Protein–RNA interactions for Protein: P47242

Pax9, Paired box protein Pax-9, mousemouse

Predictions only

Length 342 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pax9P47242 Cant1-203ENSMUST00000106287 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Pax9P47242 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Pax9P47242 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Pax9P47242 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Pax9P47242 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Pax9P47242 Mpi-201ENSMUST00000034856 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Pax9P47242 Tmc6-201ENSMUST00000026659 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Pax9P47242 Zbtb4-202ENSMUST00000108639 7811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Pax9P47242 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Pax9P47242 Btrc-202ENSMUST00000111936 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Pax9P47242 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Pax9P47242 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Pax9P47242 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Pax9P47242 Ube4bos1-202ENSMUST00000151896 1286 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Pax9P47242 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Pax9P47242 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Pax9P47242 Ube2i-205ENSMUST00000172587 508 ntTSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Pax9P47242 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Pax9P47242 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Pax9P47242 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
Pax9P47242 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
Pax9P47242 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
Pax9P47242 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
Pax9P47242 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Pax9P47242 0610005C13Rik-202ENSMUST00000209510 671 ntTSL 3 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Pax9P47242 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Pax9P47242 Pym1-203ENSMUST00000218218 1143 ntTSL 3 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Pax9P47242 Tssc1-207ENSMUST00000222407 489 ntTSL 3 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Pax9P47242 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Pax9P47242 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Pax9P47242 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Pax9P47242 Tfap2c-202ENSMUST00000099058 2985 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Pax9P47242 Naa40-201ENSMUST00000025675 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Pax9P47242 Ucp3-201ENSMUST00000032958 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Pax9P47242 Igf2os-203ENSMUST00000141681 4778 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Pax9P47242 C130026L21Rik-201ENSMUST00000064930 2472 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Pax9P47242 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Pax9P47242 Olfr61-202ENSMUST00000210241 1348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Pax9P47242 Zfp207-201ENSMUST00000017567 2245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Pax9P47242 Sema4a-213ENSMUST00000165898 3125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Pax9P47242 Gspt1-205ENSMUST00000167571 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Pax9P47242 Phldb1-210ENSMUST00000134465 5244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Pax9P47242 Atp9a-204ENSMUST00000109177 3456 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Pax9P47242 Prkce-201ENSMUST00000097274 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Pax9P47242 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Pax9P47242 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Pax9P47242 Pdlim7-201ENSMUST00000046246 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Pax9P47242 Uimc1-202ENSMUST00000099496 1678 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Pax9P47242 Kcnq2-208ENSMUST00000103051 4200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Pax9P47242 Rab39-201ENSMUST00000068449 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Pax9P47242 Arrdc4-201ENSMUST00000048068 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Pax9P47242 Diaph2-207ENSMUST00000167619 8439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Pax9P47242 Dnmt3b-205ENSMUST00000103150 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Pax9P47242 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Pax9P47242 C1qtnf1-202ENSMUST00000106286 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Pax9P47242 C1qtnf1-201ENSMUST00000017590 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Pax9P47242 Actn4-201ENSMUST00000068045 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Pax9P47242 Tmem131l-202ENSMUST00000191758 5555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Pax9P47242 Klhl15-201ENSMUST00000096369 3944 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Pax9P47242 D6Ertd527e-203ENSMUST00000203747 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Pax9P47242 B230369F24Rik-201ENSMUST00000141846 2560 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Pax9P47242 Ptn-202ENSMUST00000201321 2558 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Pax9P47242 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Pax9P47242 Mief1-201ENSMUST00000023048 5081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Pax9P47242 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Pax9P47242 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Pax9P47242 Galnt6-201ENSMUST00000052069 3798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Pax9P47242 Gtse1-201ENSMUST00000170629 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Pax9P47242 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Pax9P47242 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Pax9P47242 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Pax9P47242 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Pax9P47242 Gm15948-201ENSMUST00000150616 403 ntTSL 3 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Pax9P47242 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Pax9P47242 Bik-201ENSMUST00000016902 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Pax9P47242 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Pax9P47242 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Pax9P47242 Gm30906-201ENSMUST00000219578 535 ntTSL 3 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Pax9P47242 Taldo1-201ENSMUST00000026576 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Pax9P47242 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Pax9P47242 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Pax9P47242 Gm44401-201ENSMUST00000204462 2375 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Pax9P47242 Ralgds-202ENSMUST00000100241 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Pax9P47242 AC137842.1-201ENSMUST00000227896 2064 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Pax9P47242 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Pax9P47242 Mb21d1-201ENSMUST00000034898 3231 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Pax9P47242 Mrps30-201ENSMUST00000022245 3319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Pax9P47242 Eif4e2-206ENSMUST00000113233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Pax9P47242 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Pax9P47242 Pde9a-203ENSMUST00000127929 1891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Pax9P47242 Ccdc162-208ENSMUST00000179614 2739 ntTSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Pax9P47242 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Pax9P47242 Gm26651-201ENSMUST00000181851 2325 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Pax9P47242 1700128E19Rik-201ENSMUST00000134409 2439 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Pax9P47242 Enpp5-203ENSMUST00000154166 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Pax9P47242 Gm38355-201ENSMUST00000192514 1570 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Pax9P47242 Eln-201ENSMUST00000015138 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Pax9P47242 Mier3-203ENSMUST00000109272 5279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Pax9P47242 Bud13-201ENSMUST00000074957 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Pax9P47242 Laptm5-207ENSMUST00000151698 2600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39 ms