Protein–RNA interactions for Protein: Q01320

Top2a, DNA topoisomerase 2-alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,528 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top2aQ01320 Gm13381-202ENSMUST00000177012 640 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Top2aQ01320 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Top2aQ01320 Otop2-202ENSMUST00000106544 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Top2aQ01320 Txndc2-201ENSMUST00000050236 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Top2aQ01320 Klf12-201ENSMUST00000097079 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Top2aQ01320 Noto-201ENSMUST00000089578 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Top2aQ01320 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Top2aQ01320 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Top2aQ01320 Gm28386-201ENSMUST00000189147 1849 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Top2aQ01320 Ccdc155-201ENSMUST00000121017 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Top2aQ01320 Il12rb1-205ENSMUST00000212657 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Top2aQ01320 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Top2aQ01320 Muc1-201ENSMUST00000041142 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Top2aQ01320 Agpat4-201ENSMUST00000024594 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Top2aQ01320 Mir5120-201ENSMUST00000175020 78 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Top2aQ01320 Gm23363-201ENSMUST00000175024 79 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Top2aQ01320 Gm28379-201ENSMUST00000186450 554 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Top2aQ01320 Fgfr3-ps-201ENSMUST00000195511 1137 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Top2aQ01320 Tpd52l1-203ENSMUST00000213639 827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Top2aQ01320 Cryga-201ENSMUST00000061497 625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Top2aQ01320 Gm22058-201ENSMUST00000083393 310 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Top2aQ01320 Bad-201ENSMUST00000025910 1451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Top2aQ01320 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Top2aQ01320 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Top2aQ01320 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Top2aQ01320 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Top2aQ01320 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
Top2aQ01320 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Top2aQ01320 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Top2aQ01320 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Top2aQ01320 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Top2aQ01320 Gm12502-201ENSMUST00000120197 444 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Top2aQ01320 Tnfrsf18-203ENSMUST00000122001 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Top2aQ01320 Tmem40-205ENSMUST00000166254 811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Top2aQ01320 H2afz-206ENSMUST00000173790 437 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Top2aQ01320 AC159263.1-201ENSMUST00000220746 482 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Top2aQ01320 Mrps21-201ENSMUST00000067298 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Top2aQ01320 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Top2aQ01320 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Top2aQ01320 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Top2aQ01320 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Top2aQ01320 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Top2aQ01320 Cpa1-201ENSMUST00000031806 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Top2aQ01320 Efemp2-209ENSMUST00000167371 1382 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Top2aQ01320 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Top2aQ01320 Hsd3b7-201ENSMUST00000046863 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Top2aQ01320 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Top2aQ01320 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Top2aQ01320 Cog7-201ENSMUST00000057576 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Top2aQ01320 1700037C18Rik-202ENSMUST00000115859 2592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Top2aQ01320 Nup93-201ENSMUST00000079961 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Top2aQ01320 Mymx-201ENSMUST00000113529 442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Top2aQ01320 Pqbp1-203ENSMUST00000115655 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Top2aQ01320 Mocs2-215ENSMUST00000184335 646 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Top2aQ01320 CT009718.3-201ENSMUST00000221116 367 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Top2aQ01320 Asb8-201ENSMUST00000059112 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Top2aQ01320 S100pbp-205ENSMUST00000117350 2241 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Top2aQ01320 Nmbr-201ENSMUST00000020015 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Top2aQ01320 Stau2-214ENSMUST00000162007 2964 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Top2aQ01320 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Top2aQ01320 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Top2aQ01320 Lrrc8a-202ENSMUST00000113654 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Top2aQ01320 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Top2aQ01320 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Top2aQ01320 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Top2aQ01320 0610009O20Rik-201ENSMUST00000025314 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Top2aQ01320 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Top2aQ01320 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Top2aQ01320 Tmub1-203ENSMUST00000115036 1455 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Top2aQ01320 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Top2aQ01320 Pla2g10-202ENSMUST00000115807 964 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Top2aQ01320 Gm15395-201ENSMUST00000153724 702 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Top2aQ01320 Gm26973-201ENSMUST00000182105 696 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Top2aQ01320 Gm5869-201ENSMUST00000200248 1257 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Top2aQ01320 AU022133-201ENSMUST00000200601 873 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Top2aQ01320 Gm38979-201ENSMUST00000207099 698 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Top2aQ01320 Gm42067-201ENSMUST00000209642 647 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Top2aQ01320 1700012D14Rik-202ENSMUST00000209959 629 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Top2aQ01320 Gm10702-201ENSMUST00000098929 1268 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Top2aQ01320 Myl6-202ENSMUST00000217733 1668 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Top2aQ01320 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Top2aQ01320 A930007I19Rik-203ENSMUST00000181726 2099 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Top2aQ01320 Rph3a-203ENSMUST00000202326 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Top2aQ01320 Abhd1-202ENSMUST00000201125 1352 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Top2aQ01320 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Top2aQ01320 Gsdmd-201ENSMUST00000023238 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Top2aQ01320 Bmp3-202ENSMUST00000197143 2739 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Top2aQ01320 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Top2aQ01320 Fam57b-202ENSMUST00000098032 1894 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Top2aQ01320 Tulp2-201ENSMUST00000024233 1749 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Top2aQ01320 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Top2aQ01320 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Top2aQ01320 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Top2aQ01320 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Top2aQ01320 Pla2g2f-201ENSMUST00000030526 2465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Top2aQ01320 Got1-201ENSMUST00000026196 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Top2aQ01320 Zfp672-204ENSMUST00000108829 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Top2aQ01320 Bnip3l-ps-201ENSMUST00000101577 657 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Top2aQ01320 Prr15l-203ENSMUST00000107633 930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Top2aQ01320 Gm6370-201ENSMUST00000110611 1142 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.1 ms