Protein–RNA interactions for Protein: P80205

Otx1, Homeobox protein OTX1, mousemouse

Predictions only

Length 355 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otx1P80205 Prcd-202ENSMUST00000116318 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Otx1P80205 Gm12485-201ENSMUST00000119641 291 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Otx1P80205 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Otx1P80205 Unkl-205ENSMUST00000161679 1053 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Otx1P80205 Gm5819-201ENSMUST00000171469 465 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Otx1P80205 Gm20412-201ENSMUST00000173249 633 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Otx1P80205 Smyd3-207ENSMUST00000194237 1047 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Otx1P80205 1810059H22Rik-208ENSMUST00000204941 642 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Otx1P80205 Gm7653-201ENSMUST00000214567 508 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Otx1P80205 Med10-204ENSMUST00000221893 815 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Otx1P80205 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Otx1P80205 Cript-201ENSMUST00000024959 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Otx1P80205 Fam173b-201ENSMUST00000042702 1164 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Otx1P80205 Hfe-201ENSMUST00000006787 516 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Otx1P80205 Hfe-203ENSMUST00000091707 816 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Otx1P80205 6430531B16Rik-201ENSMUST00000097970 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Otx1P80205 R3hdm2-212ENSMUST00000166820 4281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Otx1P80205 Adsl-206ENSMUST00000168756 1439 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Otx1P80205 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Otx1P80205 Gngt2-201ENSMUST00000036088 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Otx1P80205 Tfap2c-202ENSMUST00000099058 2985 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Otx1P80205 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Otx1P80205 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Otx1P80205 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Otx1P80205 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Otx1P80205 Gm43650-201ENSMUST00000197337 1382 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Otx1P80205 Gm30214-201ENSMUST00000199271 1383 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Otx1P80205 Pdcd6-203ENSMUST00000222759 1376 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Otx1P80205 BC051537-201ENSMUST00000183290 1668 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Otx1P80205 Gm15684-201ENSMUST00000160605 1814 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Otx1P80205 Xrcc3-201ENSMUST00000021715 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Otx1P80205 Pgghg-204ENSMUST00000164580 3001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Otx1P80205 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Otx1P80205 Kcnd3-203ENSMUST00000118360 2668 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Otx1P80205 Amz1-201ENSMUST00000060918 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Otx1P80205 H3f3b-202ENSMUST00000106454 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Otx1P80205 Ap1s2-201ENSMUST00000033734 1785 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Otx1P80205 Bcat1-202ENSMUST00000048252 1642 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Otx1P80205 Hells-201ENSMUST00000025965 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Otx1P80205 Slc45a1-201ENSMUST00000037827 3387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Otx1P80205 Aff2-201ENSMUST00000033532 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Otx1P80205 Pank1-201ENSMUST00000036584 3460 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Otx1P80205 Kcp-201ENSMUST00000078112 4775 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Otx1P80205 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Otx1P80205 Rbms1-201ENSMUST00000028347 4436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Otx1P80205 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Otx1P80205 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Otx1P80205 Cd63-202ENSMUST00000105229 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Otx1P80205 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Otx1P80205 1700001C02Rik-203ENSMUST00000127815 660 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Otx1P80205 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Otx1P80205 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Otx1P80205 Gm42612-201ENSMUST00000197986 623 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Otx1P80205 Gm43170-201ENSMUST00000199827 612 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Otx1P80205 AC155258.1-201ENSMUST00000219303 253 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Otx1P80205 Cd63-204ENSMUST00000219317 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Otx1P80205 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Otx1P80205 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Otx1P80205 Ube2i-201ENSMUST00000049911 1138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Otx1P80205 Btrc-201ENSMUST00000065601 2978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Otx1P80205 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Otx1P80205 Tbc1d1-201ENSMUST00000043893 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Otx1P80205 Rit2-202ENSMUST00000139924 1674 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Otx1P80205 Ero1lb-202ENSMUST00000220811 3341 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Otx1P80205 Mrps30-201ENSMUST00000022245 3319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Otx1P80205 Sptb-201ENSMUST00000021458 10394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Otx1P80205 Gm38577-201ENSMUST00000221531 4545 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Otx1P80205 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Otx1P80205 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Otx1P80205 Hnrnph1-203ENSMUST00000109142 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Otx1P80205 Sox17-206ENSMUST00000192650 3242 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Otx1P80205 4732471J01Rik-203ENSMUST00000206300 1887 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Otx1P80205 Rabep2-201ENSMUST00000106405 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Otx1P80205 Hdac11-201ENSMUST00000041736 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Otx1P80205 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Otx1P80205 B430305J03Rik-201ENSMUST00000066298 3702 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Otx1P80205 Cog7-201ENSMUST00000057576 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Otx1P80205 Rhog-202ENSMUST00000106923 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Otx1P80205 Coq4-201ENSMUST00000028137 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Otx1P80205 Znrf1-203ENSMUST00000168428 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Otx1P80205 Rnpc3-202ENSMUST00000106535 2616 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Otx1P80205 Spef1-202ENSMUST00000110218 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Otx1P80205 Lmod3-201ENSMUST00000095655 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Otx1P80205 Slc37a1-201ENSMUST00000165149 3354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Otx1P80205 Tmem251-201ENSMUST00000057416 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Otx1P80205 Tcirg1-211ENSMUST00000145791 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Otx1P80205 Mos-201ENSMUST00000105158 1449 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Otx1P80205 G6pc3-201ENSMUST00000070334 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Otx1P80205 Psmd2-201ENSMUST00000007212 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Otx1P80205 Otud4-203ENSMUST00000173286 7213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Otx1P80205 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Otx1P80205 Camta2-203ENSMUST00000108544 4632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Otx1P80205 Bag6-203ENSMUST00000172571 3599 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Otx1P80205 Samd11-202ENSMUST00000217934 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Otx1P80205 Bcl2l1-201ENSMUST00000007803 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Otx1P80205 Ighv5-17-201ENSMUST00000103459 405 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Otx1P80205 Tagln2-201ENSMUST00000111228 716 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Otx1P80205 Gm12537-201ENSMUST00000119266 1002 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Otx1P80205 Gm12070-201ENSMUST00000119551 1002 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Otx1P80205 Gm12671-201ENSMUST00000119978 1002 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.7 ms