Protein–RNA interactions for Protein: P51908

Apobec1, C->U-editing enzyme APOBEC-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 229 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apobec1P51908 Gm36264-202ENSMUST00000221989 1142 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Apobec1P51908 AC155237.1-201ENSMUST00000226196 1279 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Apobec1P51908 Alkbh7-202ENSMUST00000074141 736 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Apobec1P51908 S100pbp-205ENSMUST00000117350 2241 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Apobec1P51908 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Apobec1P51908 Psmd1-201ENSMUST00000027432 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Apobec1P51908 Fam57b-202ENSMUST00000098032 1894 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Apobec1P51908 Pla2g4c-204ENSMUST00000167232 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Apobec1P51908 Nup98-206ENSMUST00000211235 3748 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Apobec1P51908 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Apobec1P51908 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Apobec1P51908 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Apobec1P51908 AI839979-202ENSMUST00000201790 1539 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Apobec1P51908 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Apobec1P51908 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Apobec1P51908 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Apobec1P51908 Lypd6-201ENSMUST00000053208 3620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Apobec1P51908 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Apobec1P51908 Adgrv1-205ENSMUST00000126444 3823 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Apobec1P51908 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Apobec1P51908 Mslnl-201ENSMUST00000047098 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Apobec1P51908 Gpc2-201ENSMUST00000014089 2514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Apobec1P51908 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Apobec1P51908 Wfdc1-201ENSMUST00000024107 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Apobec1P51908 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Apobec1P51908 Bcat1-202ENSMUST00000048252 1642 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Apobec1P51908 Gm14149-201ENSMUST00000123048 1853 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Apobec1P51908 Ociad1-202ENSMUST00000071081 1311 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Apobec1P51908 G3bp2-203ENSMUST00000167918 4232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Apobec1P51908 Sema3f-204ENSMUST00000192727 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Apobec1P51908 Pef1-201ENSMUST00000030563 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Apobec1P51908 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Apobec1P51908 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Apobec1P51908 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Apobec1P51908 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Apobec1P51908 Polr3g-201ENSMUST00000048993 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Apobec1P51908 Gm10327-201ENSMUST00000105222 1002 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Apobec1P51908 Birc7-201ENSMUST00000108875 1178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Apobec1P51908 Ice2-203ENSMUST00000117610 800 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Apobec1P51908 Oprm1-229ENSMUST00000152674 1179 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Apobec1P51908 1700037F24Rik-201ENSMUST00000181254 973 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Apobec1P51908 Otx2os1-202ENSMUST00000183803 743 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Apobec1P51908 Prr29-204ENSMUST00000188561 592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Apobec1P51908 Prr29-206ENSMUST00000190795 822 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Apobec1P51908 Sct-204ENSMUST00000211667 506 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Apobec1P51908 Polr2h-201ENSMUST00000021405 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Apobec1P51908 Gstt2-203ENSMUST00000218500 794 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Apobec1P51908 AC134335.2-201ENSMUST00000227660 440 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Apobec1P51908 Calr3-201ENSMUST00000019876 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Apobec1P51908 Cops4-201ENSMUST00000045993 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Apobec1P51908 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Apobec1P51908 Erlin1-206ENSMUST00000170801 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Apobec1P51908 Cnppd1-201ENSMUST00000041213 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Apobec1P51908 6030458C11Rik-202ENSMUST00000227299 3206 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Apobec1P51908 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Apobec1P51908 Aoc2-202ENSMUST00000107264 2230 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Apobec1P51908 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Apobec1P51908 5830418P13Rik-201ENSMUST00000143564 2178 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Apobec1P51908 Fsd1-201ENSMUST00000011733 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Apobec1P51908 Nxf1-202ENSMUST00000010248 748 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Apobec1P51908 Rpl38-204ENSMUST00000106602 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Apobec1P51908 Pnpo-202ENSMUST00000107629 681 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Apobec1P51908 Gm13829-201ENSMUST00000119600 138 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Apobec1P51908 Hypk-204ENSMUST00000126764 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Apobec1P51908 Ndufaf2-201ENSMUST00000163558 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Apobec1P51908 C330013E15Rik-201ENSMUST00000181034 878 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Apobec1P51908 Gm27847-201ENSMUST00000183711 107 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Apobec1P51908 Gm27375-201ENSMUST00000183799 107 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Apobec1P51908 C030018K13Rik-202ENSMUST00000196829 712 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Apobec1P51908 Gm43763-201ENSMUST00000201761 683 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Apobec1P51908 Gm867-202ENSMUST00000219979 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Apobec1P51908 Apol6-206ENSMUST00000149569 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Apobec1P51908 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Apobec1P51908 Zscan30-202ENSMUST00000224144 1458 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Apobec1P51908 Gata2-202ENSMUST00000170089 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Apobec1P51908 Kcnk13-204ENSMUST00000177549 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Apobec1P51908 Trim26-202ENSMUST00000123715 1406 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Apobec1P51908 Gm26878-201ENSMUST00000181778 1644 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Apobec1P51908 Blzf1-203ENSMUST00000120447 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Apobec1P51908 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Apobec1P51908 Sun1-202ENSMUST00000078690 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Apobec1P51908 Lrfn2-201ENSMUST00000046254 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Apobec1P51908 Gm26525-201ENSMUST00000180666 3616 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Apobec1P51908 Gm26867-201ENSMUST00000180963 3615 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Apobec1P51908 Ap1s2-201ENSMUST00000033734 1785 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Apobec1P51908 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Apobec1P51908 Igha-202ENSMUST00000194738 2540 ntAPPRIS P5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Apobec1P51908 Ddx24-202ENSMUST00000110001 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Apobec1P51908 Emd-202ENSMUST00000088313 1338 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Apobec1P51908 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Apobec1P51908 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Apobec1P51908 Serpinb6d-201ENSMUST00000059637 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Apobec1P51908 Clec16a-205ENSMUST00000115827 2949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Apobec1P51908 Mad2l1bp-201ENSMUST00000171172 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Apobec1P51908 Gnb4-208ENSMUST00000193050 423 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Apobec1P51908 Gm34549-203ENSMUST00000208300 896 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Apobec1P51908 Gm45505-201ENSMUST00000210252 948 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Apobec1P51908 CT573086.1-201ENSMUST00000227202 1074 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Apobec1P51908 Dmac1-201ENSMUST00000030103 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Apobec1P51908 Sh3bgrl3-201ENSMUST00000030651 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
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