Protein–RNA interactions for Protein: Q0VBF8

Stum, Protein stum homolog, mousemouse

Predictions only

Length 141 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
StumQ0VBF8 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
StumQ0VBF8 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
StumQ0VBF8 Lzts1-204ENSMUST00000185176 5019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
StumQ0VBF8 Arhgap11a-201ENSMUST00000102545 4958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
StumQ0VBF8 Hk1-202ENSMUST00000099691 4278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
StumQ0VBF8 Cnnm2-202ENSMUST00000099373 3558 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
StumQ0VBF8 Pgm5-201ENSMUST00000047666 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
StumQ0VBF8 Kif3b-201ENSMUST00000028977 5635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
StumQ0VBF8 Usp24-204ENSMUST00000165709 10594 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
StumQ0VBF8 BC006965-201ENSMUST00000124028 1952 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
StumQ0VBF8 Reps2-201ENSMUST00000101102 7630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
StumQ0VBF8 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
StumQ0VBF8 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
StumQ0VBF8 Gm7488-201ENSMUST00000117148 684 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
StumQ0VBF8 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
StumQ0VBF8 Rpl34-203ENSMUST00000133802 711 ntTSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
StumQ0VBF8 Ptgr2-205ENSMUST00000135001 1286 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
StumQ0VBF8 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
StumQ0VBF8 Selenoh-205ENSMUST00000189636 499 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.4□□□□□ -0.58
StumQ0VBF8 Bpnt1-205ENSMUST00000210277 1226 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
StumQ0VBF8 Aspdh-201ENSMUST00000035929 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
StumQ0VBF8 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
StumQ0VBF8 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
StumQ0VBF8 Top1mt-201ENSMUST00000000958 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
StumQ0VBF8 Lrig2-205ENSMUST00000198332 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
StumQ0VBF8 Atxn7l1-202ENSMUST00000090597 2563 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
StumQ0VBF8 H2-Q6-202ENSMUST00000174699 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
StumQ0VBF8 Bpifa6-201ENSMUST00000109753 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
StumQ0VBF8 Intu-202ENSMUST00000091186 6387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
StumQ0VBF8 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
StumQ0VBF8 Itga6-202ENSMUST00000112101 4156 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
StumQ0VBF8 Prmt2-201ENSMUST00000020452 2016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
StumQ0VBF8 4931428F04Rik-203ENSMUST00000212219 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
StumQ0VBF8 Ppp1r12b-209ENSMUST00000168381 3621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
StumQ0VBF8 Lrrc17-201ENSMUST00000035651 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
StumQ0VBF8 AC161252.3-201ENSMUST00000225465 1549 ntBASIC11.4□□□□□ -0.59
StumQ0VBF8 Epb41l2-201ENSMUST00000053748 4385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
StumQ0VBF8 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
StumQ0VBF8 Gm9947-201ENSMUST00000067599 2920 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
StumQ0VBF8 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
StumQ0VBF8 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
StumQ0VBF8 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
StumQ0VBF8 Dnaaf5-201ENSMUST00000026975 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
StumQ0VBF8 Txn2-203ENSMUST00000109747 1778 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
StumQ0VBF8 Cnbd2-202ENSMUST00000073942 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
StumQ0VBF8 Pcnx2-204ENSMUST00000131127 3782 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
StumQ0VBF8 Slc12a8-202ENSMUST00000117134 2081 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
StumQ0VBF8 Usp19-204ENSMUST00000178075 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
StumQ0VBF8 Usp19-202ENSMUST00000085044 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
StumQ0VBF8 Casp7-201ENSMUST00000026062 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
StumQ0VBF8 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
StumQ0VBF8 Ulk3-201ENSMUST00000053230 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
StumQ0VBF8 P3h2-201ENSMUST00000039990 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
StumQ0VBF8 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
StumQ0VBF8 Prcd-202ENSMUST00000116318 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
StumQ0VBF8 Mvk-203ENSMUST00000124260 1051 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
StumQ0VBF8 Gm11724-201ENSMUST00000125577 472 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
StumQ0VBF8 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
StumQ0VBF8 Gm5354-201ENSMUST00000182417 973 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
StumQ0VBF8 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
StumQ0VBF8 Tbc1d17-209ENSMUST00000207293 692 ntTSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
StumQ0VBF8 Gm11149-204ENSMUST00000216483 1275 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
StumQ0VBF8 Rtraf-201ENSMUST00000022341 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
StumQ0VBF8 1700018B08Rik-201ENSMUST00000034265 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
StumQ0VBF8 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
StumQ0VBF8 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
StumQ0VBF8 Gsg1l-201ENSMUST00000073935 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
StumQ0VBF8 Gm14455-201ENSMUST00000138288 2146 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
StumQ0VBF8 Gm12626-201ENSMUST00000117339 1983 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
StumQ0VBF8 Gm12623-201ENSMUST00000119849 1983 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
StumQ0VBF8 Gm2155-201ENSMUST00000181581 1974 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
StumQ0VBF8 Mcm9-206ENSMUST00000220007 3513 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
StumQ0VBF8 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
StumQ0VBF8 Foxred2-202ENSMUST00000117725 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
StumQ0VBF8 Map2k7-203ENSMUST00000110994 1600 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
StumQ0VBF8 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
StumQ0VBF8 Osbpl10-204ENSMUST00000182384 2158 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
StumQ0VBF8 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
StumQ0VBF8 Hadhb-201ENSMUST00000026841 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
StumQ0VBF8 Gm19461-205ENSMUST00000191207 2566 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
StumQ0VBF8 Aurka-203ENSMUST00000109140 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
StumQ0VBF8 Shc4-203ENSMUST00000110480 3671 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
StumQ0VBF8 March8-213ENSMUST00000203193 4245 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
StumQ0VBF8 Gm29358-201ENSMUST00000186510 1734 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
StumQ0VBF8 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
StumQ0VBF8 Slc35c2-202ENSMUST00000109298 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
StumQ0VBF8 Ablim2-201ENSMUST00000054598 3564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
StumQ0VBF8 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
StumQ0VBF8 Dhx37-201ENSMUST00000169485 4760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
StumQ0VBF8 C430049B03Rik-201ENSMUST00000129764 868 ntTSL 3 BASIC11.38□□□□□ -0.59
StumQ0VBF8 Gldnos-201ENSMUST00000149237 841 ntTSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
StumQ0VBF8 Gm15917-201ENSMUST00000162771 487 ntTSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
StumQ0VBF8 Il11-202ENSMUST00000163481 990 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
StumQ0VBF8 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
StumQ0VBF8 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.38□□□□□ -0.59
StumQ0VBF8 Gm36979-201ENSMUST00000193616 539 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
StumQ0VBF8 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
StumQ0VBF8 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
StumQ0VBF8 Olfr750-201ENSMUST00000048478 1132 ntAPPRIS P1 BASIC11.38□□□□□ -0.59
StumQ0VBF8 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.6 ms