Protein–RNA interactions for Protein: P32958

Rom1, Rod outer segment membrane protein 1, mousemouse

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Length 351 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rom1P32958 Snrk-203ENSMUST00000120173 4758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rom1P32958 Kbtbd6-201ENSMUST00000100359 2982 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rom1P32958 Kifc1-204ENSMUST00000173492 2350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rom1P32958 Ankrd61-203ENSMUST00000110718 1774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rom1P32958 Sfpq-201ENSMUST00000030623 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rom1P32958 Aoc2-202ENSMUST00000107264 2230 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rom1P32958 Vmn1r65-201ENSMUST00000086338 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rom1P32958 Cdc45-201ENSMUST00000000028 2143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rom1P32958 Ppp1r18-205ENSMUST00000187690 3185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rom1P32958 Prkce-201ENSMUST00000097274 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rom1P32958 Pcnx2-201ENSMUST00000047239 7236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rom1P32958 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rom1P32958 Grid1-201ENSMUST00000043349 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rom1P32958 Olfr1234-202ENSMUST00000111543 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rom1P32958 Gm14703-201ENSMUST00000145894 1820 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rom1P32958 Rbp3-201ENSMUST00000035695 5295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rom1P32958 Epha5-202ENSMUST00000113398 4830 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rom1P32958 Rcbtb2-202ENSMUST00000110952 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rom1P32958 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rom1P32958 Gm42829-201ENSMUST00000198417 2585 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Rom1P32958 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rom1P32958 Oaz2-ps-201ENSMUST00000121735 537 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Rom1P32958 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rom1P32958 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Rom1P32958 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Rom1P32958 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rom1P32958 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rom1P32958 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rom1P32958 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rom1P32958 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rom1P32958 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rom1P32958 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rom1P32958 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rom1P32958 H3f3b-202ENSMUST00000106454 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rom1P32958 Acin1-221ENSMUST00000150371 2494 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rom1P32958 Cox19-201ENSMUST00000049630 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rom1P32958 Fam171a1-201ENSMUST00000062934 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rom1P32958 Armcx1-205ENSMUST00000113199 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rom1P32958 Nectin4-202ENSMUST00000094325 3245 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rom1P32958 Otub2-201ENSMUST00000021620 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rom1P32958 Mfap3l-202ENSMUST00000160719 6335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rom1P32958 Pnpla6-211ENSMUST00000207941 4263 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rom1P32958 Plxna1-201ENSMUST00000049845 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rom1P32958 Gm45332-201ENSMUST00000210508 1949 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rom1P32958 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rom1P32958 Ywhab-201ENSMUST00000018470 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rom1P32958 Gm14379-201ENSMUST00000128858 1878 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rom1P32958 Laptm5-207ENSMUST00000151698 2600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rom1P32958 Nfatc2ip-201ENSMUST00000075671 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rom1P32958 Npr1-201ENSMUST00000029540 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rom1P32958 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rom1P32958 Leng8-203ENSMUST00000121270 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rom1P32958 Dcun1d3-201ENSMUST00000059851 5985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rom1P32958 Clcn3-201ENSMUST00000004430 4175 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rom1P32958 Aco1-201ENSMUST00000102973 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rom1P32958 Sema4a-213ENSMUST00000165898 3125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rom1P32958 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rom1P32958 Tyk2-206ENSMUST00000216874 4828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rom1P32958 Lcmt1-201ENSMUST00000033025 1369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rom1P32958 Gm44851-201ENSMUST00000205735 2309 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Rom1P32958 BC048403-202ENSMUST00000136432 2968 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rom1P32958 Espn-213ENSMUST00000105659 3595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rom1P32958 Gm13288-201ENSMUST00000094977 2850 ntAPPRIS P1 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rom1P32958 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rom1P32958 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rom1P32958 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rom1P32958 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rom1P32958 Prss54-202ENSMUST00000180075 1152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rom1P32958 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rom1P32958 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rom1P32958 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Rom1P32958 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rom1P32958 4930432H08Rik-201ENSMUST00000198220 1284 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rom1P32958 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rom1P32958 AC131997.1-201ENSMUST00000228611 1229 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Rom1P32958 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rom1P32958 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rom1P32958 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rom1P32958 Pfn4-204ENSMUST00000219503 4775 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rom1P32958 Pcnx3-202ENSMUST00000113615 7264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rom1P32958 Prrc2b-202ENSMUST00000069817 10671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rom1P32958 Pde9a-203ENSMUST00000127929 1891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rom1P32958 Xlr-202ENSMUST00000067782 1860 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rom1P32958 Atp8a1-202ENSMUST00000072971 7154 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rom1P32958 Vash2-201ENSMUST00000047409 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rom1P32958 Itpr3-201ENSMUST00000049308 8990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rom1P32958 Ankmy2-201ENSMUST00000041640 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rom1P32958 Tcf4-258ENSMUST00000202937 2103 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rom1P32958 Cdc37l1-207ENSMUST00000225210 4163 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rom1P32958 Asphd2-201ENSMUST00000031291 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rom1P32958 Tmed9-203ENSMUST00000224741 1450 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Rom1P32958 Acacb-201ENSMUST00000031583 8482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rom1P32958 Nol4-206ENSMUST00000164186 2622 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rom1P32958 Gad1-205ENSMUST00000130998 1705 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rom1P32958 AC151895.1-201ENSMUST00000219025 1742 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Rom1P32958 Gm7049-201ENSMUST00000223520 1712 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Rom1P32958 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rom1P32958 Aldh9a1-201ENSMUST00000028004 2835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rom1P32958 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rom1P32958 Serpinb12-201ENSMUST00000081277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
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