Protein–RNA interactions for Protein: P97473

Tarbp2, RISC-loading complex subunit TARBP2, mousemouse

Predictions only

Length 365 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tarbp2P97473 Gm36198-201ENSMUST00000217490 416 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tarbp2P97473 AC173210.1-201ENSMUST00000222341 1131 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Tarbp2P97473 Ifitm10-202ENSMUST00000084412 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tarbp2P97473 Bmp3-202ENSMUST00000197143 2739 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tarbp2P97473 Stpg2-202ENSMUST00000106239 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tarbp2P97473 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tarbp2P97473 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tarbp2P97473 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tarbp2P97473 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tarbp2P97473 4930556M19Rik-201ENSMUST00000180604 2468 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tarbp2P97473 Hyal1-204ENSMUST00000144392 1332 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tarbp2P97473 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tarbp2P97473 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tarbp2P97473 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tarbp2P97473 Stau2-215ENSMUST00000162435 2735 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.07
Tarbp2P97473 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tarbp2P97473 Prkx-202ENSMUST00000114044 2639 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tarbp2P97473 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tarbp2P97473 B230217C12Rik-202ENSMUST00000155954 2181 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tarbp2P97473 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tarbp2P97473 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Tarbp2P97473 Mks1-201ENSMUST00000038196 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tarbp2P97473 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tarbp2P97473 3110009E18Rik-203ENSMUST00000112644 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tarbp2P97473 Gm5187-201ENSMUST00000117317 991 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Tarbp2P97473 Fuom-203ENSMUST00000121115 872 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tarbp2P97473 Rwdd3-209ENSMUST00000170781 1111 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tarbp2P97473 Gm42693-201ENSMUST00000196779 631 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Tarbp2P97473 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tarbp2P97473 Gm45233-201ENSMUST00000203633 898 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tarbp2P97473 Lsm7-208ENSMUST00000220225 1129 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tarbp2P97473 Syngr2-201ENSMUST00000026649 1520 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tarbp2P97473 Rcsd1-201ENSMUST00000040357 2622 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tarbp2P97473 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tarbp2P97473 Slc25a14-201ENSMUST00000033431 1760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tarbp2P97473 Gm4782-201ENSMUST00000168705 2046 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Tarbp2P97473 Pced1b-201ENSMUST00000059433 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tarbp2P97473 Rad54b-202ENSMUST00000095145 2403 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tarbp2P97473 Sufu-203ENSMUST00000118440 2663 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tarbp2P97473 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tarbp2P97473 Hoxd10-201ENSMUST00000061745 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tarbp2P97473 Rps13-203ENSMUST00000205490 1317 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tarbp2P97473 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tarbp2P97473 Pomgnt1-201ENSMUST00000106494 2226 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tarbp2P97473 Zap70-201ENSMUST00000027291 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tarbp2P97473 Matr3-206ENSMUST00000187389 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tarbp2P97473 Fsd1-201ENSMUST00000011733 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tarbp2P97473 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tarbp2P97473 Tbx4-201ENSMUST00000000096 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tarbp2P97473 Hnrnpf-203ENSMUST00000167182 2271 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tarbp2P97473 Kif3a-208ENSMUST00000173744 2257 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tarbp2P97473 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tarbp2P97473 Gm13848-201ENSMUST00000130777 2047 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tarbp2P97473 Wfdc1-201ENSMUST00000024107 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tarbp2P97473 Agpat4-201ENSMUST00000024594 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tarbp2P97473 Zfp157-202ENSMUST00000100524 869 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tarbp2P97473 Mad2l2-203ENSMUST00000105707 949 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tarbp2P97473 Rpl38-204ENSMUST00000106602 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tarbp2P97473 Snap25-202ENSMUST00000110098 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tarbp2P97473 Glrx2-202ENSMUST00000111957 580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tarbp2P97473 1700049J03Rik-201ENSMUST00000011196 421 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tarbp2P97473 Mrpl2-203ENSMUST00000113430 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tarbp2P97473 Pelp1-202ENSMUST00000135148 562 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tarbp2P97473 Myl3-203ENSMUST00000136695 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tarbp2P97473 Tmem52-204ENSMUST00000178188 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tarbp2P97473 Tmem52-205ENSMUST00000178238 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tarbp2P97473 Prr29-204ENSMUST00000188561 592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tarbp2P97473 Prr29-206ENSMUST00000190795 822 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tarbp2P97473 Ssr2-202ENSMUST00000192495 620 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tarbp2P97473 Gm37497-201ENSMUST00000195830 798 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Tarbp2P97473 Gm43597-201ENSMUST00000201650 1057 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tarbp2P97473 Apoa5-203ENSMUST00000213878 727 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tarbp2P97473 Kitl-204ENSMUST00000218200 564 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tarbp2P97473 AC134335.2-201ENSMUST00000227660 440 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Tarbp2P97473 Ier3-201ENSMUST00000003635 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tarbp2P97473 Rpl10-202ENSMUST00000074085 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tarbp2P97473 Gm10478-201ENSMUST00000084451 396 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Tarbp2P97473 Tldc2-201ENSMUST00000099140 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tarbp2P97473 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tarbp2P97473 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tarbp2P97473 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tarbp2P97473 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tarbp2P97473 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tarbp2P97473 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tarbp2P97473 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tarbp2P97473 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tarbp2P97473 Ttc8-202ENSMUST00000085109 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tarbp2P97473 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tarbp2P97473 Gm4297-201ENSMUST00000119285 2579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tarbp2P97473 Ninj1-202ENSMUST00000120733 1321 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tarbp2P97473 Unc45bos-201ENSMUST00000156395 1306 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tarbp2P97473 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tarbp2P97473 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tarbp2P97473 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tarbp2P97473 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tarbp2P97473 Gm30238-201ENSMUST00000195528 2603 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Tarbp2P97473 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tarbp2P97473 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tarbp2P97473 Esrrb-202ENSMUST00000110203 2363 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tarbp2P97473 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.8 ms