Protein–RNA interactions for Protein: P59242

Cgn, Cingulin, mousemouse

Predictions only

Length 1,191 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CgnP59242 Gm34376-201ENSMUST00000218529 2107 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CgnP59242 AC154595.3-201ENSMUST00000224579 384 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
CgnP59242 Intu-202ENSMUST00000091186 6387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CgnP59242 Ralgds-202ENSMUST00000100241 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CgnP59242 Zfp977-201ENSMUST00000173283 1425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CgnP59242 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CgnP59242 Malt1-202ENSMUST00000224056 4028 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CgnP59242 Slc11a2-201ENSMUST00000023774 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CgnP59242 Pnkp-201ENSMUST00000003044 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CgnP59242 Hist1h2be-202ENSMUST00000091704 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CgnP59242 B3gnt3-201ENSMUST00000034260 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CgnP59242 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CgnP59242 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CgnP59242 Setd1a-202ENSMUST00000047157 5927 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CgnP59242 Plch2-206ENSMUST00000135665 4349 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CgnP59242 Evc2-201ENSMUST00000056365 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
CgnP59242 Arhgap27os3-201ENSMUST00000124462 2729 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CgnP59242 Zfp575-201ENSMUST00000094705 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CgnP59242 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
CgnP59242 Cacna1c-225ENSMUST00000219223 7483 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CgnP59242 Aco1-201ENSMUST00000102973 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CgnP59242 Lgals8-202ENSMUST00000099821 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CgnP59242 Slc25a25-204ENSMUST00000113308 2643 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CgnP59242 Alx1-201ENSMUST00000040859 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CgnP59242 Rtraf-201ENSMUST00000022341 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CgnP59242 AC154747.3-201ENSMUST00000224471 3470 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
CgnP59242 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
CgnP59242 Tmem129-204ENSMUST00000200849 657 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CgnP59242 Gm4971-201ENSMUST00000205991 1108 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
CgnP59242 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CgnP59242 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CgnP59242 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CgnP59242 H2-Q6-202ENSMUST00000174699 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CgnP59242 Trim26-210ENSMUST00000179968 3203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CgnP59242 Ace-202ENSMUST00000001964 2418 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CgnP59242 9930014A18Rik-201ENSMUST00000180730 3074 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CgnP59242 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CgnP59242 Cops7b-202ENSMUST00000121534 5383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CgnP59242 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CgnP59242 Gm20488-201ENSMUST00000201641 2996 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CgnP59242 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CgnP59242 Usp19-203ENSMUST00000166103 4473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CgnP59242 Gm9924-202ENSMUST00000192760 2311 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
CgnP59242 Pnoc-201ENSMUST00000059339 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CgnP59242 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CgnP59242 Dcaf11-204ENSMUST00000121622 2379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CgnP59242 Irak3-201ENSMUST00000020448 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CgnP59242 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CgnP59242 Map6-205ENSMUST00000207883 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CgnP59242 Arhgef2-219ENSMUST00000176500 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CgnP59242 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CgnP59242 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CgnP59242 A530083I20Rik-201ENSMUST00000180486 2421 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CgnP59242 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CgnP59242 Cbarp-214ENSMUST00000169546 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CgnP59242 Ralgps2-214ENSMUST00000191605 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CgnP59242 Brwd1-201ENSMUST00000023631 8209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CgnP59242 Agpat4-201ENSMUST00000024594 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CgnP59242 Zfp777-201ENSMUST00000095944 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CgnP59242 Ky-201ENSMUST00000039390 5837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CgnP59242 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CgnP59242 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CgnP59242 Gse1-201ENSMUST00000034279 7127 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CgnP59242 Llgl2-201ENSMUST00000103032 3551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CgnP59242 Srl-201ENSMUST00000023161 5000 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CgnP59242 Arhgap11a-203ENSMUST00000110948 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CgnP59242 Kars-203ENSMUST00000164470 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CgnP59242 Gabpb1-202ENSMUST00000089745 3254 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CgnP59242 Gm12585-201ENSMUST00000117307 290 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
CgnP59242 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CgnP59242 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CgnP59242 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CgnP59242 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CgnP59242 Gm5425-201ENSMUST00000214125 459 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
CgnP59242 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CgnP59242 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CgnP59242 Olfr554-201ENSMUST00000098221 954 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CgnP59242 Ptch2-201ENSMUST00000030443 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CgnP59242 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CgnP59242 Sfpq-201ENSMUST00000030623 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CgnP59242 Gm35721-201ENSMUST00000220294 2014 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CgnP59242 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CgnP59242 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CgnP59242 2310007B03Rik-202ENSMUST00000143419 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CgnP59242 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CgnP59242 Tmprss11d-202ENSMUST00000122377 2256 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CgnP59242 Ctbs-202ENSMUST00000061937 2892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CgnP59242 Mff-201ENSMUST00000073025 1706 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CgnP59242 Lzts1-204ENSMUST00000185176 5019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CgnP59242 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CgnP59242 Ubap2l-204ENSMUST00000195995 3516 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CgnP59242 I730028E13Rik-201ENSMUST00000216012 1959 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CgnP59242 Tbc1d22a-201ENSMUST00000063414 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CgnP59242 Dnaaf1-201ENSMUST00000093100 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CgnP59242 Col25a1-201ENSMUST00000080335 2624 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CgnP59242 Ugt1a5-201ENSMUST00000097659 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CgnP59242 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CgnP59242 Eif5-202ENSMUST00000166123 4050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CgnP59242 Cbl-206ENSMUST00000206147 3452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CgnP59242 Ints13-201ENSMUST00000032427 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.1 ms