Protein–RNA interactions for Protein: P70268

Pkn1, Serine/threonine-protein kinase N1, mousemouse

Predictions only

Length 946 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkn1P70268 Mir497b-201ENSMUST00000093601 125 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Pkn1P70268 AC153366.2-201ENSMUST00000219461 1984 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Pkn1P70268 Gan-201ENSMUST00000064488 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pkn1P70268 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pkn1P70268 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pkn1P70268 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pkn1P70268 Trim80-201ENSMUST00000093914 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pkn1P70268 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pkn1P70268 Mta2-201ENSMUST00000096240 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pkn1P70268 Ywhag-205ENSMUST00000198270 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pkn1P70268 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pkn1P70268 Tsku-206ENSMUST00000179780 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pkn1P70268 Llgl2-212ENSMUST00000177736 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pkn1P70268 Yif1a-201ENSMUST00000025811 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pkn1P70268 9930014A18Rik-201ENSMUST00000180730 3074 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pkn1P70268 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Pkn1P70268 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pkn1P70268 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pkn1P70268 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pkn1P70268 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pkn1P70268 Gpsm2-201ENSMUST00000029482 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pkn1P70268 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pkn1P70268 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pkn1P70268 Kmt5c-203ENSMUST00000108583 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pkn1P70268 St6galnac6-209ENSMUST00000131229 1013 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Pkn1P70268 Cmc4-203ENSMUST00000149863 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Pkn1P70268 Rdh5-201ENSMUST00000026406 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pkn1P70268 Ifitm10-202ENSMUST00000084412 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pkn1P70268 Ldha-214ENSMUST00000210815 1535 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pkn1P70268 Unc119b-201ENSMUST00000060798 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pkn1P70268 Spata21-201ENSMUST00000051907 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pkn1P70268 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pkn1P70268 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pkn1P70268 Fam71f1-204ENSMUST00000166462 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pkn1P70268 Kifc3-202ENSMUST00000169353 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Pkn1P70268 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pkn1P70268 Cmpk2-201ENSMUST00000020969 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pkn1P70268 Cbarp-214ENSMUST00000169546 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pkn1P70268 Krt26-201ENSMUST00000100482 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pkn1P70268 Bhmt-201ENSMUST00000099309 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pkn1P70268 Car6-202ENSMUST00000105683 1460 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pkn1P70268 Prrt3-202ENSMUST00000204134 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pkn1P70268 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pkn1P70268 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pkn1P70268 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pkn1P70268 Arhgap26-201ENSMUST00000097593 7898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pkn1P70268 Apol7a-201ENSMUST00000010745 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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Pkn1P70268 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pkn1P70268 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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Pkn1P70268 Sit1-201ENSMUST00000030180 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pkn1P70268 Ppp1r14d-201ENSMUST00000076084 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pkn1P70268 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pkn1P70268 Oxa1l-201ENSMUST00000000985 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pkn1P70268 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pkn1P70268 B3galnt2-201ENSMUST00000099747 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pkn1P70268 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pkn1P70268 Keap1-202ENSMUST00000164812 3614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pkn1P70268 Cadps2-209ENSMUST00000142913 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pkn1P70268 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pkn1P70268 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pkn1P70268 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pkn1P70268 Pank1-201ENSMUST00000036584 3460 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pkn1P70268 Pdlim7-201ENSMUST00000046246 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pkn1P70268 Dusp6-201ENSMUST00000020118 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pkn1P70268 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Pkn1P70268 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Pkn1P70268 Klf12-201ENSMUST00000097079 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Pkn1P70268 Dpp6-201ENSMUST00000071500 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Pkn1P70268 5330406M23Rik-201ENSMUST00000195672 2094 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Pkn1P70268 Mfsd4a-205ENSMUST00000144548 3288 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Pkn1P70268 Men1-202ENSMUST00000078137 2738 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Pkn1P70268 Maged2-203ENSMUST00000112699 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Pkn1P70268 Zyg11a-203ENSMUST00000223127 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Pkn1P70268 Nol10-201ENSMUST00000046011 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Pkn1P70268 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Pkn1P70268 Rbpjl-201ENSMUST00000017151 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Pkn1P70268 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Pkn1P70268 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Pkn1P70268 Umad1-208ENSMUST00000162034 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.2 ms