Protein–RNA interactions for Protein: Q05895

Thbs3, Thrombospondin-3, mousemouse

Predictions only

Length 956 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Thbs3Q05895 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Thbs3Q05895 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Thbs3Q05895 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Thbs3Q05895 Gm43650-201ENSMUST00000197337 1382 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Thbs3Q05895 Gm30214-201ENSMUST00000199271 1383 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Thbs3Q05895 Gm21038-201ENSMUST00000222205 1383 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Thbs3Q05895 Gnb2-202ENSMUST00000111020 1470 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Thbs3Q05895 Actn4-201ENSMUST00000068045 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Thbs3Q05895 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Thbs3Q05895 Smarcb1-201ENSMUST00000000925 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Thbs3Q05895 Plekha7-203ENSMUST00000181998 5149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Thbs3Q05895 Abat-203ENSMUST00000115839 2414 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Thbs3Q05895 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Thbs3Q05895 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Thbs3Q05895 Gm13387-202ENSMUST00000131147 2646 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Thbs3Q05895 Il11ra1-203ENSMUST00000108041 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Thbs3Q05895 Gm13305-201ENSMUST00000098121 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Thbs3Q05895 Catsper3-202ENSMUST00000109898 1311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Thbs3Q05895 Gm11978-202ENSMUST00000127510 1303 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Thbs3Q05895 Tbc1d1-201ENSMUST00000043893 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Thbs3Q05895 Gpr19-208ENSMUST00000165392 1643 ntTSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Thbs3Q05895 Gpr19-202ENSMUST00000066107 1647 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Thbs3Q05895 Gm15684-201ENSMUST00000160605 1814 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Thbs3Q05895 Tcn2-204ENSMUST00000109990 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Thbs3Q05895 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Thbs3Q05895 Hectd1-201ENSMUST00000042052 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Thbs3Q05895 Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 2128 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Thbs3Q05895 Dysf-201ENSMUST00000081904 6660 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Thbs3Q05895 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Thbs3Q05895 Zfp365-201ENSMUST00000064656 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Thbs3Q05895 Ngef-201ENSMUST00000027477 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Thbs3Q05895 Grtp1-206ENSMUST00000210317 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Thbs3Q05895 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Thbs3Q05895 Dnm1-214ENSMUST00000201433 3146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Thbs3Q05895 Tomm5-204ENSMUST00000107810 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Thbs3Q05895 0610010K14Rik-205ENSMUST00000108575 643 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Thbs3Q05895 Gm12416-201ENSMUST00000120911 1008 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Thbs3Q05895 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Thbs3Q05895 Gldnos-201ENSMUST00000149237 841 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Thbs3Q05895 Gm12840-201ENSMUST00000156081 627 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Thbs3Q05895 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Thbs3Q05895 Gm26600-201ENSMUST00000181637 1256 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Thbs3Q05895 Fcrl1-204ENSMUST00000191666 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Thbs3Q05895 AC135669.1-201ENSMUST00000213585 412 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Thbs3Q05895 Ccdc159-204ENSMUST00000216710 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Thbs3Q05895 1700011B04Rik-206ENSMUST00000221013 824 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Thbs3Q05895 AC192088.1-201ENSMUST00000227561 301 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Thbs3Q05895 Tmem116-201ENSMUST00000031405 1288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Thbs3Q05895 Fam173b-201ENSMUST00000042702 1164 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Thbs3Q05895 Tex13c3-201ENSMUST00000089246 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Thbs3Q05895 Prg4-207ENSMUST00000162367 1480 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Thbs3Q05895 Zic4-209ENSMUST00000173933 1764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Thbs3Q05895 Gpr19-204ENSMUST00000116515 2075 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Thbs3Q05895 Trim32-202ENSMUST00000107366 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Thbs3Q05895 Macrod2-204ENSMUST00000110062 3554 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Thbs3Q05895 Rev3l-201ENSMUST00000019986 10713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Thbs3Q05895 Rnf40-202ENSMUST00000205694 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Thbs3Q05895 Pde12-201ENSMUST00000052932 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Thbs3Q05895 Adad1-203ENSMUST00000144629 3101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Thbs3Q05895 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Thbs3Q05895 Cog7-201ENSMUST00000057576 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Thbs3Q05895 Xkr5-202ENSMUST00000095438 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Thbs3Q05895 Dao-203ENSMUST00000161610 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Thbs3Q05895 C130050O18Rik-201ENSMUST00000052176 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Thbs3Q05895 Glod4-201ENSMUST00000017430 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Thbs3Q05895 B3gat1-204ENSMUST00000160899 3801 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Thbs3Q05895 Mbp-205ENSMUST00000091789 4797 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Thbs3Q05895 Adck5-207ENSMUST00000160784 1998 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Thbs3Q05895 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Thbs3Q05895 Dnajc5g-201ENSMUST00000066544 1565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Thbs3Q05895 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Thbs3Q05895 Arr3-201ENSMUST00000113769 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Thbs3Q05895 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Thbs3Q05895 Tmem176b-201ENSMUST00000101429 1238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Thbs3Q05895 Gm12341-201ENSMUST00000119724 503 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Thbs3Q05895 Gm13185-201ENSMUST00000131044 944 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Thbs3Q05895 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Thbs3Q05895 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Thbs3Q05895 B9d2-202ENSMUST00000205325 593 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Thbs3Q05895 Gm18307-201ENSMUST00000206864 949 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Thbs3Q05895 Dkkl1-204ENSMUST00000210741 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Thbs3Q05895 Ndufs6-201ENSMUST00000022097 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Thbs3Q05895 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Thbs3Q05895 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Thbs3Q05895 Eapp-201ENSMUST00000067272 590 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Thbs3Q05895 Hjurp-206ENSMUST00000147393 2030 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Thbs3Q05895 Yipf6-201ENSMUST00000054697 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Thbs3Q05895 Cux2-202ENSMUST00000111752 8784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Thbs3Q05895 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Thbs3Q05895 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Thbs3Q05895 Gm12280-201ENSMUST00000155836 1624 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Thbs3Q05895 Myh3-201ENSMUST00000007301 5992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Thbs3Q05895 Slc38a10-204ENSMUST00000103018 4578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Thbs3Q05895 Men1-202ENSMUST00000078137 2738 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Thbs3Q05895 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Thbs3Q05895 Gm26880-201ENSMUST00000181610 1318 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Thbs3Q05895 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Thbs3Q05895 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Thbs3Q05895 Nr2f2-201ENSMUST00000032768 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Thbs3Q05895 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.6 ms