Protein–RNA interactions for Protein: P97769

Cited1, Cbp/p300-interacting transactivator 1, mousemouse

Predictions only

Length 203 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cited1P97769 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Cited1P97769 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Cited1P97769 Anks1b-224ENSMUST00000182960 3397 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Cited1P97769 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Cited1P97769 CT010480.4-201ENSMUST00000224654 2283 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Cited1P97769 Tmem92-201ENSMUST00000100554 2043 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Cited1P97769 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Cited1P97769 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Cited1P97769 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Cited1P97769 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Cited1P97769 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Cited1P97769 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Cited1P97769 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Cited1P97769 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Cited1P97769 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Cited1P97769 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Cited1P97769 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Cited1P97769 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Cited1P97769 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Cited1P97769 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Cited1P97769 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Cited1P97769 Nek7-201ENSMUST00000027642 3737 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Cited1P97769 Ddx11-201ENSMUST00000163605 4149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Cited1P97769 Rxra-206ENSMUST00000166775 3216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Cited1P97769 Itfg2-201ENSMUST00000001559 2320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Cited1P97769 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Cited1P97769 Zbtb21-202ENSMUST00000063605 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Cited1P97769 Wwox-201ENSMUST00000004756 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Cited1P97769 Vsx2-201ENSMUST00000021665 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Cited1P97769 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Cited1P97769 Prrt3-204ENSMUST00000205075 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Cited1P97769 9430038I01Rik-203ENSMUST00000120340 4643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Cited1P97769 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Cited1P97769 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Cited1P97769 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Cited1P97769 Prr12-201ENSMUST00000057293 7023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Cited1P97769 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Cited1P97769 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Cited1P97769 Zfp12-203ENSMUST00000077485 4294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Cited1P97769 Gm37849-201ENSMUST00000194722 1881 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Cited1P97769 Wipf1-203ENSMUST00000102680 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Cited1P97769 Rpl22-208ENSMUST00000188151 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Cited1P97769 Atad2-201ENSMUST00000038194 5684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Cited1P97769 Zufsp-201ENSMUST00000048222 2991 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Cited1P97769 Phf8-211ENSMUST00000168501 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Cited1P97769 Nek4-207ENSMUST00000228328 4245 ntAPPRIS P2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Cited1P97769 Zeb2-201ENSMUST00000028229 5335 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Cited1P97769 Dsc2-202ENSMUST00000075214 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Cited1P97769 Fgd5-202ENSMUST00000113466 5621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Cited1P97769 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Cited1P97769 Arl4a-205ENSMUST00000146905 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Cited1P97769 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Cited1P97769 Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 3301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Cited1P97769 Stom-201ENSMUST00000028241 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Cited1P97769 Piwil1-201ENSMUST00000086056 4016 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Cited1P97769 Ptprh-201ENSMUST00000049113 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Cited1P97769 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Cited1P97769 Tom1l2-204ENSMUST00000095254 4940 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Cited1P97769 Wdfy2-201ENSMUST00000014691 6646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Cited1P97769 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Cited1P97769 Gm28036-202ENSMUST00000132494 5505 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Cited1P97769 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Cited1P97769 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Cited1P97769 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Cited1P97769 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Cited1P97769 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Cited1P97769 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Cited1P97769 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Cited1P97769 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Cited1P97769 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Cited1P97769 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Cited1P97769 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Cited1P97769 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Cited1P97769 Igsf3-201ENSMUST00000043983 7371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Cited1P97769 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Cited1P97769 Ptprt-203ENSMUST00000109443 12112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Cited1P97769 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Cited1P97769 Aff3-203ENSMUST00000095027 5857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Cited1P97769 Pcdh12-203ENSMUST00000194012 2702 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Cited1P97769 Als2cl-203ENSMUST00000130386 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Cited1P97769 Rai1-207ENSMUST00000171108 7125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Cited1P97769 Samd11-201ENSMUST00000179919 2610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Cited1P97769 Mum1l1-204ENSMUST00000113045 4523 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Cited1P97769 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Cited1P97769 Prr5l-210ENSMUST00000171088 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Cited1P97769 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Cited1P97769 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Cited1P97769 Lrrc74b-203ENSMUST00000100123 2231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Cited1P97769 Aebp2-206ENSMUST00000161335 2524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Cited1P97769 Vasn-201ENSMUST00000038770 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Cited1P97769 Mrgprd-201ENSMUST00000062163 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Cited1P97769 Gnai3-201ENSMUST00000000001 3262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Cited1P97769 Reps2-201ENSMUST00000101102 7630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Cited1P97769 Gm16564-201ENSMUST00000162545 3010 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Cited1P97769 Clpx-201ENSMUST00000015501 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Cited1P97769 Sphk2-203ENSMUST00000210060 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Cited1P97769 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Cited1P97769 Trpv4-201ENSMUST00000071968 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Cited1P97769 Polm-201ENSMUST00000020767 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Cited1P97769 Gfra1-201ENSMUST00000026076 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms