Protein–RNA interactions for Protein: P49813

Tmod1, Tropomodulin-1, mousemouse

Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmod1P49813 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Tmod1P49813 Kdm2b-204ENSMUST00000118027 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Tmod1P49813 Fam71f1-204ENSMUST00000166462 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Tmod1P49813 Gm8337-201ENSMUST00000187358 1938 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Tmod1P49813 Gsg1l-201ENSMUST00000073935 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Tmod1P49813 Dnaaf1-201ENSMUST00000093100 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Tmod1P49813 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Tmod1P49813 C130050O18Rik-201ENSMUST00000052176 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Tmod1P49813 Vangl1-201ENSMUST00000029453 6531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Tmod1P49813 Gnai1-201ENSMUST00000074694 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Tmod1P49813 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Tmod1P49813 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Tmod1P49813 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Tmod1P49813 2900005J15Rik-202ENSMUST00000171190 2025 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Tmod1P49813 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Tmod1P49813 Sox17-206ENSMUST00000192650 3242 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Tmod1P49813 Gspt1-205ENSMUST00000167571 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Tmod1P49813 BC006965-201ENSMUST00000124028 1952 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Tmod1P49813 Cd63-202ENSMUST00000105229 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Tmod1P49813 Ccdc169-203ENSMUST00000118963 740 ntTSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Tmod1P49813 Calhm3-201ENSMUST00000178630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Tmod1P49813 Gm27839-201ENSMUST00000184242 106 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Tmod1P49813 Gm5276-201ENSMUST00000196683 1047 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Tmod1P49813 Sox2ot-216ENSMUST00000200092 767 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Tmod1P49813 Gm20219-201ENSMUST00000209718 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Tmod1P49813 Cd63-204ENSMUST00000219317 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Tmod1P49813 Gm867-202ENSMUST00000219979 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Tmod1P49813 Ccdc169-202ENSMUST00000061099 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Tmod1P49813 Plpp4-201ENSMUST00000094018 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Tmod1P49813 Nfe2-207ENSMUST00000134554 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Tmod1P49813 Rtn4-205ENSMUST00000102843 4618 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Tmod1P49813 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Tmod1P49813 Hnrnpa1-201ENSMUST00000036004 1918 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Tmod1P49813 Ace-202ENSMUST00000001964 2418 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Tmod1P49813 1700065D16Rik-205ENSMUST00000190890 2903 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Tmod1P49813 Pltp-203ENSMUST00000109317 1575 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Tmod1P49813 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Tmod1P49813 Zbtb5-202ENSMUST00000107817 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Tmod1P49813 Gm2420-202ENSMUST00000202224 2249 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Tmod1P49813 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Tmod1P49813 Ildr2-201ENSMUST00000111416 8251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Tmod1P49813 Dlg4-204ENSMUST00000108589 3271 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Tmod1P49813 BC051537-201ENSMUST00000183290 1668 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Tmod1P49813 Gm4858-202ENSMUST00000194595 1810 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Tmod1P49813 Hid1-201ENSMUST00000044152 3236 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Tmod1P49813 Hsph1-201ENSMUST00000074846 3240 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Tmod1P49813 Gm5639-201ENSMUST00000122305 2403 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Tmod1P49813 Gm8775-201ENSMUST00000170943 1327 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Tmod1P49813 Haus8-202ENSMUST00000110071 1452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Tmod1P49813 AC121805.2-201ENSMUST00000218808 2538 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Tmod1P49813 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Tmod1P49813 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Tmod1P49813 Prss45-201ENSMUST00000011391 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Tmod1P49813 Gm11592-201ENSMUST00000133160 637 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Tmod1P49813 1700061E18Rik-201ENSMUST00000154159 588 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Tmod1P49813 Hk2-204ENSMUST00000170833 2792 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Tmod1P49813 Gm20753-201ENSMUST00000190105 545 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Tmod1P49813 Prmt2-201ENSMUST00000020452 2016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Tmod1P49813 Mrps17-201ENSMUST00000042191 832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Tmod1P49813 Rhox2e-201ENSMUST00000072167 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Tmod1P49813 Camkmt-201ENSMUST00000095188 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Tmod1P49813 Olfr1214-201ENSMUST00000099804 936 ntAPPRIS P1 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Tmod1P49813 Palld-203ENSMUST00000121493 5445 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Tmod1P49813 Gnas-204ENSMUST00000087877 3947 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Tmod1P49813 Qsox1-202ENSMUST00000111764 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Tmod1P49813 Myt1l-204ENSMUST00000218198 2735 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Tmod1P49813 Camk2d-206ENSMUST00000106402 4180 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Tmod1P49813 Gm15816-201ENSMUST00000141930 1688 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Tmod1P49813 Slc25a54-201ENSMUST00000029478 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Tmod1P49813 Zfp354c-201ENSMUST00000000632 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Tmod1P49813 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Tmod1P49813 Setd1b-204ENSMUST00000163030 8857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
Tmod1P49813 Lrrc56-202ENSMUST00000070458 2502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Tmod1P49813 Pak4-201ENSMUST00000032823 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Tmod1P49813 Nbeal2-210ENSMUST00000167320 8803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tmod1P49813 Gm5779-202ENSMUST00000219564 1477 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tmod1P49813 Gsdma3-201ENSMUST00000073295 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tmod1P49813 Ccdc134-201ENSMUST00000089174 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tmod1P49813 Olfr61-202ENSMUST00000210241 1348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tmod1P49813 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tmod1P49813 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tmod1P49813 Dda1-206ENSMUST00000138892 1738 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tmod1P49813 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tmod1P49813 Lrfn2-201ENSMUST00000046254 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tmod1P49813 Gm9946-202ENSMUST00000162741 1580 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tmod1P49813 Tbc1d4-209ENSMUST00000161991 6483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tmod1P49813 Gm10371-201ENSMUST00000127429 1411 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tmod1P49813 Mief1-201ENSMUST00000023048 5081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tmod1P49813 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tmod1P49813 AL645783.1-201ENSMUST00000221416 1832 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Tmod1P49813 Gm11814-201ENSMUST00000119515 929 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Tmod1P49813 Ndufaf2-201ENSMUST00000163558 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tmod1P49813 Synj2bp-205ENSMUST00000169158 691 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tmod1P49813 Neat1-203ENSMUST00000174829 1030 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tmod1P49813 1700037F24Rik-201ENSMUST00000181254 973 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tmod1P49813 Gm7067-201ENSMUST00000207698 1249 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Tmod1P49813 Rdh5-201ENSMUST00000026406 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tmod1P49813 Gm26559-201ENSMUST00000181939 2481 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tmod1P49813 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tmod1P49813 Ctsk-201ENSMUST00000015664 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.3 ms