Protein–RNA interactions for Protein: P50136

Bckdha, 2-oxoisovalerate dehydrogenase subunit alpha, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 442 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BckdhaP50136 Edem3-203ENSMUST00000188145 3262 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
BckdhaP50136 Poli-205ENSMUST00000161542 2736 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
BckdhaP50136 Plcd1-203ENSMUST00000214470 2706 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
BckdhaP50136 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
BckdhaP50136 Cpt2-201ENSMUST00000030345 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
BckdhaP50136 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
BckdhaP50136 Adat1-203ENSMUST00000139820 2762 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
BckdhaP50136 Tle3-204ENSMUST00000159386 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
BckdhaP50136 Brinp1-201ENSMUST00000030036 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
BckdhaP50136 Gm13886-201ENSMUST00000117876 1183 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
BckdhaP50136 Lamtor2-202ENSMUST00000119002 568 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
BckdhaP50136 Rapgef3os2-201ENSMUST00000124374 920 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
BckdhaP50136 Gm11724-201ENSMUST00000125577 472 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
BckdhaP50136 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
BckdhaP50136 Fbxw4-204ENSMUST00000160018 931 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
BckdhaP50136 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
BckdhaP50136 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
BckdhaP50136 Ip6k2-210ENSMUST00000194875 748 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
BckdhaP50136 AC192088.1-201ENSMUST00000227561 301 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
BckdhaP50136 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
BckdhaP50136 Smarcb1-201ENSMUST00000000925 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
BckdhaP50136 Rbak-201ENSMUST00000049861 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
BckdhaP50136 Gm43156-201ENSMUST00000202338 2127 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
BckdhaP50136 Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 2128 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
BckdhaP50136 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
BckdhaP50136 Catsper3-202ENSMUST00000109898 1311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
BckdhaP50136 Acot6-202ENSMUST00000222921 3622 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
BckdhaP50136 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
BckdhaP50136 Disp1-205ENSMUST00000195372 4901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
BckdhaP50136 Lrrc8d-201ENSMUST00000060531 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
BckdhaP50136 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
BckdhaP50136 Lnx1-205ENSMUST00000117525 2259 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
BckdhaP50136 Stxbp1-202ENSMUST00000077458 3616 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
BckdhaP50136 Phka1-206ENSMUST00000122022 6115 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
BckdhaP50136 Phka1-202ENSMUST00000052012 6115 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
BckdhaP50136 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
BckdhaP50136 Nfkb1-206ENSMUST00000164430 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
BckdhaP50136 Setd1b-206ENSMUST00000174836 7515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
BckdhaP50136 Gnb2-202ENSMUST00000111020 1470 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
BckdhaP50136 Gm5779-202ENSMUST00000219564 1477 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
BckdhaP50136 AC154527.2-201ENSMUST00000225256 1466 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
BckdhaP50136 Nbeal2-206ENSMUST00000133191 8782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
BckdhaP50136 Mob3c-201ENSMUST00000030477 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
BckdhaP50136 9130011E15Rik-201ENSMUST00000045396 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
BckdhaP50136 Gm12859-201ENSMUST00000117834 427 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
BckdhaP50136 Gnb2-209ENSMUST00000143495 1285 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
BckdhaP50136 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
BckdhaP50136 Ccdc159-204ENSMUST00000216710 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
BckdhaP50136 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
BckdhaP50136 AC154687.2-201ENSMUST00000223853 640 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
BckdhaP50136 Amotl2-201ENSMUST00000035121 4328 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
BckdhaP50136 Syngap1-201ENSMUST00000081285 4315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
BckdhaP50136 Cacna1b-205ENSMUST00000114447 6987 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
BckdhaP50136 Zic4-209ENSMUST00000173933 1764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
BckdhaP50136 AC154262.2-201ENSMUST00000224310 2293 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
BckdhaP50136 Exoc6b-203ENSMUST00000160197 5439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
BckdhaP50136 4632404H12Rik-201ENSMUST00000038450 2791 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
BckdhaP50136 Arhgef4-201ENSMUST00000047664 3287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
BckdhaP50136 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
BckdhaP50136 Arhgap33-203ENSMUST00000207858 4337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
BckdhaP50136 Gm21038-201ENSMUST00000222205 1383 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
BckdhaP50136 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
BckdhaP50136 Cox10-201ENSMUST00000049091 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
BckdhaP50136 Psmd2-201ENSMUST00000007212 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
BckdhaP50136 G6pc3-201ENSMUST00000070334 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
BckdhaP50136 Smim14-205ENSMUST00000139122 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
BckdhaP50136 Zfp618-203ENSMUST00000107415 8826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
BckdhaP50136 Fam20a-201ENSMUST00000020938 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
BckdhaP50136 Actn4-201ENSMUST00000068045 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
BckdhaP50136 Prg4-207ENSMUST00000162367 1480 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
BckdhaP50136 Hmx2-201ENSMUST00000051997 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
BckdhaP50136 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
BckdhaP50136 Srsf1-205ENSMUST00000139129 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
BckdhaP50136 Adarb1-201ENSMUST00000020496 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
BckdhaP50136 Eif3j1-201ENSMUST00000028668 5413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
BckdhaP50136 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
BckdhaP50136 Tmem176b-201ENSMUST00000101429 1238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
BckdhaP50136 Gm12537-201ENSMUST00000119266 1002 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
BckdhaP50136 Gm12070-201ENSMUST00000119551 1002 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
BckdhaP50136 Gm12671-201ENSMUST00000119978 1002 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
BckdhaP50136 Gm13292-201ENSMUST00000120014 1000 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
BckdhaP50136 Gm12403-201ENSMUST00000121384 959 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
BckdhaP50136 Gldnos-201ENSMUST00000149237 841 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
BckdhaP50136 Gm12840-201ENSMUST00000156081 627 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
BckdhaP50136 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
BckdhaP50136 Gm10359-201ENSMUST00000180167 1002 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
BckdhaP50136 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
BckdhaP50136 Gm12033-201ENSMUST00000180654 1002 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
BckdhaP50136 Gm5559-201ENSMUST00000180755 1002 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
BckdhaP50136 Gm4335-201ENSMUST00000182581 1004 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
BckdhaP50136 1700030C10Rik-202ENSMUST00000186243 126 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
BckdhaP50136 Gm29417-201ENSMUST00000188160 571 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
BckdhaP50136 Fcrl1-204ENSMUST00000191666 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
BckdhaP50136 Gm38144-201ENSMUST00000192790 465 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
BckdhaP50136 1810059H22Rik-208ENSMUST00000204941 642 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
BckdhaP50136 Bpnt1-205ENSMUST00000210277 1226 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
BckdhaP50136 Gm17870-201ENSMUST00000219489 1174 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
BckdhaP50136 Tex13c3-201ENSMUST00000089246 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
BckdhaP50136 Hoxd3-202ENSMUST00000111982 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
BckdhaP50136 Rev3l-201ENSMUST00000019986 10713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.5 ms