Protein–RNA interactions for Protein: Q01097

Grin2b, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2B, mousemouse

Predictions only

Length 1,482 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grin2bQ01097 Gcdh-202ENSMUST00000109745 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Grin2bQ01097 Wwox-201ENSMUST00000004756 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Grin2bQ01097 Lmf2-201ENSMUST00000023283 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Grin2bQ01097 Ccne2-201ENSMUST00000029866 3006 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Grin2bQ01097 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Grin2bQ01097 Abra-201ENSMUST00000054742 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Grin2bQ01097 H2-T22-203ENSMUST00000080015 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Grin2bQ01097 Olfr1234-202ENSMUST00000111543 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Grin2bQ01097 Taf6l-202ENSMUST00000010249 848 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Grin2bQ01097 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Grin2bQ01097 Snx29-202ENSMUST00000115814 1125 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Grin2bQ01097 Zar1l-201ENSMUST00000118769 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Grin2bQ01097 Gm16296-201ENSMUST00000159905 325 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Grin2bQ01097 Gm38804-201ENSMUST00000203998 767 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Grin2bQ01097 Gm32633-201ENSMUST00000205726 587 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Grin2bQ01097 AC159263.1-201ENSMUST00000220746 482 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Grin2bQ01097 Gzmn-202ENSMUST00000225535 989 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Grin2bQ01097 AC167013.1-201ENSMUST00000228592 202 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Grin2bQ01097 Tspan13-201ENSMUST00000020896 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Grin2bQ01097 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Grin2bQ01097 Hmga1-203ENSMUST00000117600 1635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Grin2bQ01097 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Grin2bQ01097 2900069G24Rik-201ENSMUST00000192780 1311 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Grin2bQ01097 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Grin2bQ01097 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Grin2bQ01097 Maged2-204ENSMUST00000112700 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Grin2bQ01097 4930556M19Rik-201ENSMUST00000180604 2468 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Grin2bQ01097 Zfp157-203ENSMUST00000110912 886 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Grin2bQ01097 Pla2g1b-202ENSMUST00000112071 361 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Grin2bQ01097 Qdpr-202ENSMUST00000117425 1231 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Grin2bQ01097 Gm13296-201ENSMUST00000117854 997 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Grin2bQ01097 Hmgn1-202ENSMUST00000133885 261 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Grin2bQ01097 U2af1l4-206ENSMUST00000163654 781 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Grin2bQ01097 U2af1l4-221ENSMUST00000167361 860 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Grin2bQ01097 Gm17028-201ENSMUST00000170026 704 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Grin2bQ01097 Gm28982-201ENSMUST00000186895 512 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Grin2bQ01097 Pym1-203ENSMUST00000218218 1143 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Grin2bQ01097 Gm45925-201ENSMUST00000218882 744 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Grin2bQ01097 Olfr524-201ENSMUST00000051943 1058 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Grin2bQ01097 Asb18-202ENSMUST00000097656 788 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Grin2bQ01097 Zfp422-202ENSMUST00000079749 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Grin2bQ01097 Rsph3b-201ENSMUST00000024572 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Grin2bQ01097 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Grin2bQ01097 Ngly1-207ENSMUST00000224656 2329 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Grin2bQ01097 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Grin2bQ01097 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Grin2bQ01097 5430400D12Rik-201ENSMUST00000181717 1690 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Grin2bQ01097 Cops5-201ENSMUST00000027050 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Grin2bQ01097 Gm13848-201ENSMUST00000130777 2047 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Grin2bQ01097 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Grin2bQ01097 Prok2-203ENSMUST00000101120 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Grin2bQ01097 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Grin2bQ01097 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Grin2bQ01097 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Grin2bQ01097 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Grin2bQ01097 Spint5-201ENSMUST00000103097 443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Grin2bQ01097 S100a14-201ENSMUST00000164481 915 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Grin2bQ01097 Erdr1-201ENSMUST00000177591 774 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Grin2bQ01097 Spint5-202ENSMUST00000180193 443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Grin2bQ01097 Acsm5-207ENSMUST00000207813 1084 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Grin2bQ01097 C230062I16Rik-204ENSMUST00000208342 643 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Grin2bQ01097 Gm39404-201ENSMUST00000216350 313 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
Grin2bQ01097 C1qb-201ENSMUST00000046384 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Grin2bQ01097 Stx17-201ENSMUST00000064765 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Grin2bQ01097 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Grin2bQ01097 Hnrnpul1-201ENSMUST00000043765 3354 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Grin2bQ01097 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Grin2bQ01097 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Grin2bQ01097 Gm10544-201ENSMUST00000180516 2239 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Grin2bQ01097 Arhgap20os-204ENSMUST00000152203 2113 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Grin2bQ01097 Gm2673-201ENSMUST00000120958 1608 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
Grin2bQ01097 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Grin2bQ01097 Micu1-202ENSMUST00000092508 2294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Grin2bQ01097 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Grin2bQ01097 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Grin2bQ01097 Pigh-201ENSMUST00000072154 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Grin2bQ01097 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Grin2bQ01097 Fthl17d-201ENSMUST00000105004 856 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Grin2bQ01097 Gm28139-201ENSMUST00000189480 643 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Grin2bQ01097 Cga-201ENSMUST00000029975 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Grin2bQ01097 Il25-201ENSMUST00000037863 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Grin2bQ01097 Krtap19-1-201ENSMUST00000081334 493 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Grin2bQ01097 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Grin2bQ01097 AW209491-202ENSMUST00000178289 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Grin2bQ01097 Miga2-208ENSMUST00000140075 2196 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Grin2bQ01097 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Grin2bQ01097 Gm6992-201ENSMUST00000217973 1607 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
Grin2bQ01097 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Grin2bQ01097 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Grin2bQ01097 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Grin2bQ01097 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Grin2bQ01097 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Grin2bQ01097 Tssk5-201ENSMUST00000071119 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Grin2bQ01097 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Grin2bQ01097 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Grin2bQ01097 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Grin2bQ01097 Slc35c2-202ENSMUST00000109298 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Grin2bQ01097 Dnpep-202ENSMUST00000113605 1571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Grin2bQ01097 Gm6335-201ENSMUST00000118081 1194 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
Grin2bQ01097 Gm12616-201ENSMUST00000118594 382 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms