Protein–RNA interactions for Protein: Q04690

Nf1, Neurofibromin, mousemouse

Predictions only

Length 2,841 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nf1Q04690 Tshr-201ENSMUST00000021343 1339 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Nf1Q04690 Dnaaf5-201ENSMUST00000026975 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Nf1Q04690 Defb36-201ENSMUST00000058086 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Nf1Q04690 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Nf1Q04690 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Nf1Q04690 Lag3-201ENSMUST00000032217 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Nf1Q04690 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Nf1Q04690 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Nf1Q04690 Tmub1-203ENSMUST00000115036 1455 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Nf1Q04690 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Nf1Q04690 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Nf1Q04690 Gm23270-201ENSMUST00000104055 131 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Nf1Q04690 Park7-202ENSMUST00000105673 919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
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Nf1Q04690 Gm15395-201ENSMUST00000153724 702 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Nf1Q04690 Gm16740-201ENSMUST00000181819 956 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Nf1Q04690 Gm33222-201ENSMUST00000193725 654 ntTSL 3 BASIC10.35□□□□□ -0.75
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Nf1Q04690 H2-Oa-201ENSMUST00000025192 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Nf1Q04690 Rbp2-201ENSMUST00000035029 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Nf1Q04690 Mlf1-201ENSMUST00000061322 1113 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Nf1Q04690 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Nf1Q04690 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Nf1Q04690 Nme8-202ENSMUST00000091763 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Nf1Q04690 Mrap2-201ENSMUST00000049457 1931 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Nf1Q04690 Slc7a6-201ENSMUST00000034378 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Nf1Q04690 Plcd1-203ENSMUST00000214470 2706 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Nf1Q04690 1110002L01Rik-202ENSMUST00000168012 3569 ntTSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
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Nf1Q04690 Rxrg-204ENSMUST00000111386 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Nf1Q04690 Krt31-201ENSMUST00000007318 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Nf1Q04690 Cpeb4-201ENSMUST00000020543 2312 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Nf1Q04690 Nkain3-201ENSMUST00000102998 3098 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Nf1Q04690 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Nf1Q04690 Arnt-203ENSMUST00000102749 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
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Nf1Q04690 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Nf1Q04690 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Nf1Q04690 Eno1b-201ENSMUST00000076155 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Nf1Q04690 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Nf1Q04690 Slc7a15-201ENSMUST00000036938 1907 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
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Nf1Q04690 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Nf1Q04690 Fhl4-202ENSMUST00000216889 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Nf1Q04690 Pak4-201ENSMUST00000032823 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
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Nf1Q04690 Mitd1-205ENSMUST00000139725 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Nf1Q04690 Gm26740-201ENSMUST00000180456 358 ntTSL 3 BASIC10.34□□□□□ -0.75
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Nf1Q04690 Rpl18-201ENSMUST00000072503 679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Nf1Q04690 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
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Nf1Q04690 Itln1-201ENSMUST00000043094 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Nf1Q04690 Vmn1r213-201ENSMUST00000076897 1155 ntAPPRIS P2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Nf1Q04690 Pkp3-201ENSMUST00000066873 2848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Nf1Q04690 Wapl-205ENSMUST00000169910 4066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Nf1Q04690 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Nf1Q04690 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Nf1Q04690 A230072I06Rik-201ENSMUST00000098935 1839 ntAPPRIS P1 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Nf1Q04690 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Nf1Q04690 Daam2-202ENSMUST00000224595 1926 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
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Nf1Q04690 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Nf1Q04690 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Nf1Q04690 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Nf1Q04690 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Nf1Q04690 Ttc4-202ENSMUST00000106772 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Nf1Q04690 Cox16-202ENSMUST00000110340 668 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Nf1Q04690 Gm13010-201ENSMUST00000140495 828 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Nf1Q04690 Tnni1-205ENSMUST00000148201 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Nf1Q04690 Gm16046-203ENSMUST00000150889 1001 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Nf1Q04690 Tnni1-206ENSMUST00000152075 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Nf1Q04690 Tnni1-207ENSMUST00000152208 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Nf1Q04690 Gm8738-201ENSMUST00000172606 329 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Nf1Q04690 Pmvk-203ENSMUST00000184515 1156 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Nf1Q04690 Lypd2-201ENSMUST00000023260 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Nf1Q04690 Dppa4-202ENSMUST00000096045 1534 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
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