Protein–RNA interactions for Protein: Q0KL02

Trio, Triple functional domain protein, mousemouse

Predictions only

Length 3,102 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TrioQ0KL02 Gm44651-201ENSMUST00000207343 372 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
TrioQ0KL02 Cyth1-204ENSMUST00000106305 3179 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
TrioQ0KL02 Srsf5-202ENSMUST00000110351 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
TrioQ0KL02 Gm37165-201ENSMUST00000193815 1463 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
TrioQ0KL02 Prkcq-201ENSMUST00000028118 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
TrioQ0KL02 Gm15326-202ENSMUST00000128198 1422 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
TrioQ0KL02 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
TrioQ0KL02 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
TrioQ0KL02 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
TrioQ0KL02 Bop1-201ENSMUST00000023217 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
TrioQ0KL02 Ccdc94-201ENSMUST00000086869 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
TrioQ0KL02 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
TrioQ0KL02 R3hcc1-206ENSMUST00000216152 1467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
TrioQ0KL02 Pcca-201ENSMUST00000038374 2592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
TrioQ0KL02 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
TrioQ0KL02 Uox-202ENSMUST00000121133 768 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
TrioQ0KL02 Aamdc-213ENSMUST00000154853 883 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
TrioQ0KL02 Gm26185-201ENSMUST00000157692 266 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
TrioQ0KL02 Rps28-203ENSMUST00000173019 437 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
TrioQ0KL02 Rpe-202ENSMUST00000113995 2713 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
TrioQ0KL02 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
TrioQ0KL02 Rtraf-201ENSMUST00000022341 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
TrioQ0KL02 Mul1-202ENSMUST00000105813 3944 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
TrioQ0KL02 Brsk1-202ENSMUST00000120836 2867 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
TrioQ0KL02 Sema6c-201ENSMUST00000090821 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
TrioQ0KL02 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
TrioQ0KL02 Tmem219-202ENSMUST00000119781 1118 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
TrioQ0KL02 Has2os-201ENSMUST00000125401 485 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
TrioQ0KL02 Pabpc1l2a-ps-201ENSMUST00000128361 513 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
TrioQ0KL02 Gm17168-201ENSMUST00000169146 345 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
TrioQ0KL02 Mir6546-201ENSMUST00000184460 62 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
TrioQ0KL02 AC107638.1-201ENSMUST00000213690 1061 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
TrioQ0KL02 Olfr1368-201ENSMUST00000055298 1064 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
TrioQ0KL02 Wnt9a-201ENSMUST00000000128 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
TrioQ0KL02 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
TrioQ0KL02 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
TrioQ0KL02 Bbs5-202ENSMUST00000112286 1397 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
TrioQ0KL02 Odf3-202ENSMUST00000106049 1509 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
TrioQ0KL02 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
TrioQ0KL02 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
TrioQ0KL02 Cdk15-201ENSMUST00000114248 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
TrioQ0KL02 Mak-202ENSMUST00000070193 2937 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
TrioQ0KL02 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
TrioQ0KL02 Gm7899-201ENSMUST00000192935 1897 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
TrioQ0KL02 Src-202ENSMUST00000092576 3887 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
TrioQ0KL02 Pla2g10-202ENSMUST00000115807 964 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
TrioQ0KL02 Gm25951-201ENSMUST00000175330 64 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
TrioQ0KL02 Ighv5-7-201ENSMUST00000192302 244 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
TrioQ0KL02 Gm6458-201ENSMUST00000211573 635 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
TrioQ0KL02 Gm32025-201ENSMUST00000217960 307 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
TrioQ0KL02 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
TrioQ0KL02 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
TrioQ0KL02 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
TrioQ0KL02 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
TrioQ0KL02 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
TrioQ0KL02 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
TrioQ0KL02 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
TrioQ0KL02 Dnaaf2-201ENSMUST00000021356 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
TrioQ0KL02 AC096628.2-201ENSMUST00000225443 1413 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
TrioQ0KL02 Ighv5-2-201ENSMUST00000103442 350 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
TrioQ0KL02 1700030C14Rik-201ENSMUST00000139912 756 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
TrioQ0KL02 Gm43303-201ENSMUST00000200133 669 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
TrioQ0KL02 AC161537.1-201ENSMUST00000226199 1015 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
TrioQ0KL02 4930564D02Rik-201ENSMUST00000070584 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
TrioQ0KL02 Rpl34-202ENSMUST00000079085 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
TrioQ0KL02 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
TrioQ0KL02 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
TrioQ0KL02 Trim52-201ENSMUST00000022708 3075 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
TrioQ0KL02 Olfr288-202ENSMUST00000165379 2083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
TrioQ0KL02 Asb3-206ENSMUST00000203878 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
TrioQ0KL02 Ptpn14-201ENSMUST00000027898 2666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
TrioQ0KL02 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
TrioQ0KL02 Sgce-203ENSMUST00000101677 1656 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
TrioQ0KL02 Nfyc-203ENSMUST00000118902 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
TrioQ0KL02 Etv1-211ENSMUST00000162563 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
TrioQ0KL02 Rpl28-ps1-201ENSMUST00000121497 414 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
TrioQ0KL02 Gm15972-201ENSMUST00000132571 418 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
TrioQ0KL02 Gm10051-201ENSMUST00000145209 414 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
TrioQ0KL02 1700040D17Rik-201ENSMUST00000181305 998 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
TrioQ0KL02 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
TrioQ0KL02 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
TrioQ0KL02 Gm38102-201ENSMUST00000192791 1935 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
TrioQ0KL02 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
TrioQ0KL02 Rab17-201ENSMUST00000027529 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
TrioQ0KL02 Rusc1-201ENSMUST00000052539 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
TrioQ0KL02 Lysmd4-201ENSMUST00000058771 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
TrioQ0KL02 Gm14460-201ENSMUST00000121511 639 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
TrioQ0KL02 Gm3809-201ENSMUST00000180973 1006 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
TrioQ0KL02 Gm5597-201ENSMUST00000182353 1193 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
TrioQ0KL02 Rprl1-202ENSMUST00000198476 238 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
TrioQ0KL02 Gm8913-201ENSMUST00000209491 641 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
TrioQ0KL02 Mcm8-202ENSMUST00000066559 3397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
TrioQ0KL02 Tekt2-201ENSMUST00000030658 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
TrioQ0KL02 Ddi2-202ENSMUST00000177592 3539 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
TrioQ0KL02 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
TrioQ0KL02 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
TrioQ0KL02 Tcf4-226ENSMUST00000201094 2172 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
TrioQ0KL02 Cox4i2-201ENSMUST00000010020 727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
TrioQ0KL02 Pigp-205ENSMUST00000113917 805 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
TrioQ0KL02 Gm13035-201ENSMUST00000117496 342 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42 ms