Protein–RNA interactions for Protein: P57784

Snrpa1, U2 small nuclear ribonucleoprotein A', mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 255 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snrpa1P57784 Olfr569-201ENSMUST00000078191 945 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Snrpa1P57784 Olfr582-201ENSMUST00000098212 960 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Snrpa1P57784 Trp53-203ENSMUST00000108658 1771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Snrpa1P57784 Bscl2-206ENSMUST00000160556 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Snrpa1P57784 Trp53-201ENSMUST00000005371 1772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Snrpa1P57784 Acsl6-201ENSMUST00000000145 2297 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Snrpa1P57784 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Snrpa1P57784 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Snrpa1P57784 Mos-201ENSMUST00000105158 1449 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Snrpa1P57784 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Snrpa1P57784 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Snrpa1P57784 Smpd2-201ENSMUST00000019965 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Snrpa1P57784 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Snrpa1P57784 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Snrpa1P57784 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Snrpa1P57784 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Snrpa1P57784 Duxf3-202ENSMUST00000176875 2025 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Snrpa1P57784 Duoxa2-201ENSMUST00000028656 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Snrpa1P57784 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Snrpa1P57784 Men1-208ENSMUST00000113504 2663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Snrpa1P57784 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Snrpa1P57784 4931406C07Rik-208ENSMUST00000216955 1750 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Snrpa1P57784 Lrrc8a-202ENSMUST00000113654 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Snrpa1P57784 Gad1-205ENSMUST00000130998 1705 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Snrpa1P57784 Nr4a2-203ENSMUST00000112629 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Snrpa1P57784 Gal3st4-203ENSMUST00000161647 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Snrpa1P57784 Lrrc29-201ENSMUST00000070508 1922 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Snrpa1P57784 Lrguk-202ENSMUST00000101564 967 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Snrpa1P57784 Pkig-203ENSMUST00000109400 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Snrpa1P57784 Gm25261-201ENSMUST00000157416 134 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Snrpa1P57784 Psme1-202ENSMUST00000172738 681 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Snrpa1P57784 Ggt5-203ENSMUST00000189972 648 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Snrpa1P57784 Gm44985-201ENSMUST00000206202 1016 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Snrpa1P57784 Pfdn1-201ENSMUST00000025204 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Snrpa1P57784 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Snrpa1P57784 Chchd10-203ENSMUST00000219839 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Snrpa1P57784 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Snrpa1P57784 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Snrpa1P57784 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Snrpa1P57784 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Snrpa1P57784 Dcaf4-208ENSMUST00000223291 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Snrpa1P57784 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Snrpa1P57784 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Snrpa1P57784 Ddo-203ENSMUST00000213503 1759 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Snrpa1P57784 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Snrpa1P57784 1810058I24Rik-203ENSMUST00000152147 2521 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Snrpa1P57784 9130011E15Rik-201ENSMUST00000045396 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Snrpa1P57784 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Snrpa1P57784 Keap1-202ENSMUST00000164812 3614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Snrpa1P57784 Dnajb4-204ENSMUST00000144950 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Snrpa1P57784 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Snrpa1P57784 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Snrpa1P57784 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Snrpa1P57784 Mutyh-201ENSMUST00000102699 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Snrpa1P57784 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Snrpa1P57784 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Snrpa1P57784 Cox4i2-201ENSMUST00000010020 727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Snrpa1P57784 Gm12050-201ENSMUST00000127483 615 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Snrpa1P57784 Gm12347-201ENSMUST00000127883 470 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Snrpa1P57784 BC046401-201ENSMUST00000155786 847 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Snrpa1P57784 4930594M17Rik-201ENSMUST00000181204 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Snrpa1P57784 1700120C14Rik-202ENSMUST00000187967 391 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Snrpa1P57784 Hbb-bs-201ENSMUST00000023934 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Snrpa1P57784 Rpl36-201ENSMUST00000080492 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Snrpa1P57784 Hpcal4-202ENSMUST00000106246 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Snrpa1P57784 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Snrpa1P57784 Scin-202ENSMUST00000078481 2654 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Snrpa1P57784 Krt17-201ENSMUST00000080893 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Snrpa1P57784 Nrd1-202ENSMUST00000102736 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Snrpa1P57784 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Snrpa1P57784 Cidec-201ENSMUST00000032416 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Snrpa1P57784 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Snrpa1P57784 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Snrpa1P57784 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Snrpa1P57784 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Snrpa1P57784 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Snrpa1P57784 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Snrpa1P57784 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Snrpa1P57784 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Snrpa1P57784 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Snrpa1P57784 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Snrpa1P57784 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Snrpa1P57784 Polr3c-202ENSMUST00000125183 923 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Snrpa1P57784 Ube2m-208ENSMUST00000165394 1228 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Snrpa1P57784 Fkbp2-202ENSMUST00000177752 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Snrpa1P57784 Pced1c-ps-201ENSMUST00000187740 751 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Snrpa1P57784 Il15-202ENSMUST00000209363 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Snrpa1P57784 AC154276.1-201ENSMUST00000228874 1299 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Snrpa1P57784 Fam71f1-203ENSMUST00000164560 1411 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Snrpa1P57784 Fscn2-201ENSMUST00000026445 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Snrpa1P57784 Tada3-202ENSMUST00000043333 1708 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Snrpa1P57784 9030612E09Rik-201ENSMUST00000053792 1859 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Snrpa1P57784 Rwdd4a-201ENSMUST00000033973 2921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Snrpa1P57784 Cngb1-201ENSMUST00000093268 1512 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Snrpa1P57784 Dnmt3l-208ENSMUST00000151242 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Snrpa1P57784 Hoxd10-201ENSMUST00000061745 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Snrpa1P57784 Slc31a2-201ENSMUST00000084530 1820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Snrpa1P57784 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Snrpa1P57784 Art3-206ENSMUST00000120416 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Snrpa1P57784 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.9 ms