804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Prr27Q3SYJ2 Bend3-201ENSMUST00000040147 5882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Prr27Q3SYJ2 Pltp-203ENSMUST00000109317 1575 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Prr27Q3SYJ2 Ablim2-201ENSMUST00000054598 3564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Prr27Q3SYJ2 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Prr27Q3SYJ2 Lcmt1-201ENSMUST00000033025 1369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Prr27Q3SYJ2 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Prr27Q3SYJ2 Ppp1r18-205ENSMUST00000187690 3185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Prr27Q3SYJ2 Trim26-201ENSMUST00000053434 3198 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Prr27Q3SYJ2 Unc13a-201ENSMUST00000030170 10255 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Prr27Q3SYJ2 Arrdc4-201ENSMUST00000048068 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Prr27Q3SYJ2 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Prr27Q3SYJ2 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Prr27Q3SYJ2 Mbp-207ENSMUST00000114674 2108 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Prr27Q3SYJ2 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Prr27Q3SYJ2 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Prr27Q3SYJ2 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Prr27Q3SYJ2 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Prr27Q3SYJ2 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Prr27Q3SYJ2 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Prr27Q3SYJ2 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Prr27Q3SYJ2 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Prr27Q3SYJ2 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Prr27Q3SYJ2 Olfr1214-201ENSMUST00000099804 936 ntAPPRIS P1 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Prr27Q3SYJ2 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Prr27Q3SYJ2 Inpp4b-215ENSMUST00000217122 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Prr27Q3SYJ2 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Prr27Q3SYJ2 Zfp367-201ENSMUST00000059817 3532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Prr27Q3SYJ2 Ppp1r16b-201ENSMUST00000045503 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Prr27Q3SYJ2 Cct6a-202ENSMUST00000201414 2454 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Prr27Q3SYJ2 Casp7-201ENSMUST00000026062 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Prr27Q3SYJ2 Eya1-201ENSMUST00000027066 4347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Prr27Q3SYJ2 4933416C03Rik-201ENSMUST00000099261 2254 ntAPPRIS P1 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Prr27Q3SYJ2 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Prr27Q3SYJ2 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Prr27Q3SYJ2 Evl-203ENSMUST00000109854 1870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Prr27Q3SYJ2 4933430H06Rik-201ENSMUST00000200924 1343 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Prr27Q3SYJ2 Ppp6r3-202ENSMUST00000113997 4952 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Prr27Q3SYJ2 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Prr27Q3SYJ2 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Prr27Q3SYJ2 Noxa1-202ENSMUST00000114373 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Prr27Q3SYJ2 Adcyap1r1-206ENSMUST00000167234 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Prr27Q3SYJ2 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Prr27Q3SYJ2 Map7d1-202ENSMUST00000106132 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Prr27Q3SYJ2 Tmem215-202ENSMUST00000179526 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Prr27Q3SYJ2 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Prr27Q3SYJ2 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Prr27Q3SYJ2 Slc52a3-202ENSMUST00000109858 2094 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Prr27Q3SYJ2 Bag6-203ENSMUST00000172571 3599 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Prr27Q3SYJ2 Ptgr2-205ENSMUST00000135001 1286 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Prr27Q3SYJ2 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Prr27Q3SYJ2 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Prr27Q3SYJ2 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Prr27Q3SYJ2 Gm43303-201ENSMUST00000200133 669 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Prr27Q3SYJ2 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Prr27Q3SYJ2 Efcab10-201ENSMUST00000020878 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Prr27Q3SYJ2 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Prr27Q3SYJ2 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Prr27Q3SYJ2 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Prr27Q3SYJ2 Gm3695-201ENSMUST00000087222 1009 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Prr27Q3SYJ2 Naaa-202ENSMUST00000159345 1629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Prr27Q3SYJ2 Gm5124-201ENSMUST00000127554 1970 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Prr27Q3SYJ2 Ash2l-204ENSMUST00000110610 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Prr27Q3SYJ2 Bend7-201ENSMUST00000056914 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Prr27Q3SYJ2 Slc11a2-201ENSMUST00000023774 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Prr27Q3SYJ2 Insrr-202ENSMUST00000107582 4694 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Prr27Q3SYJ2 Lpcat1-201ENSMUST00000022099 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Prr27Q3SYJ2 Rnft2-202ENSMUST00000121369 4431 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Prr27Q3SYJ2 Acat2-201ENSMUST00000007005 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Prr27Q3SYJ2 Ubap2l-202ENSMUST00000064639 4073 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Prr27Q3SYJ2 Syne3-203ENSMUST00000109927 5263 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Prr27Q3SYJ2 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Prr27Q3SYJ2 Catsper3-202ENSMUST00000109898 1311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Prr27Q3SYJ2 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Prr27Q3SYJ2 Islr2-201ENSMUST00000114144 3880 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Prr27Q3SYJ2 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
Prr27Q3SYJ2 Smpd3-201ENSMUST00000067512 5148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
Prr27Q3SYJ2 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Prr27Q3SYJ2 Ankra2-208ENSMUST00000226100 1476 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Prr27Q3SYJ2 Hhatl-202ENSMUST00000163981 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Prr27Q3SYJ2 Ube2g1-201ENSMUST00000021148 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Prr27Q3SYJ2 Pde4a-203ENSMUST00000115458 2962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Prr27Q3SYJ2 Enpp6-202ENSMUST00000119686 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Prr27Q3SYJ2 Rpl21-201ENSMUST00000035983 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Prr27Q3SYJ2 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Prr27Q3SYJ2 Prpf38b-201ENSMUST00000029480 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Prr27Q3SYJ2 Rabep2-201ENSMUST00000106405 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Prr27Q3SYJ2 Sp3-202ENSMUST00000102689 4181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Prr27Q3SYJ2 Gm4782-201ENSMUST00000168705 2046 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Prr27Q3SYJ2 Gm29455-201ENSMUST00000186504 2659 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.8 ms