Protein–RNA interactions for Protein: Q0PD08

Rab42, Ras-related protein Rab-42, mousemouse

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab42Q0PD08 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Rab42Q0PD08 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Rab42Q0PD08 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Rab42Q0PD08 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Rab42Q0PD08 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Rab42Q0PD08 Mks1-201ENSMUST00000038196 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Rab42Q0PD08 Tnks1bp1-202ENSMUST00000111605 5747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Rab42Q0PD08 Samd11-204ENSMUST00000218788 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Rab42Q0PD08 Pik3cd-205ENSMUST00000118704 4894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Rab42Q0PD08 Tnfaip8-207ENSMUST00000148159 1921 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Rab42Q0PD08 Smim13-201ENSMUST00000165561 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Rab42Q0PD08 Ptch2-201ENSMUST00000030443 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Rab42Q0PD08 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Rab42Q0PD08 Gorasp1-201ENSMUST00000035099 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Rab42Q0PD08 Srebf2-201ENSMUST00000023100 4989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Rab42Q0PD08 Slc38a11-201ENSMUST00000112420 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Rab42Q0PD08 Cpped1-203ENSMUST00000121750 2614 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Rab42Q0PD08 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Rab42Q0PD08 Bop1-201ENSMUST00000023217 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Rab42Q0PD08 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Rab42Q0PD08 Smug1-201ENSMUST00000064067 3281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Rab42Q0PD08 Nxf1-201ENSMUST00000010241 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Rab42Q0PD08 Prkcd-204ENSMUST00000112206 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Rab42Q0PD08 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Rab42Q0PD08 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Rab42Q0PD08 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Rab42Q0PD08 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Rab42Q0PD08 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Rab42Q0PD08 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Rab42Q0PD08 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Rab42Q0PD08 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Rab42Q0PD08 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Rab42Q0PD08 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Rab42Q0PD08 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Rab42Q0PD08 Tpm3-rs7-201ENSMUST00000072359 2147 ntAPPRIS P1 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Rab42Q0PD08 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Rab42Q0PD08 Zbtb7b-202ENSMUST00000107432 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Rab42Q0PD08 Rpsa-201ENSMUST00000035105 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Rab42Q0PD08 Sstr5-202ENSMUST00000165183 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Rab42Q0PD08 Daxx-207ENSMUST00000174146 2424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Rab42Q0PD08 Mog-201ENSMUST00000102665 1704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Rab42Q0PD08 Cyb5rl-201ENSMUST00000030364 2360 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Rab42Q0PD08 Galnt4-201ENSMUST00000161240 5089 ntAPPRIS P1 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Rab42Q0PD08 Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Rab42Q0PD08 Gm5859-201ENSMUST00000165401 2324 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Rab42Q0PD08 Dgcr2-203ENSMUST00000117082 2987 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Rab42Q0PD08 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Rab42Q0PD08 Calcoco1-201ENSMUST00000023818 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Rab42Q0PD08 Slc25a40-201ENSMUST00000066921 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Rab42Q0PD08 Chodl-202ENSMUST00000069148 2051 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Rab42Q0PD08 Rbms2-201ENSMUST00000092033 1481 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Rab42Q0PD08 Zbtb44-205ENSMUST00000216649 3157 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Rab42Q0PD08 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Rab42Q0PD08 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Rab42Q0PD08 Eng-202ENSMUST00000113272 3021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Rab42Q0PD08 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Rab42Q0PD08 Pabpc4-202ENSMUST00000080178 3019 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Rab42Q0PD08 Gm6157-201ENSMUST00000199935 1897 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Rab42Q0PD08 Pianp-206ENSMUST00000162000 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Rab42Q0PD08 Gm26823-201ENSMUST00000181425 2361 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Rab42Q0PD08 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Rab42Q0PD08 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Rab42Q0PD08 Ptp4a3-202ENSMUST00000163582 3808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Rab42Q0PD08 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Rab42Q0PD08 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Rab42Q0PD08 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Rab42Q0PD08 Diaph1-204ENSMUST00000115631 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Rab42Q0PD08 Mab21l3-202ENSMUST00000118411 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Rab42Q0PD08 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Rab42Q0PD08 Gm10604-201ENSMUST00000098260 1706 ntAPPRIS P1 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Rab42Q0PD08 Coq3-201ENSMUST00000029909 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Rab42Q0PD08 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Rab42Q0PD08 Steap2-203ENSMUST00000115425 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Rab42Q0PD08 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Rab42Q0PD08 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Rab42Q0PD08 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Rab42Q0PD08 Cpeb3-210ENSMUST00000136286 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Rab42Q0PD08 Zmym1-202ENSMUST00000106099 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Rab42Q0PD08 Rgs12-207ENSMUST00000114285 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Rab42Q0PD08 R3hdm2-210ENSMUST00000164831 2937 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Rab42Q0PD08 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC11.96□□□□□ -0.5
Rab42Q0PD08 Tars2-201ENSMUST00000029752 2400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Rab42Q0PD08 Lzts3-202ENSMUST00000089561 4169 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Rab42Q0PD08 Hexim2-201ENSMUST00000062530 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Rab42Q0PD08 Max-201ENSMUST00000082136 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Rab42Q0PD08 Rp2-201ENSMUST00000033372 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rab42Q0PD08 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rab42Q0PD08 Map4k1-203ENSMUST00000208227 2720 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rab42Q0PD08 Map4k1-201ENSMUST00000085835 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rab42Q0PD08 Mdga2-201ENSMUST00000037181 9833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rab42Q0PD08 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rab42Q0PD08 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rab42Q0PD08 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rab42Q0PD08 Pigq-209ENSMUST00000140304 1835 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rab42Q0PD08 Zap70-201ENSMUST00000027291 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rab42Q0PD08 Egr1-202ENSMUST00000165033 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rab42Q0PD08 Nars2-201ENSMUST00000044466 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rab42Q0PD08 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rab42Q0PD08 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rab42Q0PD08 Tspan12-201ENSMUST00000031678 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.7 ms