Protein–RNA interactions for Protein: Q00724

Rbp4, Retinol-binding protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbp4Q00724 Pef1-202ENSMUST00000118199 1915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rbp4Q00724 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rbp4Q00724 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rbp4Q00724 Pdpk1-204ENSMUST00000115409 4623 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rbp4Q00724 Olfr322-202ENSMUST00000213232 4632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rbp4Q00724 Zmynd15-202ENSMUST00000092958 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rbp4Q00724 Grm5-202ENSMUST00000125009 8047 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rbp4Q00724 Arap1-204ENSMUST00000107010 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rbp4Q00724 Kctd18-202ENSMUST00000114410 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rbp4Q00724 Cfap69-201ENSMUST00000054865 4956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rbp4Q00724 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rbp4Q00724 Anapc15-204ENSMUST00000106973 650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rbp4Q00724 Ndufa13-201ENSMUST00000110167 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rbp4Q00724 Gm14730-201ENSMUST00000122378 1045 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Rbp4Q00724 Ube4bos1-202ENSMUST00000151896 1286 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rbp4Q00724 Smyd3-207ENSMUST00000194237 1047 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rbp4Q00724 Gm7498-201ENSMUST00000203282 1084 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Rbp4Q00724 Tdrp-206ENSMUST00000210414 323 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rbp4Q00724 Gm45384-201ENSMUST00000210451 277 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Rbp4Q00724 Gm18934-201ENSMUST00000216671 1044 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Rbp4Q00724 Isca2-201ENSMUST00000021667 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rbp4Q00724 Ccdc159-204ENSMUST00000216710 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rbp4Q00724 AC192088.1-201ENSMUST00000227561 301 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Rbp4Q00724 Clps-201ENSMUST00000025062 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rbp4Q00724 Tmem107-202ENSMUST00000094081 1263 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rbp4Q00724 Tspan32-205ENSMUST00000105924 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rbp4Q00724 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rbp4Q00724 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rbp4Q00724 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rbp4Q00724 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rbp4Q00724 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rbp4Q00724 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rbp4Q00724 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rbp4Q00724 Brd2-201ENSMUST00000025193 4374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rbp4Q00724 Taok2-202ENSMUST00000117394 4985 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rbp4Q00724 Gm35339-201ENSMUST00000208833 5090 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rbp4Q00724 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rbp4Q00724 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rbp4Q00724 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rbp4Q00724 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rbp4Q00724 AC161252.3-201ENSMUST00000225465 1549 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Rbp4Q00724 Usp19-203ENSMUST00000166103 4473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rbp4Q00724 Ak4-201ENSMUST00000102780 4186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rbp4Q00724 B3galnt2-201ENSMUST00000099747 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rbp4Q00724 Golga4-201ENSMUST00000084820 7583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rbp4Q00724 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rbp4Q00724 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rbp4Q00724 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rbp4Q00724 Ephb1-202ENSMUST00000085169 4101 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rbp4Q00724 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rbp4Q00724 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rbp4Q00724 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rbp4Q00724 Fggy-202ENSMUST00000079223 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rbp4Q00724 Pcgf2-201ENSMUST00000018681 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rbp4Q00724 Atg2b-201ENSMUST00000041055 7546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rbp4Q00724 Slc6a6-201ENSMUST00000032185 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rbp4Q00724 Slco3a1-202ENSMUST00000098371 2709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rbp4Q00724 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rbp4Q00724 Rita1-201ENSMUST00000031599 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rbp4Q00724 Rasal3-201ENSMUST00000063824 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rbp4Q00724 Car6-202ENSMUST00000105683 1460 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rbp4Q00724 Wipf3-201ENSMUST00000126637 4414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rbp4Q00724 Ppp1r18-206ENSMUST00000190496 1395 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rbp4Q00724 Fam53b-205ENSMUST00000106166 1270 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rbp4Q00724 Eogt-202ENSMUST00000113387 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rbp4Q00724 Gm12416-201ENSMUST00000120911 1008 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Rbp4Q00724 Cd209g-201ENSMUST00000130372 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rbp4Q00724 9130410C08Rik-201ENSMUST00000155499 1088 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rbp4Q00724 Gm12840-201ENSMUST00000156081 627 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rbp4Q00724 Stk19-ps1-201ENSMUST00000174597 517 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Rbp4Q00724 Gm28911-201ENSMUST00000188837 117 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Rbp4Q00724 Gm28198-201ENSMUST00000190938 471 ntTSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rbp4Q00724 Pomc-202ENSMUST00000218089 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rbp4Q00724 Olfr222-201ENSMUST00000071943 1115 ntAPPRIS P1 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rbp4Q00724 Tex13c3-201ENSMUST00000089246 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rbp4Q00724 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rbp4Q00724 Tada3-203ENSMUST00000099118 1282 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rbp4Q00724 Ripk4-201ENSMUST00000019386 3541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rbp4Q00724 Hspa12b-201ENSMUST00000099349 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rbp4Q00724 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rbp4Q00724 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rbp4Q00724 Ywhag-205ENSMUST00000198270 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rbp4Q00724 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rbp4Q00724 Dnmt3a-201ENSMUST00000020991 9685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rbp4Q00724 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rbp4Q00724 Wasl-201ENSMUST00000031695 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rbp4Q00724 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rbp4Q00724 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rbp4Q00724 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rbp4Q00724 Zfp516-202ENSMUST00000171238 7725 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rbp4Q00724 Zfp516-201ENSMUST00000071233 7703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rbp4Q00724 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.59
Rbp4Q00724 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rbp4Q00724 Gm12020-201ENSMUST00000119030 2042 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Rbp4Q00724 Rfc2-201ENSMUST00000023867 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rbp4Q00724 Usp19-204ENSMUST00000178075 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rbp4Q00724 Usp19-202ENSMUST00000085044 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rbp4Q00724 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rbp4Q00724 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rbp4Q00724 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.9 ms