Protein–RNA interactions for Protein: Q03717

Kcnb1, Potassium voltage-gated channel subfamily B member 1, mousemouse

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Length 857 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnb1Q03717 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Kcnb1Q03717 Foxo6os-201ENSMUST00000152384 2291 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Kcnb1Q03717 Canx-205ENSMUST00000179865 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Kcnb1Q03717 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Kcnb1Q03717 Gm43273-201ENSMUST00000199649 2594 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Kcnb1Q03717 Pla2g15-204ENSMUST00000212963 2578 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Kcnb1Q03717 Arl4a-205ENSMUST00000146905 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Kcnb1Q03717 Ptpn11-202ENSMUST00000100770 5599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Kcnb1Q03717 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Kcnb1Q03717 Rassf5-201ENSMUST00000027688 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Kcnb1Q03717 Rps6ka4-202ENSMUST00000170516 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Kcnb1Q03717 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Kcnb1Q03717 Gm45799-201ENSMUST00000106785 367 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Kcnb1Q03717 Gm15966-201ENSMUST00000136853 480 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Kcnb1Q03717 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Kcnb1Q03717 Gm5279-201ENSMUST00000199575 745 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Kcnb1Q03717 Arhgap20-201ENSMUST00000065496 7161 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Kcnb1Q03717 Dnpep-209ENSMUST00000187836 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Kcnb1Q03717 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Kcnb1Q03717 Fbxo34-205ENSMUST00000168833 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Kcnb1Q03717 Mfsd4a-205ENSMUST00000144548 3288 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Kcnb1Q03717 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Kcnb1Q03717 Gm42688-201ENSMUST00000101253 3628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Kcnb1Q03717 Gpr35-205ENSMUST00000186298 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Kcnb1Q03717 Prdx2-203ENSMUST00000109734 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Kcnb1Q03717 Ctsk-201ENSMUST00000015664 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Kcnb1Q03717 Cbl-206ENSMUST00000206147 3452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Kcnb1Q03717 Speg-205ENSMUST00000113590 3393 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Kcnb1Q03717 Mdm2-201ENSMUST00000020408 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Kcnb1Q03717 Pqlc2-202ENSMUST00000105801 2756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Kcnb1Q03717 Creb3l3-201ENSMUST00000117422 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Kcnb1Q03717 Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 3301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Kcnb1Q03717 Arid4b-202ENSMUST00000110533 3020 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Kcnb1Q03717 Tmem51os1-203ENSMUST00000150202 1667 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Kcnb1Q03717 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Kcnb1Q03717 March8-213ENSMUST00000203193 4245 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Kcnb1Q03717 Gtf2i-206ENSMUST00000172715 4114 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Kcnb1Q03717 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Kcnb1Q03717 Cd63-202ENSMUST00000105229 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Kcnb1Q03717 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Kcnb1Q03717 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Kcnb1Q03717 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Kcnb1Q03717 Gm15321-201ENSMUST00000121290 288 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
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Kcnb1Q03717 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Kcnb1Q03717 Smyd3-207ENSMUST00000194237 1047 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Kcnb1Q03717 Gm43094-201ENSMUST00000196549 921 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
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Kcnb1Q03717 Gm17870-201ENSMUST00000219489 1174 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
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Kcnb1Q03717 Rinl-201ENSMUST00000059857 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Kcnb1Q03717 Nepn-201ENSMUST00000067085 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Kcnb1Q03717 Pkp3-202ENSMUST00000106039 2919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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Kcnb1Q03717 Suv39h1-201ENSMUST00000115636 2707 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Kcnb1Q03717 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Kcnb1Q03717 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Kcnb1Q03717 Rnf19b-202ENSMUST00000097874 1992 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Kcnb1Q03717 Nrd1-202ENSMUST00000102736 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Kcnb1Q03717 Alox12e-201ENSMUST00000019051 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Kcnb1Q03717 Pde9a-203ENSMUST00000127929 1891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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Kcnb1Q03717 Prkcq-201ENSMUST00000028118 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Kcnb1Q03717 0610009O20Rik-201ENSMUST00000025314 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Kcnb1Q03717 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Kcnb1Q03717 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Kcnb1Q03717 Coq7-205ENSMUST00000209146 799 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Kcnb1Q03717 Tmem116-201ENSMUST00000031405 1288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Kcnb1Q03717 Gpr19-202ENSMUST00000066107 1647 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Kcnb1Q03717 Cenpl-202ENSMUST00000111618 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Kcnb1Q03717 Ywhab-201ENSMUST00000018470 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Kcnb1Q03717 Arfip2-206ENSMUST00000131446 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Kcnb1Q03717 Myadm-203ENSMUST00000203328 1899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Kcnb1Q03717 Zfp367-201ENSMUST00000059817 3532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Kcnb1Q03717 Calr3-201ENSMUST00000019876 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Kcnb1Q03717 Ddx27-201ENSMUST00000018143 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Kcnb1Q03717 Mrps30-201ENSMUST00000022245 3319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Kcnb1Q03717 Sp2-201ENSMUST00000062652 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Kcnb1Q03717 Lag3-201ENSMUST00000032217 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Kcnb1Q03717 Pdlim7-201ENSMUST00000046246 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Kcnb1Q03717 Astl-202ENSMUST00000089673 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Kcnb1Q03717 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.3 ms