Protein–RNA interactions for Protein: P79621

Ciita, MHC class II transactivator, mousemouse

Predictions only

Length 1,155 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CiitaP79621 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CiitaP79621 Sqle-201ENSMUST00000022977 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CiitaP79621 Mpi-201ENSMUST00000034856 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CiitaP79621 Rasgrp2-207ENSMUST00000113475 573 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CiitaP79621 Rhox2f-201ENSMUST00000115173 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CiitaP79621 Gm16229-201ENSMUST00000133270 1232 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CiitaP79621 Pisd-ps2-202ENSMUST00000142526 1175 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
CiitaP79621 6030498E09Rik-202ENSMUST00000168144 510 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CiitaP79621 Gm3764-203ENSMUST00000180635 1191 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CiitaP79621 A330069E16Rik-201ENSMUST00000181191 887 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CiitaP79621 Gm27331-201ENSMUST00000183705 60 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
CiitaP79621 AY702102-202ENSMUST00000194651 1173 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
CiitaP79621 Tgif2-ps1-201ENSMUST00000203590 713 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
CiitaP79621 Chd3os-203ENSMUST00000218008 1026 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CiitaP79621 Rpsa-ps10-201ENSMUST00000057740 885 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
CiitaP79621 Rnps1-202ENSMUST00000115371 1617 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CiitaP79621 Abhd6-203ENSMUST00000225234 1958 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
CiitaP79621 Adamts3-204ENSMUST00000198151 1833 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CiitaP79621 Lrrc17-201ENSMUST00000035651 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CiitaP79621 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CiitaP79621 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CiitaP79621 Hnrnpc-211ENSMUST00000228748 1691 ntAPPRIS P5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CiitaP79621 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CiitaP79621 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CiitaP79621 Saraf-201ENSMUST00000033933 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CiitaP79621 Eif4g3-215ENSMUST00000203828 5289 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CiitaP79621 Gm15544-201ENSMUST00000118776 1531 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
CiitaP79621 Plaur-201ENSMUST00000002284 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CiitaP79621 Gm10729-202ENSMUST00000193403 1375 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
CiitaP79621 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CiitaP79621 Gm18630-201ENSMUST00000222109 1397 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
CiitaP79621 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CiitaP79621 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CiitaP79621 1500009C09Rik-202ENSMUST00000143238 1552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CiitaP79621 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CiitaP79621 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CiitaP79621 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CiitaP79621 Mos-201ENSMUST00000105158 1449 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CiitaP79621 Ephx2-201ENSMUST00000070515 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CiitaP79621 Gm14350-201ENSMUST00000116642 640 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
CiitaP79621 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CiitaP79621 Gm14660-201ENSMUST00000119809 575 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
CiitaP79621 Atpif1-203ENSMUST00000152993 462 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CiitaP79621 Krtap16-3-201ENSMUST00000179707 601 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CiitaP79621 Dnd1-ps-201ENSMUST00000196992 964 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
CiitaP79621 AC173210.1-201ENSMUST00000222341 1131 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
CiitaP79621 AC122459.1-201ENSMUST00000228373 885 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
CiitaP79621 Rnase2b-201ENSMUST00000075648 759 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CiitaP79621 Gm10244-201ENSMUST00000090237 830 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CiitaP79621 Tpd52-204ENSMUST00000094381 1074 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CiitaP79621 Dnmt3l-208ENSMUST00000151242 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CiitaP79621 Tcf3-205ENSMUST00000105341 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CiitaP79621 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CiitaP79621 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CiitaP79621 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CiitaP79621 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CiitaP79621 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CiitaP79621 Nt5c3b-203ENSMUST00000107397 1348 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CiitaP79621 P4ha1-202ENSMUST00000092512 2387 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CiitaP79621 Gm8994-202ENSMUST00000204530 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CiitaP79621 Lnx1-205ENSMUST00000117525 2259 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CiitaP79621 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CiitaP79621 Lrrc29-201ENSMUST00000070508 1922 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CiitaP79621 4933409G03Rik-201ENSMUST00000102713 1263 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CiitaP79621 Spatc1l-202ENSMUST00000105414 1060 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CiitaP79621 Timm10b-202ENSMUST00000106780 671 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CiitaP79621 Selenoh-203ENSMUST00000117299 747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CiitaP79621 Gm6447-201ENSMUST00000118905 835 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
CiitaP79621 Gm16177-201ENSMUST00000120728 718 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
CiitaP79621 Smim17-203ENSMUST00000161855 664 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CiitaP79621 Gm45784-201ENSMUST00000188360 142 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
CiitaP79621 Gm44064-201ENSMUST00000204964 1087 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
CiitaP79621 Gm36264-202ENSMUST00000221989 1142 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CiitaP79621 Tmem107-201ENSMUST00000075980 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CiitaP79621 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CiitaP79621 Jazf1-201ENSMUST00000074541 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CiitaP79621 Gm26878-201ENSMUST00000181778 1644 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CiitaP79621 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CiitaP79621 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CiitaP79621 Pfkfb3-212ENSMUST00000170196 2163 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
CiitaP79621 Serpine3-201ENSMUST00000171692 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
CiitaP79621 Ldhal6b-201ENSMUST00000189788 1445 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.07
CiitaP79621 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
CiitaP79621 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
CiitaP79621 Lypla1-201ENSMUST00000027036 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
CiitaP79621 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
CiitaP79621 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
CiitaP79621 Ttll3-206ENSMUST00000204026 1472 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CiitaP79621 AC131068.2-201ENSMUST00000226175 1453 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
CiitaP79621 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CiitaP79621 Gm19461-205ENSMUST00000191207 2566 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CiitaP79621 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CiitaP79621 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CiitaP79621 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CiitaP79621 Fbxo28-201ENSMUST00000051431 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CiitaP79621 Gm12203-201ENSMUST00000118235 598 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
CiitaP79621 Gm12209-201ENSMUST00000120089 596 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
CiitaP79621 Gm15966-201ENSMUST00000136853 480 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CiitaP79621 Shisa5-203ENSMUST00000154184 1038 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CiitaP79621 Tldc2-202ENSMUST00000166140 639 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
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