Protein–RNA interactions for Protein: Q0HA38

Ttc21b, Tetratricopeptide repeat protein 21B, mousemouse

Predictions only

Length 1,315 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc21bQ0HA38 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ttc21bQ0HA38 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ttc21bQ0HA38 Gm23270-201ENSMUST00000104055 131 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
Ttc21bQ0HA38 Rbm3-202ENSMUST00000115615 1183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ttc21bQ0HA38 Rbm3-203ENSMUST00000115616 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ttc21bQ0HA38 Gm14017-201ENSMUST00000121934 386 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
Ttc21bQ0HA38 Eif4e1b-204ENSMUST00000132005 706 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ttc21bQ0HA38 Gm38317-201ENSMUST00000195564 343 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
Ttc21bQ0HA38 4933431M02Rik-201ENSMUST00000203905 1432 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ttc21bQ0HA38 Tmem14a-202ENSMUST00000027065 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ttc21bQ0HA38 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ttc21bQ0HA38 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ttc21bQ0HA38 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ttc21bQ0HA38 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ttc21bQ0HA38 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ttc21bQ0HA38 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ttc21bQ0HA38 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ttc21bQ0HA38 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ttc21bQ0HA38 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ttc21bQ0HA38 Gm4366-201ENSMUST00000201488 1342 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
Ttc21bQ0HA38 Yipf1-201ENSMUST00000075693 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ttc21bQ0HA38 Nek6-203ENSMUST00000112902 3147 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ttc21bQ0HA38 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ttc21bQ0HA38 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ttc21bQ0HA38 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ttc21bQ0HA38 Noxa1-202ENSMUST00000114373 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ttc21bQ0HA38 Mansc1-201ENSMUST00000047443 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ttc21bQ0HA38 Dnmt3l-205ENSMUST00000138785 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ttc21bQ0HA38 Olfr56-204ENSMUST00000203149 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ttc21bQ0HA38 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ttc21bQ0HA38 Clic3-202ENSMUST00000114265 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ttc21bQ0HA38 Rbm3-ps-201ENSMUST00000121422 465 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
Ttc21bQ0HA38 Gm15979-201ENSMUST00000149741 590 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ttc21bQ0HA38 Prr13-204ENSMUST00000164957 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ttc21bQ0HA38 H2al1g-201ENSMUST00000179859 509 ntAPPRIS P1 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ttc21bQ0HA38 Gm38297-201ENSMUST00000195122 1057 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
Ttc21bQ0HA38 Gm44992-206ENSMUST00000209313 1261 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ttc21bQ0HA38 Gm9004-201ENSMUST00000218739 1222 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
Ttc21bQ0HA38 Gm18615-201ENSMUST00000222919 1031 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
Ttc21bQ0HA38 Cyb5d1-201ENSMUST00000051620 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ttc21bQ0HA38 Olfr533-203ENSMUST00000215308 2345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ttc21bQ0HA38 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ttc21bQ0HA38 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ttc21bQ0HA38 Duxf3-202ENSMUST00000176875 2025 ntAPPRIS P1 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ttc21bQ0HA38 Gm44775-201ENSMUST00000207266 1456 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
Ttc21bQ0HA38 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ttc21bQ0HA38 Tsta3-201ENSMUST00000023231 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ttc21bQ0HA38 Tspan32-203ENSMUST00000082008 1587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ttc21bQ0HA38 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ttc21bQ0HA38 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ttc21bQ0HA38 Fam118b-202ENSMUST00000063782 1662 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ttc21bQ0HA38 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ttc21bQ0HA38 Spsb1-202ENSMUST00000105684 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ttc21bQ0HA38 Tmem53-203ENSMUST00000106434 923 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ttc21bQ0HA38 C330007P06Rik-203ENSMUST00000115249 1145 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ttc21bQ0HA38 Gm26956-201ENSMUST00000182176 986 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Ttc21bQ0HA38 Gm4598-201ENSMUST00000206756 1080 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ttc21bQ0HA38 4933436H12Rik-201ENSMUST00000207304 658 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ttc21bQ0HA38 Gm13097-201ENSMUST00000210722 397 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Ttc21bQ0HA38 Gm19605-201ENSMUST00000220603 686 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ttc21bQ0HA38 Fam96a-201ENSMUST00000034945 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ttc21bQ0HA38 Odf4-201ENSMUST00000038932 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ttc21bQ0HA38 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ttc21bQ0HA38 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ttc21bQ0HA38 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ttc21bQ0HA38 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ttc21bQ0HA38 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ttc21bQ0HA38 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ttc21bQ0HA38 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ttc21bQ0HA38 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ttc21bQ0HA38 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ttc21bQ0HA38 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ttc21bQ0HA38 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ttc21bQ0HA38 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ttc21bQ0HA38 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ttc21bQ0HA38 Cmip-201ENSMUST00000095172 2276 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ttc21bQ0HA38 Wsb2-ps-201ENSMUST00000117937 1217 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Ttc21bQ0HA38 Adamtsl1-204ENSMUST00000120678 977 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ttc21bQ0HA38 Gm14966-202ENSMUST00000129675 649 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ttc21bQ0HA38 Gm15829-201ENSMUST00000145415 869 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ttc21bQ0HA38 Igdcc4-203ENSMUST00000166273 778 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ttc21bQ0HA38 Mocs2-215ENSMUST00000184335 646 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ttc21bQ0HA38 Crabp2-201ENSMUST00000005019 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ttc21bQ0HA38 Asb8-201ENSMUST00000059112 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ttc21bQ0HA38 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ttc21bQ0HA38 Th-201ENSMUST00000000219 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ttc21bQ0HA38 Ephx2-201ENSMUST00000070515 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ttc21bQ0HA38 Gm10782-202ENSMUST00000223775 1480 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Ttc21bQ0HA38 Nmral1-202ENSMUST00000079130 1459 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ttc21bQ0HA38 Zfand4-202ENSMUST00000112900 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ttc21bQ0HA38 Hsd3b3-203ENSMUST00000107018 1443 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ttc21bQ0HA38 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ttc21bQ0HA38 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ttc21bQ0HA38 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ttc21bQ0HA38 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ttc21bQ0HA38 Rpl15-203ENSMUST00000100799 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ttc21bQ0HA38 Lcn6-203ENSMUST00000114199 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ttc21bQ0HA38 Egfl7-209ENSMUST00000150404 892 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ttc21bQ0HA38 Gm2546-201ENSMUST00000182630 991 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Ttc21bQ0HA38 Gm4691-202ENSMUST00000182989 885 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.1 ms